CRISPR文库筛选技术应用指南「第一章」:CRISPR文库基础知识
CRISPR文库技术是CRISPR/Cas系统的高通量应用。CRISPR文库技术始于2012年Doudna和Charpentier的Cas9-sgRNA突破(Jinek et al., 2012)。2014年,Shalem等人开发GeCKO文库,覆盖18,08
CRISPR文库技术是CRISPR/Cas系统的高通量应用。CRISPR文库技术始于2012年Doudna和Charpentier的Cas9-sgRNA突破(Jinek et al., 2012)。2014年,Shalem等人开发GeCKO文库,覆盖18,08
传统的CRISPR筛选技术(如Perturb-seq)结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够分析基因扰动后的转录组变化,但缺乏空间信息,无法解析细胞微环境对基因表达的影响。而光学池筛选(如MERFISH,多重荧光原位杂交技术)虽能提供高分辨率空间转录组
Cas9(CRISPR相关蛋白9)是一种由RNA引导的DNA内切酶。这种酶与CRISPR(成簇规律间隔短回文重复序列)适应性免疫系统相关,存在于多种细菌中,包括化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes)。Cas9能够解开外来DNA(如质粒DN
一项近日发表在Cell的文章就报道了一种新方法-Perturb-FISH,基于成像的策略实现了单细胞空间转录组(MERFISH[2])和CRISPR guide RNA(T7启动子驱动的gRNA扩增[3])的同时解析[1]。
利用 CRISPR-Cas 系统进行基因组编辑,是治疗遗传疾病的有前景的途径。2023年底,美国 FDA 批准了首款CRISPR 基因编辑疗法上市,此外,还有许多基于 CRISPR 的基因编辑疗法正在临床试验中,用于治疗多种遗传疾病,包括视网膜营养不良、血友病
番茄( Solanum lycopersicum ),作为全球广泛种植的重要经济作物及生物学研究的经典模式植物,不仅因其丰富的营养价值深受消费者喜爱,更因其在遗传学、分子生物学研究中的独特地位而备受科学家青睐。随着生命科学技术的飞速发展,特别是基因编辑技术的崛
CRISPR/Cas系统是细菌获得性免疫的重要组成部分,由Cas核酸酶和两种单独的RNA成分组成,即可编程crRNA(CRISPR RNA)和固定的TracRNA(反式激活crRNA)。
当下,CRISPR文库作为基于CRISPR/Cas9技术构建的高通量基因筛选利器,助力众多研究获得突破性进展,高分文章更是频出。不少科研er想要应用CRISPR文库在自己的研究中,但是还停留在了解阶段,不知道该如何制定合理的筛选策略?
在植物基因功能研究中,反向植物遗传学是经典的研究思路之一,通常从一个基因入手,通过过表达、干扰或基因编辑等手段调节一个或多个基因的表达水平,观察对应的表型变化,从而对相关基因进行一系列的分子功能研究。