摘要：引用格式：刘红宾, 汤锦辉, 戴磊. (2020). 小鼠粪便样本中短链脂肪酸的定量检测. // 微生物组实验手册.Bio-101: e2003367. DOI:10.21769/BioProtoc.2003367.
小鼠粪便样本中短链脂肪酸的定量检测
Quantitative analysis of short-chain fatty acids (SCFAs) in mouse fecal sample
刘红宾1 *，汤锦辉1 ，戴磊11. 中国科学院深圳先进技术研究院，深圳，广东省
*通讯作者邮箱：binhongliu@126.com
引用格式：刘红宾, 汤锦辉, 戴磊. (2020). 小鼠粪便样本中短链脂肪酸的定量检测. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003367. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003367.
How to cite: Yunyun Gao, Kai Peng, Defeng Bai, et al. 2024. The Microbiome Protocols eBook initiative: Building a bridge to microbiome research. iMeta 3: e182.
摘要：短链脂肪酸（Short-chain fatty acids，SCFAs）是肠道菌群的重要代谢产物，主要包括乙酸、丙酸和丁酸，对宿主的许多生理代谢过程具有有益的调节作用。由于以往检测方法存在操作耗时长、所需样本量大、机器批次效应偏差、前处理误差大的缺点，无法对样本中的SCFAs进行准确定量。本文通过添加内标脂肪酸的方法，可以在1.5小时内完成粪便样本的前处理手动操作，并且只需0.03g的粪便样本，完成对十种SCFAs的定量检测。本方法可拓展至其他生物样品类型（器官组织、微生物培养液等），为肠道菌群代谢相关研究提供技术参考。
关键词：短链脂肪酸，气相色谱-质谱技术，肠道菌群
材料：
1.0.6 ml离心管
2. 气相色谱-质谱上样瓶（Agilent，产品货号：5181-0714）
3. 内插管（Agilent，产品货号：5181-1270）
4. 氧化锆珠子（Biospec，产品货号：11079110z）
试剂：
1. SCFAs混合酸标准品（Sigma, 产品货号：CRM46975）
2.6,6,6-d3己酸（cdn isotopes, 产品货号：ND-3993）
3.无水乙醚（上海凌峰）
4. 无水Na2 SO4 （Sigma，产品货号：238597）
5.盐酸（上海凌峰）
6.N, O-三甲硅烷基三氟乙酰胺（BSTFA，Sigma，产品货号：25561-30-2）
仪器设备
1. 涡旋振荡器（赛默飞，Vortex-Genie 2）
2. 低温离心机 (艾本德，5427R)
3.通风橱
4.8890-7000D GC-MS
5.HP-5 ms色谱柱
前期准备工作
按照终浓度配置以下溶液：
1.5 M 盐酸
2. 10 µg/ml 6,6,6-d3己酸内标溶液 [1]
3. 含有10µg/ml内标的不同梯度浓度SCFAs标准品溶液（25、50、100、200、400、800 μM）
样品前处理
1. 取30 mg左右冻存的小鼠粪便于1 .5ml离心管内，加入350 µl内标溶液和10 mg左右氧化锆研磨珠。
2. 将离心管水平固定在振荡器圆盘上，4 °C环境中10 档高速震荡2 min左右进行匀质，直至形成匀浆状态。
3. 将振荡器放置于4°C环境中，3 档低速震荡30 min。
4. 4°C环境中，13,000 x g离心30 min。
5.取100 µl上清至0.6 ml离心管，加入10 µl 5 M盐酸，震荡混匀进行酸化；另取100 µl上清至0.6 ml离心管，标记并于-80 °C冻存备份。
6.加入100 µl无水乙醚，充分震荡混匀，放置冰上5 min [2]。
7. 4°C环境中，10,000 x g离心5 min。
8. 取上层（乙醚层）至含有10 mg左右无水Na2 SO4 的0.6 ml离心管中。
9. 再次加入100 µl无水乙醚至剩余溶液中进行第二次和第三次抽提（重复6-8步2次），将三次抽提的乙醚层抽提溶液混匀震荡，4°C环境中10,000 x g离心3 min。
10.取160 µl离心后的上层乙醚抽提混合液至内插管中，加入8 µl BSTFA震荡混匀。
11. 室温静置超过8 h后，上机检测。检测仪器进样、升温等参数见表1 ，SIM模式下进行靶标脂肪酸的定性和定量检测见表2 。
表1. GC-MS上机检测参数设定
项 目参 数进样量1 μl分流模式脉冲分流 (10 psi, 10:1)隔垫吹扫流速3ml min−1载气氦气柱流速1 ml/min柱箱升温程序40 °C保持2分钟；15 °C min−1 升温至150 °C，保持1分钟；30 °C min−1 升温至300 °C，保持5分钟前进样口温度260 °C传输线温度280 °C离子源温度230 °C四级杆温度150 °C电离电压70 eV采集模式SIM溶剂延迟3.8分钟表2. SIM模式下SCFA保留时间和定性定量离子
SCFAs保留时间(min)定量离子(m/z)定性离子(m/z)甲酸4.110375,103乙酸5.0311775, 117丙酸6.213175, 131异丁酸6.7114575, 117, 145丁酸7.3214575, 117, 145异戊酸7.9415975, 117, 159戊酸8.515975, 117, 1594-甲基戊酸9.1917375, 117, 173己酸9.5717375, 117, 173庚酸10.7118775, 117, 187下图展示了SIM模式下800 μM SCFAs标准品溶液和小鼠粪便样品的检测色谱图（图1）。
1.Cai, J., Zhang, J., Tian, Y., Zhang, L., Hatzakis, E., Krausz, K. W., Smith, P. B., Gonzalez, F. J. and Patterson, A. D. (2017). Orthogonal Comparison of GC-MS and (1)H NMR Spectroscopy for Short Chain Fatty Acid Quantitation.Anal Chem 89(15): 7900-7906.
2.Zhang, S., Wang, H. and Zhu, M. J. (2019). A sensitive GC/MS detection method for analyzing microbial metabolites short chain fatty acids in fecal and serum samples.Talanta 196: 249-254.
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来源：微生物组