Science：大语言模型模拟5亿年进化，开启蛋白质设计新纪元
超过 30 亿年的进化在天然蛋白质的空间中形成了生物学的图景。在此，我们展示了大规模训练的基于进化数据的语言模型能够生成与已知蛋白质相去甚远的功能性蛋白质。我们推出了 ESM3，这是一种前沿的多模态生成语言模型，能够对蛋白质的序列、结构和功能进行推理。ESM3
荧光蛋白
夜光水母夜光猪，为何还有夜光虾？
生物发光是很常见的现象，夏日夜晚萤火虫的飞舞和海边夜光藻聚集造成的“蓝眼泪”是无数人打卡拍照的独特景象。发光的物体，看起来是挺好看的，要是送入口中做食物的话，你是不是就得怀疑一下安全问题了。网上就曾流传过夜光寿司的图片，在强光下看似正常的寿司却在黑暗环境下发出
你认为哪些生物存在发光现象
在深邃的海洋与幽暗的森林中，许多生物能够通过自身产生光亮，这种现象被称为生物发光。这些生物利用化学反应生成光线，既用于生存，也用于繁衍。海洋是生物发光现象最为常见的环境。例如，某些深海鱼类通过发光器官吸引猎物或迷惑天敌。水母则依靠体内的荧光蛋白释放蓝绿色光芒，
要报|科学家绘就“最完整”大脑连接图谱
为了让我们完成那份逾期未交的报告或在电脑上完成一直等待我们处理的Excel电子表格，大脑中的神经网络正以极快的速度工作着，同时连接着错综复杂的细胞通路。
清华团队建立一种基于荧光蛋白荧光寿命的检测方法
在神经退行性疾病研究领域，科学家发现多种致病蛋白能够通过液液相分离机制形成动态的液态凝聚体。这些生物分子凝聚体会随着时间推移经历液-固相变过程，最终转化为病理性的固态聚集体。当前研究中广泛采用的FRAP（荧光漂白恢复）技术虽然能够有效评估液态凝聚体的流动性特征
AI模拟了一场5亿年的进化！研究成果登上《科学》
近日，《科学》（Science）杂志刊登了一篇标题为《用语言模型模拟5亿年演化》（Simulating 500 million years of evolution with a language model）的研究论文。在这个宏大的标题之下，科学家们用AI解
BiFC技术，让蛋白互作“看得见”！
在生命科学领域，蛋白质相互作用是调控细胞功能的核心机制之一。传统的检测方法存在操作复杂、假阳性率高、无法实时观察等局限。双分子荧光互补技术（Bimolecular Fluorescence Complementation, BiFC）应运而生！
荧光蛋白新星：从光控神经到命运追踪，这些工具正在改写生命科学
自绿色荧光蛋白（GFP）点亮生命科学以来，荧光标记技术不断突破。传统明星tdTomato和EGFP虽仍占据实验室“C位”，但新一代荧光蛋白如ChR2_H134R/EYFP、GCaMP6f、KikGR、Kaede和mNeonGreen正以独特的光学特性与功能多样
最新研究丨周哲敏教授团队在Advanced
近期，我校生物工程学院周哲敏教授团队在蛋白质骨架设计的研究方面取得重要进展，研究成果“A Versatile Protein Scaffold Engineered for the Hierarchical Assembly of Robust and Hig
用AI模拟5亿年的进化，创造出全新荧光蛋白
原创 生物世界 生物世界撰文丨王聪编辑丨王多鱼排版丨水成文大约 35 亿年前，地球从化学反应中诞生了最初的生命。大自然发明了 RNA、蛋白质和 DNA 这些生命的核心分子，并创造了核糖体这一分子工厂，它能根据基因组中的指令合成蛋白质。蛋白质是奇妙的动态分子，具
科学家利用AI模型模拟五亿年进化，产生前所未见的新荧光蛋白
八位Meta FAIR蛋白质团队（2023年8月遭Meta裁撤）前科学家去年成立生物AI模型开发创业公司EvolutionaryScale，携手非营利性生医科学与技术研究机构Arc Institute开发ESM3 AI模型。研究员通过模型模拟五亿年蛋白质进化，
快速进化：人工智能模拟5亿年的生物学
托马斯·海斯（Thomas Hayes）和他的同事利用一种名为“ESM3”的多模态生成语言模型，设计并合成了一种新的明亮荧光蛋白，其基因序列与任何已知的荧光蛋白都大不相同。研究人员指出，这一成就可以与模拟5亿年生物进化的ESM3相媲美。
Science | 实现模拟5亿年演化的语言模型
近日，一项发表在Science的工作把蛋白的序列、结构、功能等当作不同的“语言”[1], [2]来丝滑整合并深度（更动态/综合的mask规则）训练大语言模型（ESM3; 1.4 billion, 7 billion, and 98 billion parame
Science：AI模拟5亿年生物进化，创造了一种「前所未有」的蛋白质
蛋白质是生物体中非常重要的功能性分子，它们的形成过程经过了数十亿年的自然选择和进化。在这一过程中，蛋白质的序列和结构经过无数次随机突变，并通过生物系统的选择机制进行筛选，最终形成那些具有特定生物学功能的蛋白质。
北大刘涛/地大娄筱叮联合开发可遗传编码新型荧光分子工具，高效构建人造荧光蛋白等
荧光技术是分子生物学研究中的核心工具， 尤其是荧光蛋白 （如绿色荧光蛋白 GFP），凭借其可遗传编码性、丰富的色彩变化和出色的稳定性，为研究生物分子的定位、相互作用及动态行为提供了强有力的支持。然而，传统的荧光蛋白仍面临一些显著挑战：它们的分子体积较大（通常超
收藏！一文全方位了解双分子荧光互补（BiFC）技术
蛋白质是生命体的重要组成部分，是生命活动的主要承担者和执行者。据估计，超过80%的蛋白质并不是孤立存在，而是与其他蛋白质通过相互作用形成稳定或瞬时的复合物结构。蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interactions，PPIs)是分子生
全球荧光蛋白标记市场集中度较高，Top3企业市场份额超46%
荧光蛋白标记指将荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上，利用荧光特性对被标记对象进行定性、定位及定量分析。