基因科技守护泰国海岸线

摘要:在全球的红树林分布中,拥有着绵长海岸线的泰国扮演着重要的角色。泰国红树林的总面积约为27.2万公顷,是东南亚地区红树林生长的重要区域之一。由于海平面上升及人类活动的影响,泰国近60%的红树林遭到了破坏,红树林的减少导致当地生态环境变得更加脆弱,保护工作迫在眉睫

“如果没有红树林,我们当地渔民的生活会很艰难。”

“泰国超过60%的红树林已经消失殆尽。”

“我们已为泰国15个红树林物种建立参考基因组数据库。通过了解红树林物种的DNA数据,可以准确评估红树林的遗传多样性。”

“华大智造测序平台提供了高质量数据,减少了研究中的不确定性,让我们能够专注于获取生物多样性研究成果。”

红树林是自然界的“海岸守护者”。

它能够有效抵御海浪侵蚀和风暴潮的侵袭,为海洋生物提供宝贵的栖息地,维护生物多样性的繁荣,是地球上不可或缺的碳储存库。

泰国红树林,摄自泰国曼谷挽坤天县

在全球的红树林分布中,拥有着绵长海岸线的泰国扮演着重要的角色。泰国红树林的总面积约为27.2万公顷,是东南亚地区红树林生长的重要区域之一。由于海平面上升及人类活动的影响,泰国近60%的红树林遭到了破坏,红树林的减少导致当地生态环境变得更加脆弱,保护工作迫在眉睫。

一位生活在泰国南部挽天昆县的渔民表示,红树林保护沿海社区免受海浪的侵袭,并为小鱼和螃蟹等水产动物提供了培育基地,他们的日常生活离不开红树林。

应对生态环境挑战是全人类的共同课题,泰国也在积极与其他国家和国际组织合作,共同探讨红树林保护新模式,如建立中泰红树林共同保护示范区就是一个典型案例。据新华社泰国报道,在11月20-21日,中泰红树林生态保护系列活动在泰国攀牙府举办,中泰双方代表在泰国攀牙湾国家公园为中泰红树林共同保护示范区揭牌,标志着双方在红树林保护方面的共同努力和担当。

DNBSEQ-G400RS在泰国基因组学中心

2025年,中泰建交即将迎来50周年。在中泰双方加强红树林生态保护合作之际,隶属泰国国家科学技术发展署(NSTDA)的泰国国家遗传工程与生物技术中心(BIOTEC)携手华大智造,由BIOTEC旗下的泰国国家基因组学中心(National Omics Center)的专家团队,基于华大智造测序平台,运用基因技术寻找红树林保护的新路径,守护泰国海岸线。

了解遗传多样性,评估红树林种群间的遗传变异

制定有效红树林保护策略的第一步是深入了解红树林的遗传多样性。通过读取红树林的基因数据,泰国国家遗传工程与生物技术中心(BIOTEC)下的国家基因组学中心研究人员能够了解红树林是如何应对海平面上升、盐度变化和栖息地丧失等环境变化带来的多重挑战。借助测序技术,研究人员首次实现了精准评估并深入探究红树林物种的遗传多样性,标志着红树林保护研究上的重大突破。

泰国国家基因组学中心的高级研究员Jeremy Shearman博士强调了解红树林物种遗传多样性的重要意义:“为了保护这些宝贵的生态系统,了解红树林的遗传多样性是非常有必要的。如果一个物种的遗传多样性水平过低,这个物种可能濒临灭绝。”

他进一步解释道:“我们计划对泰国现有的81种红树林进行鉴定,通过进行基因组测序建立红树林物种的基因组参考数据库,并利用限制酶测序技术评估泰国红树林种群间的遗传变异。”

Wirulda Pootakham博士与红树林研究项目成员

成功建立15个红树林物种参考基因组数据库

泰国国家基因组学中心的红树林遗传多样性研究主要依赖于运用了华大智造的简化基因组测序技术(RAD-seq测序技术)。RAD-seq测序技术能够高效识别遗传标记,在参考基因组框架搭建、红树林种群间遗传多样性的深入研究方面发挥了关键作用,相关研究数据对于制定切实有效的红树林保护策略来说也是不可或缺的。作为提供RAD-seq技术的核心平台,华大智造DNBSEQ-G400RS(即MGISEQ-2000RS)测序仪,在构建红树林参考基因组数据库和评估其遗传多样性方面,提供了不可或缺的技术支撑。

泰国国家基因组学中心主任Wirulda Pootakham博士表示:“迄今为止,我们已为泰国15个红树林物种建立参考基因组数据库。通过了解红树林物种的DNA数据,我们可以准确地评估红树林的遗传多样性,这为我们确定保护红树林物种的优先级提供了极大帮助。”

华大智造的测序技术的高精准度技术优势也在红树林研究中发挥了不可忽视的作用。泰国国家基因组学中心研究助理Sonica U-thoomporn女士表示:“华大智造的测序平台为我们提供了高质量的SNP数据,减少了我们研究中的不确定性,使我们能够专注于获取那些重要的生物多样性研究成果。”

华大智造泰国销售经理Nitinai Sising补充道:“华大智造独有的专利DNBSEQ™测序技术具有测序精确度高的技术优势,这对于生物多样性研究、分析和保护至关重要。”

除了RAD-seq测序技术,泰国基因组学中心的研究团队还在运用华大智造测序平台进行RNA测序,以探究红树林对高钠环境的基因表达和适应机制,结合现有研究发现为分析红树林生物多样性、恢复力和适应性提供了一个综合视角。

践行可持续发展,助力应对全球生态挑战

在华大智造平台的支持下,泰国基因组学中心的红树林研究不仅揭示了红树林物种间遗传的细微差异,其研究发现也为泰国海洋和沿海资源部制定有效的红树林保护策略提供了理论基础,维持红树林生态系统对沿海社区和国家经济的推动作用。同时,这项研究成果为利用基因组创新来保护生物多样性和增强生态系统韧性提供了良好示范,有助于帮助东南亚地区开展更有效的红树林保护行动。

Wirulda Pootakham博士在采集红树林样本

支持泰国红树林保护行动与华大智造的可持续发展目标一脉相承。一直以来,华大智造致力于支持全球各地的可持续发展行动,以基因科技赋能生态保护和研究项目。2024年,华大智造宣布与印尼国家研究创新署(BRIN)达成合作共识,将携手打造首个海岛联合智慧实验室以推进国际海藻研究中心的海藻研究,赋能海洋生物多样性研究和资源保护工作。

华大智造总裁余德健表示:“我们很自豪能够支持泰国红树林保护这一重要的科研项目。我们将继续利用先进生命科学工具,推进全球可持续发展和环境保护倡议,致力于为解决当前紧迫的挑战提供创新和切实可行的解决方案,实现保护生态、造福人类的美好愿景。”

面对生态环境的挑战,人类是一荣俱荣、一损俱损的命运共同体。华大智造作为生命科技核心工具的缔造者,将始终坚持创新,坚持承担社会责任,提供先进的技术平台及关键技术解决方案,携手社会各界应对环境挑战,推动全球生态环境可持续发展。

来源:体外诊断网

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