17个中国代表性品种基因组发布并上线小麦多组学网站

摘要:今日,17个中国代表性品种染色体水平的高质量基因组在Nature杂志发表。在新疆小麦会上,我们和张老师商量,能否提前把基因组序列放到小麦多组学网站上,在文章上线后,让大家第一时间使用这些基因组。张老师很爽快的答应了,我们也赶在上线之前把序列整理好,放到网站上了

今日,17个中国代表性品种染色体水平的高质量基因组在Nature杂志发表。在新疆小麦会上,我们和张老师商量,能否提前把基因组序列放到小麦多组学网站上,在文章上线后,让大家第一时间使用这些基因组。张老师很爽快的答应了,我们也赶在上线之前把序列整理好,放到网站上了。

目前支持17个基因组的基因组序列、基因序列和蛋白序列的序列获取,blast,引物设计和基因组浏览器四个模块的调取与使用。

1.序列获取(GetSequence)

结果示例如下,支持直接下载序列以及跳转BLAST

2.Blast

3.引物设计

4.基因组浏览器(JBrowse)

(https://www.nature.com/articles/s41586-024-08277-0)

17个基因组资源原始文章链接:

除了基因组资源以外,这篇文章中还贡献了很多其他方面的资源,我们会陆续添加到网站上,敬请期待。

特别提醒,近期blast页面或其它页面若出现结果无法显示的问题,目前还没有定位原因,请使用以下方法试试。

小麦多组学网站blast功能异常的临时解决办法

小麦族多组学网站:

投稿、合作等邮箱:shengweima@icloud.com

来源:芝兰馨逸

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