新一代PROTAC来了!双开关锁定,精准蛋白降解

360影视 国产动漫 2025-03-20 20:38 2

摘要:蛋白降解剂(PROTAC)通过同时结合目标蛋白(POI)和E3连接酶,诱导POI的泛素化降解,展示出了强大的治疗潜力。然而,PROTAC缺乏细胞特异性,可能在健康组织中错误激活,导致脱靶毒性,限制了其临床应用。

蛋白降解剂(PROTAC)通过同时结合目标蛋白(POI)和E3连接酶,诱导POI的泛素化降解,展示出了强大的治疗潜力。然而,PROTAC缺乏细胞特异性,可能在健康组织中错误激活,导致脱靶毒性,限制了其临床应用。

为了解决这一难题,马萨诸塞大学的研究团队近日在Journal of the American Chemical Society(JACS)杂志发表论文,他们提出了一种“AND逻辑门”的PROTAC,称为DAO-PROTAC(Dual-Action-Only PROTAC)。这种分子在正常情况下处于“休眠”状态,只有在同时存在两种疾病相关的内源性刺激(缺氧、组织蛋白酶L)时才会被激活,从而降解目标蛋白。

DAO-PROTAC的核心机制在于双重锁定、精准解锁:

缺氧响应模块:肿瘤因快速生长常处于缺氧状态,DAO-PROTAC的POI配体被4-硝基苄基“锁住”,缺氧时由细胞内氧化还原酶触发解锁;

组织蛋白酶L响应模块:肿瘤高表达的组织蛋白酶可切割特定酰胺键,释放E3连接酶配体。

只有当两种条件同时满足,DAO-PROTAC才会完全激活,形成功能完整的PROTAC分子,诱导POI降解。

图1. DAO-PROTAC技术原理

具体来说,研究人员首先以dBET1(一种靶向BRD4的PROTAC)为基础,合成了DAO-dBET1分子。该分子可在缺氧和组织蛋白酶L(Cath-L)的作用下,分别释放JQ1和沙利度胺配体,从而降解BRD4蛋白。

图2. DAO-dBET1分子

为了测试DAO-dBET1的效果,研究人员选用了组织蛋白酶L高表达的MDA-MB-231细胞系。在双刺激下,DAO-dBET1能有效降解BRD4,然而在仅存在一种刺激下,DAO-dBET1对BRD4的降解作用很小,而且72小时后会发生明显的细胞凋亡。

图3. DAO-PROTAC 的双重刺激下的靶向降解效果

对于单一刺激下发生的细胞凋亡,研究人员猜测是释放的JQ1或沙利度胺影响细胞活性,因此他们又合成了游离的中间体Hyp-dbet1和Cath-L-dbet1。

在没有正确刺激的情况下,浓度≤1μM时两者都不会诱导BRD4降解,而在双刺激下BRD4降解率>80%。这些结果显示,相对于游离药物或单笼前药,双笼异二价分子具有更高的安全性。

图4. 游离中间体对靶蛋白和下游蛋白的影响

之后,研究人员在健康的HEK-293细胞系(组织蛋白酶L低表达)检测了 DAO-dBET1 的降解效果。结果发现,DAO-dBET1在健康的HEK-293细胞系中对靶蛋白没有明显的降解。 由于HEK-293中组织蛋白酶L低表达,细胞也受到一定的保护,细胞毒性是缺氧所致。 最后,DAO-dBET1在缺氧条件下的处理导致了c-Myc的下调,而ZFP-91的表达却没有明显变化。 因此,DAO-dBET1在健康的HEK-293细胞中更安全。

图5. HEK-293 细胞系中DAO-dBET1 降解效果

最后,为了进一步检验DAO-PROTAC的通用性,作者设计了第二种DAO-PROTAC分子(名为DAO-THAL-SNS-032),以CRBN为E3连接酶,靶向细胞周期蛋白依赖性激酶9(CDK9)。

在缺氧条件下,DAO-THAL-SNS-032能有效降解CDK9,但在没有双重刺激的情况下仍然没有活性。DAO-THAL-SNS-032虽然在高浓度下基本没有活性,但在配体解笼后,对任一刺激都表现出显著的细胞毒性。这些结果证实了DAO-PROTAC广泛适用性。

图6. DAO-PROTAC 的适用性

总结来说,通过“AND逻辑门控”设计,DAO-PROTAC不仅能降低脱靶毒性、提高降解剂的安全性,还能选择性地降解目标蛋白,减少对正常细胞的影响,提高治疗效果。总之,DAO-PROTAC具有重要的科学意义和应用价值,有望成为新一代蛋白降解剂,为精准医疗的发展做出贡献。

参考资料:

Ranit Dutta et al. Dual-Action-Only PROTACs. JACS(2025)

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来源:小璇科技每日一讲

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