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喜报 | iMeta被SCIE、ESI等数据库正式收录!(2024/11/8)

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iMeta大会2024第一天:前沿技术报告

iMeta大会2024(10.11-13深圳)第三轮通知-日程更新

iMeta大会2024(10.11-13深圳)第二轮通知-仅剩不足百个名额,开通团体报名通道,报满即止

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iMeta大会2024 (10.11-13深圳) 第一轮通知

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iMeta期刊40位编委入选2024年全球高被引学者

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致谢 | iMeta 2023年审稿专家名单

致谢 | iMeta 2023年审稿专家名单(第二批)

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第3卷第2期(2024.4)

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iMeta | 中山大学谢小明/伍民庆/邹宇田综述肠道菌群重塑癌症免疫治疗疗效: 机制和治疗策略

iMeta | 华南农大孙坚组揭示了猪场日常职业暴露对人皮肤微生物组和耐药组的影响

iMeta | 广东省人民医院张学礼等更新结直肠癌生物标志物数据库CBD2

第2卷第4期(2023.12)

iMeta期刊 第2卷第4期 在线正式发布

iMeta期刊 第2卷第4期封面:解码先天性心脏病患者肠道微生态奥秘

iMeta期刊 第2卷第4期封底:肠道稳态

iMeta | 华中科大宁康组与元码基因联合开发在线微生物关联分析平台

iMeta | 浙江大学邵勇奇组揭示引物选择影响环境微生物组的微生态模式评估

iMeta | 尤祥伟/李义强团队-揭示水热炭调控滨海盐碱土固碳减排新机制

iMeta | 东北林业大学冯富娟组发现丛枝菌根真菌诱导削弱镉的迁移

iMeta|香港中文大学(深圳)及福田生物医药创新研发中心与海普洛斯联合推出单细胞分析流程ScRNAPip

iMeta | 江南大学陈卫课题组探究清酒乳杆菌对炎症性肠病的种间差异机制

iMeta | 厦门大学游伟伟组开发具备Shinyapp界面的一站式转录组分析和可视化R包

iMeta | 中国科学院微生物所魏鑫丽组揭示荒漠地衣结皮中关键细菌具宿主选择趋势

iMeta | 中科院水保所邓蕾组揭示了长期植被演替下土壤活性碳组分与微生物群落的联系

iMeta | 解放军总医院卫勃组-褪黑素延长创伤性结肠损伤个体生存时间的新作用及相关机制

iMeta | tNGS利器:跨物种超多重靶向测序引物设计软件MultiPrime

iMeta | 朱永官院士团队苏建强组-空气丰富与稀有种对大气环境变化的响应

iMeta | 中科院微生物所王军组-MetaSVs:结合长、短reads用于宏基因组结构变异分析和可视化流程

iMeta | 上海市食药检院/美吉生物-MIST: 可交互微生物鉴定和溯源分析平台

iMeta封面 | 阜外医院李守军/黄源/刘禹泽-解码先天性心脏病患者肠道微生态奥秘

iMeta | 安徽医科大梁朝朝组基于多组学数据揭示肾透明细胞癌分子分型

iMeta | 南京大学陈迪俊组开发了可用于构建基因动态调控和网络的整合分析平台

第2卷第3期(2023.8)

iMeta期刊 第2卷第3期在线正式发布

iMeta期刊 第2卷第3期封面:植物病害之隐秘推手

iMeta | 青岛大学朱素杰组开发了基于集成学习的新冠患者疾病严重程度打分

iMeta | 罗鹏/袁硕峰/张健/程全-合作开发用于探索HPV相关肿瘤的肿瘤免疫微环境的shiny网页工具

iMeta | 杨跃进/熊长明/郑乐民综述琥珀酸的多效性:肠道菌群与心血管疾病的相互作用

iMeta | 索尔克研究所丁武斌开发可视化多模态基因组学数据的python包 教程

iMeta | 中国海洋大学张伟鹏组揭示海洋微塑料表面生物被膜组装机制

iMeta | 中山大学李文均教授团队描绘不同极端环境原核微生物培养策略

iMeta | 齐素华/顾兵/罗兰/王亮-揭示玛咖来源细胞外囊泡可通过脑-肠轴促进五羟色胺释放改善抑郁症

iMeta | 威斯康星大学周之超开发模块化工具研究病毒组

iMeta | 刘吉泉/徐健-揭示洗涤过程中抗菌洗涤剂对衣物中微生物交换及后续异味的影响

iMeta | 徐健/姚粟/崔云龙-合作发明基于拉曼组原理的益生菌单细胞质检技术

iMeta | 浙江大学王蒙岑组综述植物发病机制:走向对微生物组的多维理解

iMeta | 中国药科大学李萍/李菁-编码胆盐水解酶的乳酸杆菌的分类鉴定:调节肝肠胆汁酸谱

iMeta | 韩新巍/张振宇/刘灶渠基于免疫扰动网络揭示胶质母细胞瘤的生物学异质性

iMeta | 北京协和医学院张健/张宇辉综述心力衰竭中的肠道菌群及相关干预措施

iMeta | 内蒙古大学包玉英组揭示火山极端环境下不同岩石表层土壤微生物组的模式和驱动因素

第2卷第2期(2023.5)

iMeta期刊 第2卷第2期 在线正式发布

iMeta期刊 第2卷第2期封面:肠道菌群之歌

iMeta | 中国农业大学胡永飞组揭示鸡肠道微生物发育轨迹及其与宿主代谢的关系

iMeta | 南方医科大学刘志华揭示高盐饮食诱导突触丧失和记忆损伤

iMeta | 瑞典卡罗林斯卡医学院杜娟团队揭示宫颈异常增生患者唾液菌群发生改变且受锥形切除术治疗的影响

iMeta | 引用7000+,海普洛斯陈实富发布新版fastp,更快更好地处理FASTQ数据

iMeta | 复旦大学附属华山医院证实肾上腺皮质癌中瘤内菌的存在并与预后相关

iMeta | 军事医学研究院杨瑞馥组开发IMBEC技术用于分离结直肠癌患者体内的致病共栖菌

iMeta |中科院南京土壤所褚海燕组开发量化微生物群落水平生物关联的方法

iMeta | 华中科技大学杨操组综述细胞外囊泡和微生物组的互作:疾病治疗新策略

iMeta | 西北农林科技大学韩新辉组揭示降水变化对土壤微生物网络复杂性和多功能性的影响

iMeta | 张彦琼/许海玉/周雪忠联合开发基于SoFDA病-证-方关联的本体表征、富集分析和相似度计算评价

iMeta | 河南农业大学姚文组开发绘制Circos图的交互式Web应用程序

iMeta |吴小立/谢黎炜综述肠道菌群可能作为精神分裂症和肥胖症发病机制的共同枢纽

iMeta | 中科院城市所杨军团队揭示城市公园微生物迁移对生物多样性和生态功能的影响

iMeta | 中国农业大学汪杰组“塑料际”微生物最新综述

iMeta | 格罗宁根大学傅静远组发表对于Nature微生物菌株传播研究的评论

iMeta | 南方医科大学谢黎炜、马颖联合发现新生儿肠道微生物网络结构变化规律

iMeta | 浙大吴顶峰和同济刘蕾等对微生物富集分析中Reporter Score的误用研究

iMeta | 印遇龙院士/郑大魏勇军等综述益生菌发酵中草药的研究进展

iMeta | 调控肠道菌群的宿主源代谢分子概述

iMeta | 西湖大学郑钜圣团队:妊娠期糖尿病队列研究方案

第2卷第1期(2023.2)

iMeta期刊 第2卷第1期 在线正式发布

iMeta期刊 第2卷第1期 封面正式发布

iMeta | 兰州大学张东青年研究员:使用PhyloSuite进行分子系统发育及系统发育树的统计分析

iMeta | 宁波大学附属第一医院崔翰斌团队综述缺血性心脏病相关肠道微生物及菌群代谢物研究进展

iMeta | 2022年iMeta进展与审稿人致谢

iMeta | 中科院植物所周世良团队和河北工程大学刘艳磊团队揭示现代丝绸之路东段植物物种多样性格局及其影响因素

iMeta | 易扩增子(EasyAmplicon):易用、可重复的微生物组扩增子分析流程

iMeta | 李香真/姚敏杰开发微生物共现网络比较流程

iMeta | OmicStudio:一款可组合的、即时反馈的可生成高质量的发表级图表的生物信息云平台

iMeta | 农科院资划所曹卫东组揭示种植利用豆科绿肥内源驱动土壤自生固氮的作用

iMeta | 北中药李晓骄阳组综述解码免疫T细胞的作用-改善代谢相关脂肪性肝病的新领域

iMeta | 中科院武汉植物园杨玉义组探究浮游生物应对城市湖泊藻华加剧的分化策略

iMeta | 兰州大学刘勇勤组揭示植物定殖对冰川前缘微生物群落动态的影响

iMeta | 南京农业大学韦中组开发多病原生物污染高通量快检平台

iMeta | 南科大夏雨组综述二三代宏基因组分析的策略和工具(Illumina & Nanopore)

iMeta | 俄亥俄州立大学郑庆飞组发表多组学方法研究肿瘤微生物组综述

iMeta | 山东大学刘建团队–盐度胁迫削弱了微生物世界的马太效应

iMeta|哈佛医学院刘洋彧组揭示生态动力学对微生物溯源的挑战

iMeta|暨南大学陈嘉莉/白卫滨综述高脂饮食介导的肠菌紊乱与慢性疾病的互作机制

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iMeta|南医大刘星吟组研发微生物绝对丰度变化新方法(QMD)

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iMeta | 湘雅医院刘庆组-泛癌分析揭示铜死亡调节子的临床和分子特征

第1卷第4期(2022.12)

iMeta | 第1卷第4期来自8个国家的20篇文章正式发布(2022.12)

iMeta | 原核微生物泛基因组与基因组分析平台IPGA

iMeta | 中科院南京土壤所吴永红组揭示周丛生物非生物成分的地理印记和生态功能

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第1卷第3期(2022.9)

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施春林 | iMeta期刊及文章发表(南京医科大学,7月9日14点)

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iMeta典型文章系列讲座六:蒲中机-生成式人工智能的科研实践与应用

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报告 | 刘永鑫: 高影响力文章特点及如何支持国刊发展(12月14日20:00)

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跟着iMeta学做分析和作图

科研指南 | Dimensions数据库功能查询教程

冲击图展示菌群随盐度的变化

山峦图展示微生物丰度随盐度增加的动态变化

环境因子在地图上的可视化

如何用python画世界地图,并用不同的颜色展现每个国家的数据?

ggplot2绘制相关性分析线面组合热图

双侧柱状图展示具有正负相关性的类型数量

跟着iMeta学做图|用三元图展示微生物种群相对丰度

分面箱线图展示alpha多样性并用标注差异分析结果

ggplot2包绘制棒棒糖图展示变量间的相关性

绘制基于非加权Unifrac距离的主坐标分析PCoA图

ComplexHeatmap包绘制热图展示不同样本物种相对丰度

用ggClusterNet绘制共现网络(Co-occurrence Network)

circlize绘制环状热图展示细菌功能聚类分析

NMDS分析展示群落beta多样性

群落微生物与环境因子相关性分析

circlize绘制和弦图展示样本物种相对丰度

ggplot2绘制多个饼图展示菌群物种组成

微生物组共现网络(Co-occurrence Network)绘制

ggplot2绘制曼哈顿图展现物种丰度差异

跟着iMeta学做图|ComplexHeatmap绘制多样的热图

世界海拔地图

使用ImageGP绘图热图Heatmap

使用ImageGP绘图富集分析泡泡图

使用PMS分析微生物组(图文+视频)

DeepKla预测赖氨酸乳酸化位点

ImageGP使用教程

分享高颜值免费在线绘图介绍和使用的一次视频直播

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视频演示 | ImageGP重新绘制WGCNA性状关联热图

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视频演示 | BIC无代码绘制差异基因火山图

视频演示 |点点鼠标在线绘制GO/KEGG富集分析泡泡图

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视频演示 | 在线轻松绘制配对连线箱线图

简单强大的在线绘图

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在线WGCNA分析 (直接出交互式结果报告)

在线差异基因分析 (支持自动和指定批次校正)

这个工具可以组合参数画出2种单细胞Marker显示图

高颜值免费在线SCI绘图工具增加上传功能

ImageGP新上几个小工具

如何保证文章中同一组样品在不同子图颜色一致?

推荐一款生信分析工具的集大成者

视频演示 | 功能新增 | 增强版在线LEFSe分析和可视化鉴定标志性基因或物种

Venn网络展示富集分析结果

单个基因集富集分析泡泡图绘制

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无代码调整聚类热图分支顺序

基因表达热图聚类并增加行列注释

热图绘制一个快乐五一

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续昨天的文章,在火山图标记基因名字

画个火山图,标记下基因的名字

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什么是倾斜45度的火山图?

在线直接绘制倾斜45度的“火山图”

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期刊简介

iMeta” 是由威立、宏科学和本领域数千名华人科学家合作出版的开放获取期刊,主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊!相继被Google Scholar、PubMed、SCIE、ESI、DOAJ、Scopus等数据库收录!2024年6月获得首个影响因子23.8,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!

iMetaOmics” 是“iMeta” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,是定位IF>10的高水平综合期刊,欢迎投稿!

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来源:微生物组

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