王芊佳:基因数据如何重塑物种分类?“遗传密码”揭示物种奥秘

摘要:遗传指标(Genetic Indicators)是用来评估物种或群体基因多样性、健康状况以及它们适应环境变化能力的一种科学方法。通过分析基因的变异、遗传多样性、有效种群大小(Ne)、基因流动和种群结构等方面的信息,遗传指标能够帮助我们了解物种或生态系统的遗传稳

本文来源于“海洋与湿地”(OceanWetlands):

文 | 王芊佳

本文约2020字,阅读约5分钟


遗传指标(Genetic Indicators)是用来评估物种或群体基因多样性、健康状况以及它们适应环境变化能力的一种科学方法。通过分析基因的变异、遗传多样性、有效种群大小(Ne)、基因流动和种群结构等方面的信息,遗传指标能够帮助我们了解物种或生态系统的遗传稳定性和生存能力。在生物多样性保护工作中,这些指标对于监测物种的遗传状况、评估其面临的灭绝风险,以及制定有效的保护措施都具有重要的作用。

一条黄鳍金枪鱼(Yellowfin tuna)的模型。Linda Wong摄于上海海洋大学。©绿会融媒·“海洋与湿地”(OceanWetlands)

遗传指标在物种分类和命名中的作用日益显著。随着基因组学的不断发展,科学家们逐渐认识到,传统的物种分类和命名方法,虽说的确在过去发挥了重要作用,但如今,已有点无法完全满足现代生物多样性研究的需求了。在过去,物种的分类通常依赖于形态学特征,如外貌、栖息环境和行为等。但是这种基于形态的分类方法,在面对相似外貌但遗传上显著不同的物种时,常常表现出局限性、甚至是可能出现错误的判断。随着基因组学技术的进步,遗传数据为物种分类和命名提供了更加精确、客观的科学依据。

遗传数据能够揭示物种之间更为真实的遗传关系,这对于物种的正确分类至关重要。在传统的分类学中,一些物种在形态上可能高度相似,难以通过外观区分,而基因数据则能够揭示它们之间是否存在显著的遗传差异。通过基因组学的分析,科学家可以构建更加准确的系统发育树,明确物种或亚种的遗传界限。这种基于基因数据的分类方法,能够避免由于形态相似性导致的错误分类。比如,有些物种的外形几乎无法区分,但基因组数据表明它们在遗传上有很大差异,因此必须被归为不同的物种或亚种。

遗传数据对于区分“隐性物种”(cryptic species)也具有极为重要的作用。隐性物种指的是那些外形上几乎无法区分,但基因上却存在明显差异的物种。传统的形态学方法可能无法识别这些物种,而遗传学分析则能够通过基因序列差异精确区分它们。随着基因组学技术的不断发展,越来越多的隐性物种被发现并重新定义。如,在昆虫、鱼类或植物中,科学家们已经识别出了多个隐性物种,这些物种可能在生态系统中发挥着重要作用,却在传统的物种分类系统中未被发现。遗传学的应用不仅促进了物种多样性的认识,还在生态保护中具有重要意义,因为这些隐性物种可能是生态系统健康的关键组成部分。

©绿会融媒·海洋与湿地

基因组数据的应用,还大大推动了物种命名的系统化和标准化。国际生物命名法要求,物种命名必须基于一致的规则;而基因组数据为物种命名提供了更为明确的依据。例如,DNA条形码技术通过特定的基因片段(如线粒体基因COI)作为物种识别的“身份证”,它为物种命名提供了一种全球通用、可重复的工具。通过这种方法,物种的命名变得更加标准化,避免了以往因形态相似或地域分布差异而出现的命名混乱。这种基于基因的命名方法,推动了全球范围内物种分类和命名的一致性,使得不同地区、不同领域的科学家可以在同一标准下交流和合作。(小编注:不过,虽然基因组数据可以提供丰富的遗传信息,但形态学数据,目前仍然是物种鉴定和分类的重要依据。形态学特征可以反映物种在长期进化过程中形成的适应性特征,对于理解物种的生态位、系统发育关系具有重要意义。)

通过基因组数据,科学家还可以揭示物种群体间的基因流和基因交流。基因流是指不同物种或群体间基因的交换,它对于物种的进化和适应至关重要。通过遗传学分析,科学家能够识别不同群体之间的基因流动情况,从而为物种的分类和命名提供依据。比如说,某些物种群体在不同地理区域之间可能存在基因流动,而其他群体则相对隔离。遗传数据的分析能够帮助确定物种在遗传上的一致性或差异性,这对于进一步明确物种的界限非常重要。

此外,遗传指标在新物种的发现和命名中也发挥了重要作用。许多新物种的发现,尤其是在难以通过形态区分的情况下,往往依赖于基因组学技术。通过基因组数据,科学家能够确认物种的存在,从而为其命名提供科学依据。随着基因组学技术的不断完善,越来越多的新物种被发现并命名,这些新物种往往在生态功能和生物多样性保护中具有重要意义。

遗传指标不仅有助于物种的准确分类和命名,还能够揭示物种的遗传多样性。遗传多样性是物种适应环境变化和维持生态平衡的基础。遗传数据的分析有助于评估物种的遗传健康状况,识别面临遗传瓶颈或灭绝风险的物种。在物种分类过程中,遗传多样性也可以作为一个重要的参考指标,帮助科学家评估物种的保护优先级。

©绿会融媒·海洋与湿地

所以说,遗传指标在物种的分类、命名中,可以发挥举足轻重的作用。它们为物种之间的“关系网”揭示了真相,帮助我们发现那些藏在深处的隐性物种,也为物种命名的“定海神针”提供了坚实的科学依据。同时,基因组学技术的飞跃进展也为新物种的发现、物种间基因流动的探析以及物种保护“添砖加瓦”。随着遗传学研究的不断深入,物种分类和命名将更加精准和科学,进而推动生物多样性研究和生态保护进入更为规范化、标准化的阶段。

(注:本文为笔者基于各种材料整理出来的一份小小学习笔记,仅供参考。)


THE END

湿

整理 | 王芊佳

编辑 | Samantha

排版 | 绿叶

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封面图 ©摄影:王敏幹(John MK Wong) | 绿会融媒·“海洋与湿地”(OceanWetlands)

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来源:中国绿发会

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