Nature报道：谷歌新模型1秒读懂DNA变异！首次统一基因组全任务
模型架构受U-Net启发，可以将1兆碱基的DNA输入序列，在下采样阶段处理为两种类型的序列表达，分别是对应线性基因组的一维嵌入（1bp和128bp分辨率），和对应基因组片段空间相互作用的二维嵌入（2048bp分辨率）。
基因组
五天破解身体密码，他们从30亿个碱基对中提炼出“中国方案”｜寻访福田“小巨人”
“人工智能时代，生命也可以进行数字化。”微基因创始人兼CEO陈钢如是说道。人体基因组包含大约30亿个碱基对，约2万至2.5万个基因，每个基因都有其特定的位置，构成人体的“身体密码”。
学者完成三种药用甘草的高质量参考基因组
近日，中国科学院华南植物园研究员王瑛团队联合海南大学教授夏志强团队，在广东省自然科学基金面上项目等的资助下，完成了三种药用甘草的高质量参考基因组，助力甘草的遗传育种。相关成果发表于《植物杂志》（The Plant journal）。
小麦族作物基因组生物学的里程碑与未来展望
小麦族（Triticeae）是禾本科（Poaceae）早熟禾亚科下的一个重要族，包含了小麦、大麦、黑麦等多种主要谷类作物及其野生近缘种。作为新石器时代农业革命的奠基作物，小麦和大麦至今仍是全球温带地区最重要的主粮和饲料来源。然而，与水稻、玉米等模式作物相比，小
颠覆“中国起源说”：基因组研究证实赤小豆栽培发祥于日本
农业食品产业技术综合研究机构（位于茨城県筑波市）与台湾大学的研究团队通过基因组分析证实，制作红豆饭与和果子馅料不可或缺的赤小豆，其栽培起源可追溯至日本绳文时代。这项研究推翻了“赤小豆与水稻、麦类同样是在弥生时代从中国大陆传入”的传统观点，相关论文已发表于美国《
Nature丨天然核小体自带指导三维基因组组装的信息
细胞核基因组主要分为两大区域：基因丰富且相对开放的常染色质，以及基因稀少且相对致密的异染色质。随着Hi-C染色质构象捕获和染色质追踪等技术的出现，基因组的复杂层级组织结构正逐渐被揭示。每条染色体在细胞核内占据独立区域，其基因组可以人为划分为两个区室结构——A/
Nature Methods | 长读长测序“去伪存真”：SAVANA如何颠覆癌症基因组分析的传统认知？
癌细胞并非静止不变，它们的基因组在不断上演着一场场惊心动魄的“结构变形记”？这些被称为体细胞结构变异（somatic structural variants, SVs）和体细胞拷贝数变异（somatic copy number aberrations, SCN
Nature Genetics丨人类原发性癌症的三维基因组图谱
在每个人体细胞中， 2 m 的 DNA 广泛折叠在 ~10 µm 的细胞核内。真核基因组在三维空间中按层次组织，以便通过远端顺式调控元件进行转录调控。染色体细分为多兆碱基 （ Mb ） A 和 B 区室，它们以同型方式相互作用，分别富含 常 染色质和异染色质。
癌症 基因组图谱 基因组 ge naturegenetics 2025-06-02 08:41 4
肖军研究组开发三维基因组新技术并揭示TaSPL7&15介导染色质互作调控光合作用的机制
染色质的空间组织结构是维持基因组稳定性、实现基因表达精准调控关键环节。在植物中，已有诸多参与调控关键农艺性状的远程调控元件被鉴定。然而，现有三维染色质构象捕获技术（如Hi-C, ChIA-PET, HiChiP和OCEAN-C等）仍难以在低成本条件下无偏好性地
古基因组研究揭示青藏高原人群“幽灵祖先”之谜
30日，《科学》杂志在线发表了一项关于东亚和东南亚族群探源的突破性研究成果。来自中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、云南省文物考古研究所等单位的科研人员，利用古DNA技术开启了一趟寻根之旅，历经9年艰辛探索，成功破解了青藏高原人群“幽灵祖先”之谜，并首次揭示南
黑箱渐开：表观基因组如何绘制胚胎发育蓝图
从精卵结合那一刻起，一个微小的单细胞合子（zygote），是如何被赋予了创造万物的无限潜能，又如何在最初的几天内，一步步精准地搭建起复杂生命的蓝图，最终孕育出我们自身？
Nature Genetics丨全基因组关联分析揭示强迫症的30个风险基因位点
强迫症（Obsessive-Compulsive Disorder, OCD）是一种常见的精神障碍，全球约1%-3%的人口受其影响。患者会经历反复出现的强迫思维和强迫行为，严重影响生活质量，甚至增加自杀风险。尽管环境因素（如压力或创伤）可能诱发OCD，但研究表
强迫症 基因组 naturegenetics 基 基因组关联 2025-05-26 19:44 6
浙江大学培训班 | 类器官药物筛选及全景3D成像技术应用&“基因组科学”
器官药物筛选及全景3D 成像技术在生命科学、医学研究及药物研发等领域具有至关重要的作用。器官药物筛选技术有助于快速、精准地发现针对特定疾病的有效药物，降低研发成本和周期；全景 3D 成像技术则能够提供生物组织和器官的高分辨率三维结构信息，为疾病诊断、治疗方案制
揭秘 DNA 损伤应答合成致死：解锁基因组奥秘，开辟癌症治疗新路径
在细胞的微观世界里，DNA 时刻面临着各种威胁，而 DNA 损伤应答（DNA damage response，DDR）就像是细胞的 “守护者联盟”，负责保护基因组的稳定性。然而，这个 “联盟” 内部的众多通路之间是如何协同工作的，一直是个未解之谜。而且，由于
里程碑式壮举！《Nature》多国测定6种猿类完整基因组
研究结果发表在《Nature》杂志上，由来自多个国家的123名研究人员组成的研究小组预计将有助于类人猿的保护工作，并促进科学家对人类与其他类人猿的不同之处的理解。
Perturb-tracing 技术：解锁 3D 基因组调控因子筛选新密码
为解决 3D 基因组染色质拓扑结构调控因子研究受限，缺乏高效筛选技术的问题，研究人员开展了名为 Perturb-tracing 的技术研究。他们发现众多新调控因子，研究成果发表在《Nature Methods》上明确其多尺度作用及与已知机制关联，还揭示染色质压
解锁 naturemethods 基因组 tad 染色质 2025-05-25 10:51 6
3 万宏基因组研究解释人体肠道与地域、健康与遗传结构的深度关联
为探究肠道微生物种内遗传变异与宿主健康的关系，研究人员分析 32152 个全球样本的宏基因组。发现菌株地理分层与水平传播有关，微生物系统发育与多种人类表型相关。这有助于理解肠道微生物对健康的影响。
Nature：单个核小体如何塑造3D基因组结构
为探究单个核小体是否蕴含3D基因组结构信息，研究人员开展相关研究。他们发现核小体的凝聚性与基因表达及A/B区室化紧密相关，这一成果为了解基因组结构形成提供关键线索，有助于深入研究细胞分化、疾病发生等过程。
南京大学联合南京农大开发基于719个植物基因组的比较系统发育基因组学综合数据库
近日，Plant Biotechnology Journal杂志在线发表了由南京大学陈迪俊团队、邵珠卿团队以及南京农业大学薛佳宇团队合作撰写的研究论文，题为“PGCP: A comprehensive database of plant genomes for
中国水产科学研究院黄海所破译鳀染色体水平基因组
近日，中国水产科学研究院黄海水产研究所海洋渔业资源分子生态学研究团队成功破译了鳀（Engraulis japonicus）染色体水平基因组，成果以“Chromosome-level genome assembly and annotation of Japan