iMeta 讲坛16 | 陈实富-高性能生信软件开发和开源实践(11.28晚7点线上)

摘要:陈实富,博士,正高级工程师。海普洛斯集团创始人、首席技术官,广东省肿瘤基因组学和肿瘤生物信息学工程技术中心主任。2019年深圳市青年科技奖获得者,以项目负责人身份获2022深圳科技进步奖,连续入选全球前2%顶尖科学家榜单(肿瘤学和生物信息学)和中国高被引学者(

iMeta讲坛 第16期

面向产业的高性能生信软件开发和开源实践

01 报告人简介

陈实富 正高级工程师

中国科学院/海普洛斯

陈实富,博士,正高级工程师。海普洛斯集团创始人、首席技术官,广东省肿瘤基因组学和肿瘤生物信息学工程技术中心主任。2019年深圳市青年科技奖获得者,以项目负责人身份获2022深圳科技进步奖,连续入选全球前2%顶尖科学家榜单(肿瘤学和生物信息学)和中国高被引学者(计算机科学)。开源项目组OpenGene的发起人,发表论文60余篇。《iMeta》期刊执行副主编,中国抗癌协会肿瘤标志专委会青年委员,肿瘤测序及大数据分析专委会委员。

个人主页:https://github.com/sfchen

02 报告简介

以OpenGene开源项目实践为例,探讨如何开发既满足产业界需求,又能够产生学术影响力的生物信息学软件,并进一步探讨高性能生物信息学软件的开发方法。

03 主持人简介

沈伟 副研究员

重庆医科大学附属第二医院

沈伟,重庆医科大学附属第二医院副研究员,硕士生导师,重庆市生物信息学会常务理事。主要研究方向包括微生物基因组、宏基因组、大规模基因组数据索引与序列比对等生物信息学算法与软件开发。目前以第一作者或共同第一作者在iMeta、Bioinformatics、mSystems、Journal of Genetics and Genomics等期刊发表多篇论文,单篇最高引用2000余次(SeqKit)。

个人主页http://shenwei.me。

04 报告时间和链接

报告时间:2024年11月28日 星期四 19:00

腾讯会议:894-6678-1896

会议链接:https://meeting.tencent.com/dm/pqpprRSMExHr

注意事项:腾讯会议室有100人限制,人满请扫描海报右上角二维码观看直播

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期刊简介

iMeta” 是由威立、肠菌分会和本领域数千华人科学家合作出版的开放获取期刊,主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等。目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。期刊特色包括视频投稿、可重复分析、图片打磨、青年编委、前3年免出版费、50万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊发行!发行后相继被Google Scholar、SCIE、ESI、PubMed、DOAJ、Scopus等数据库收录!2024年6月获得首个影响因子23.8,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,同学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!

iMetaOmics” 是“iMeta” 子刊,主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任,是定位IF>10的高水平综合期刊,欢迎投稿!

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来源:微生物组

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