Nature丨染色质环是动物多细胞化起源的远古密钥
基因组的三维空间结构调控是近年来分子生物学领域的重要研究方向。在两侧对称动物(如脊椎动物和昆虫)中,大量研究表明染色质环(chromatin loops)在基因表达调控中发挥着核心作用。这种三维结构通过将基因组上相距遥远的调控元件(如增强子)与目标基因的启动子
基因组的三维空间结构调控是近年来分子生物学领域的重要研究方向。在两侧对称动物(如脊椎动物和昆虫)中,大量研究表明染色质环(chromatin loops)在基因表达调控中发挥着核心作用。这种三维结构通过将基因组上相距遥远的调控元件(如增强子)与目标基因的启动子
我们身体里形态和功能千差万别的细胞,从思考的大脑神经元到跳动的心脏肌肉细胞,都携带着同一套DNA密码本?如果基因组序列是生命的蓝图,那究竟是什么力量决定了每个细胞会“阅读”和执行蓝图中的哪些部分,最终构建出如此多姿多彩的生命?答案不仅藏在DNA的线性序列里,更
2025年4月16日,深圳大学医学部基础医学院及卡尔森国际肿瘤中心朱卫国教授团队在《自然》(Nature)杂志在线发表了题为“Histone H1 deamidation facilitates chromatin relaxation for DNA rep
双链断裂(DSB)是最严重的 DNA 损伤形式之一,会导致基因组不稳定。它们的有效修复需要增加染色质的可及性,以促进修复因子的募集。染色质快速打开的最明确机制涉及乙酰化修饰和 PARylation 修饰,这两种机制会降低 DNA-核小体界面的电荷。然而,在 D
DNA缠绕组蛋白八聚体形成的核小体是染色质的基本单元。染色质重塑蛋白(chromatin remodeler)利用ATP水解的能量移动核小体,从而调节染色质结构与基因表达。染色质重塑蛋白包含4个主要家族:SWI/SNF,ISWI,CHD和INO80,它们具有多
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin Sequencing,转座酶染色质可及性测序),可绘制全基因组范围内染色质可及性图谱,该技术可以识别基因调控区域(如启动子、增强子等),从染色质开放性维度揭
真核生物基因组中的转录状态主要包括转录激活和沉默。转录沉默通常与基因组中的异染色质结构域相关,该区域往往富集了高水平的DNA甲基化和抑制性组蛋白修饰,并显示出高度紧凑的染色质状态,最终导致RNA聚合酶无法进入,实现转录抑制。相反,转录激活主要发生在更开放、松散
转录因子(TF) 通过以序列特异性方式与DNA结合并招募效应蛋白来调节基因表达,是基因表达调控中的关键因子。尽管它们起着关键作用,但许多TF的调控靶点和作用机制仍然未知。对单个转录因子的表征扩大了对基因调控的理解。ENCODE等项目展示了TF在全基因组的结合,
ChIP(染色质免疫沉淀)是一种超厉害的技术,能帮我们研究蛋白质和DNA在体内的相互作用。简单来说,它就像是给细胞里的蛋白质和DNA拍个“合照”,看看它们是不是真的“在一起”。这对于研究基因表达、组蛋白修饰、DNA复制和损伤修复等超重要哦!
本期与我们用声音见面的是重庆医科大学附属第二医院刘川教授,他将与大家一同分享一项发表于《Science》杂志(影响因子:44.7)的一项有关基于染色质图谱的去势抵抗性前列腺癌分型提示潜在治疗靶点的研究。
染色体结构维持复合物(Structural Maintenance of Chromosomes complexes,SMC)——包括粘连蛋白(cohesin)和凝缩蛋白(condensin)在真核生物基因组动态折叠模式的调控中发挥核心作用。在 G1 期,co
在细胞间期,染色质丝在细胞核内的组织结构遵循一个基本原则——区室化。在此基础上,condensin II 帮助各条染色体盘踞形成染色体疆域(chromosome territory);而cohesin 则在DNA上滑动,挤出染色质环,并与CTCF蛋白共同介导形
在细胞间期,染色质丝在细胞核内的组织结构遵循一个基本原则——区室化。在此基础上,condensin II帮助各条染色体盘踞形成染色体疆域(chromosome territory);而cohesin则在DNA上滑动,挤出染色质环,并与CTCF蛋白共同介导形成染
多细胞生物发育过程中,基因表达具有谱系特异性与发育阶段特异性,这一过程受到谱系特异性转录因子与增强子等功能性顺式转录调控元件 (cis-regulatory elements, CRE) 的严格调控。2020年,DNA元件百科全书 (ENCODE) 计划第三阶
细胞命运的转换是现代生命科学和医学领域中最具革命性的话题之一。通过精准操控细胞命运,研究人员可以将一种成熟的细胞类型重编程为另一种完全不同的细胞类型,这种过程不仅揭示了生命系统的可塑性,更为再生医学、疾病建模和个性化治疗开辟了新的可能性。然而,重编程的核心机制
2024年12月12日,大连医科大学任双义,左云飞共同通讯在Advanced Science在线发表题为“The Lyn/RUVBL1 Complex Promotes Colorectal Cancer Liver Metastasis by Regulat
DNA与蛋白质互作及染色质开放性研究是表观遗传学中的重要领域,影响基因表达调控和细胞功能。染色质开放性指的是染色质在全基因组范围内的开放程度。蛋白-DNA互作则涉及转录因子和其他DNA结合蛋白与基因组特定区域的结合,调控基因表达。研究DNA与蛋白质互作及染色质