eqtl、pqtl、生信分析可以补什么实验呢?

360影视 2025-02-06 21:32 2

摘要:之前我们分享了纯数据挖掘的eqtl、pqtl、生信分析这类超级混合分析,不过有很多粉丝一定要补实验才可以毕业、评职称、申请博士、或者博士后出站、申请课题等等。我们利用eqtl、pqtl、生信分析筛选到主角分子以后,该补什么实验呢?或者怎么样才能和我们的基础实验

之前我们分享了纯数据挖掘的eqtl、pqtl、生信分析这类超级混合分析,不过有很多粉丝一定要补实验才可以毕业、评职称、申请博士、或者博士后出站、申请课题等等。我们利用eqtl、pqtl、生信分析筛选到主角分子以后,该补什么实验呢?或者怎么样才能和我们的基础实验联系起来呢?

超级混合分析能解决的问题:1、基因的表达是否有差异?(疾病VS正常组织)2、基因是好基因还是坏基因?(促进还是抑制疾病)3、基因的表达是受什么调控的?(上游作用机制)4、基因通过什么途径来影响疾病?(下游作用机制)我们一般都是利用生信分析、 eQTL/pQTL分析筛选到主角分子再使用实验验证的,从简单到复杂,从表达到功能再到作用机制的验证逻辑。筛选到了主角基因以后,可以补哪些实验呢?表达验证常见的实验:qPCRWestern blot(WB)免疫组化(IHC)功能验证常见的实验:细胞实验:细胞增殖(如CCK-8 )细胞迁移(如划痕实验或 Transwell )细胞凋亡(如流式细胞术)动物实验机制需要探索再验证:主角分子A——>明星通路主角分子A——>B分子——>明星通路主角分子A——>B分子——>细胞表型(如自噬、铁死亡等)主角分子A——>B分子——>明星通路——>细胞表型(如自噬、铁死亡等)补实验是没有上限的,需要根据自己的发文高度、科研经费、时间来综合考虑补到什么程度,有多少钱就补多少实验。科研经费决定发文上限:生信分析+eQTL+pQTL+表达验证(0-5分水刊)生信分析+eQTL+pQTL+表达验证+功能验证(5分+)生信分析+eQTL+pQTL+表达验证+功能验证+简单机制研究(5-10分)生信分析+eQTL+pQTL+表达验证+功能验证+复杂机制研究(10分+)本文只分享思路,剩下的细节问题需要自己摸索!

来源:网络游戏

相关推荐