摘要:遗传医学中心主管技师张燕、邵芳成功在中科院分区二区Microchemical Journal期刊上发表了题为《Establishment and evaluation of rapid detection of AZFc deletion on Y chrom
遗传医学中心主管技师张燕、邵芳成功在中科院分区二区Microchemical Journal期刊上发表了题为《Establishment and evaluation of rapid detection of AZFc deletion on Y chromosome based on multienzyme isothermal rapid amplification》的文章,影响因子4.9。
Microchemical Journal
研究成果
Y染色体微缺失是导致男性不育的重要遗传学因素,无精子症因子(Azoospermia factor,AZF)位于Y染色体长臂上,分为AZFa、AZFb、AZFc三个区域,其中AZFc区的缺失率最高,该区缺失的患者其精子质量从无到正常,且精子数量会随着年龄的增长呈进行性下降趋势。
临床上针对Y染色体微缺失的检测方法主要有多重实时荧光PCR(Real-time fluorescent quantitative PCR,RT-qPCR)法和多重连接依赖探针扩增技术(Multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA),这两种方法由于检测环境要求高及检测耗时长的限制,使得Y染色体微缺失很难在基层医院开展,导致缺失患者不能得到及时检测。
本研究在多酶恒温快速扩增(Multienzyme isothermal rapid amplification,MIRA)技术的基础上结合实时荧光技术和侧流层析试纸条(Lateral flow dipstick,LFD )技术开发了两种快速检测AZFc区缺失的新方法:三重实时荧光(RT-MIRA)法(实时显示扩增曲线)、三重侧流层析试纸条(MIRA-LFD)法(将扩增产物稀释后加入三重核酸检测试纸条中进行显色,5 ~ 15min内判读结果)。这两种方法只需39℃恒温15 ~ 20 min即可完成扩增,具有灵敏度高、特异性强、可靠、快速、经济等优点,适用于包括基层单位在内的医疗机构使用,方便广大男性及早进行AZFc区检测。
本研究选取了AZFc区的两个检测位点sY254、sY255位点,选取Y染色体短臂上性别决定基因(Sex-determining region of Y chromosome,SRY)作为内对照位点,分别设计各位点的RT-MIRA法和MIRA-LFD法的引物和探针,同时设计各位点的质粒模板序列,通过引物和探针浓度优化分别构建三重RT-MIRA法和三重MIRA-LFD法反应体系。
实验结果:
以质粒为模板,三重RT-MIRA法和三重MIRA-LFD法的检出限分别为10 fg/µL和1 fg/µL。
以商品化多重RT-qPCR试剂盒中的阳性对照为模板,两种新方法和多重RT-qPCR法的最低检出限均为295 pg/µL。
本研究收集了自2018年4月~2023年12月于徐州市妇幼保健院进行Y染色体微缺失检测时剩余的50例自患者外周血中提取的DNA样本,采用本研究开发的两种新方法分别对其进行检测,发现两种新方法的50例临床样本的检测结果与传统方法的检测结果相一致。
下图展示了两种新方法的样本检测结果示意图
文字|遗传医学中心
编辑|李钟彧
审核|索 峰
编审|刘燕敏
来源:徐州市妇幼保健院