Genome Biology | 南洋理工章安妮组开发新的序列比对生信工具
序列比对是许多生物信息学分析的基础。许多比对工具通过将序列分割为连续的固定长度片段(称为k-mers)开始。使用较长且独特的seed比对速度更快,而使用较短且避免突变的seed则更准确。在此,我们介绍了X-Mapper,旨在通过包含缺口的动态长度seed(称为
序列比对是许多生物信息学分析的基础。许多比对工具通过将序列分割为连续的固定长度片段(称为k-mers)开始。使用较长且独特的seed比对速度更快,而使用较短且避免突变的seed则更准确。在此,我们介绍了X-Mapper,旨在通过包含缺口的动态长度seed(称为