摘要：大家好，欢迎观看《时空日报》第349期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的Genpilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
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1、单细胞多组学分析揭示了具有复杂核型的急性髓系白血病的动态克隆进化和可靶向表型
Single-cell multiomics analysis reveals dynamic clonal evolution and targetable phenotypes in acute myeloid leukemia with complex karyotype
Nat Genet; IF: 31.700; DOI: 10.1038/s41588-024-01999-x
内容概要：
① 染色体不稳定性是驱动肿瘤内异质性（ITH）的关键因素，对肿瘤的发展起到了重要的推动作用。在一项新的研究中，科学家们结合了结构变异发现、核小体占据特征分析，以及单细胞的转录组和免疫表型变化，对复杂核型急性髓系白血病（CK-AML）中的ITH进行了深入研究。他们观察到CK-AML患者单个细胞内复杂的结构变异格局，这些变异特征包括线性和环状断裂-融合-桥接循环，以及染色质碎裂等。
② 在这项研究中，科学家们进一步确定了CK-AML中的三种克隆演化模式，分别是单克隆、线性和分支多克隆。他们发现，75%的CK-AML患者在初诊或挽救性治疗时都存在多个亚克隆，并且这些亚克隆经常表现出持续的核型重塑。为了更深入地了解这些亚克隆的演化，科学家们利用患者来源的异种移植模型进行了实验，并证明了白血病干细胞（LSC）的克隆演化存在差异。他们进一步剖析了亚克隆特异性的药物反应特征，旨在识别针对LSC的治疗策略，其中包括BCL-xL抑制。
③ 此外，科学家们在配对的患者纵向样本中，揭示了遗传演化和细胞类型可塑性作为CK-AML疾病进展的机制。通过对CK-AML的动态基因组、表型和功能复杂性的深入剖析，他们为表征和靶向驱动疾病的LSC提供了具有临床意义的途径。这些发现不仅有助于我们更好地理解CK-AML的发病机制，也为未来的治疗策略提供了新的思路和方法。
疾病研究：染色体不稳定性, 肿瘤内异质性, CK-AML, 结构变异, 克隆演化模式, 亚克隆, 核型重塑, 白血病干细胞, 药物反应特征, 遗传演化, 细胞类型可塑性，单细胞多组学; Leppä AM, Grimes K, Jeong H, et al.; Division of Stem Cells and Cancer, German Cancer Research Center (DKFZ) and DKFZ-ZMBH Alliance, Heidelberg, Germany.
2、空间转录组学揭示了三阴性乳腺癌的显着异质性，具有潜在的临床意义
Spatial transcriptomics reveals substantial heterogeneity in triple-negative breast cancer with potential clinical implications
Nature Communications; IF: 14.700; DOI: 10.1038/s41467-024-54145-w
内容概要：
① 三阴性乳腺癌（TNBC）在基因组和转录组水平上具有显著的异质性，然而，关于其肿瘤组织和细胞构成的空间信息却相对匮乏。为了填补这一知识空白，研究人员利用空间转录组学技术，对92例TNBC患者的肿瘤组织进行了深入研究。他们希望通过这种方法，能够更全面地了解TNBC的肿瘤结构，包括其微环境。
② 在研究中，研究人员采用了一种综合方法，将组织形态学和空间转录组学相结合，对肿瘤和间质组织的结构和组成进行了深入表征。他们发现，TNBC的肿瘤组织具有复杂的结构和组成，包括不同类型的细胞、血管和淋巴结构等。此外，通过对三级淋巴结构的详细分子表征，研究人员还发现了一个与多种肿瘤类型疾病结局和免疫治疗效果密切相关的基因特征。
③ 通过逐步聚类分析，研究人员确定了九个TNBC空间原型，这些原型在外部数据集中得到了进一步验证。他们发现，多个空间原型与TNBC的疾病结局密切相关，并具有潜在的可操作特征。这些发现为TNBC生态系统的复杂性提供了全面的见解，并可能为个性化治疗，特别是免疫治疗，提供新的思路和方法。
疾病研究：三阴性乳腺癌, 异质性, 空间转录组学, 肿瘤结构,免疫治疗效果, 聚类分析, 个性化治疗, 免疫治疗; Wang X, Venet D, Lifrange F, et al.; Breast Cancer Translational Research Laboratory J-C Heuson, Institut Jules Bordet, Université Libre de Bruxelles, Hôpital Universitaire de Bruxelles, Brussels, Belgium.
来源：小王讲科学