摘要：iMeta 2024年热门下载论文不仅包括SeqKit2、JCVI、Majorbio Cloud等生信工具及在线分析平台，也涵盖了医学、生态环境及动植物研究。
iMeta 2024年热门下载论文合集
iMeta 2024年热门下载论文不仅包括SeqKit2、JCVI、Majorbio Cloud等生信工具及在线分析平台，也涵盖了医学、生态环境及动植物研究。
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/toc/10.1002/(ISSN)2770-596X.top-downloads-2024
01 SeqKit2：序列和比对数据操作的瑞士军刀
SeqKit2: A Swiss army knife for sequence and alignment processing
本文介绍已被广泛使用的序列分析工具SeqKit新的版本SeqKit2，它具有更多的功能、更高的性能并增加对更多压缩格式的支持。
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02 JCVI：用于比较基因组学分析的多功能分析套件
JCVI: A versatile toolkit for comparative genomics analysis
本研究开发了基于 Python 的多功能JCVI库，该库采用模块化设计，为格式解析、图形生成和基因组组装和注释操作等任务提供了非常实用的程序，使研究人员能够以更简洁的方式进行全面的基因组学分析。
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03 肠道菌群—芳香烃受体（AhR）轴介导桑黄多酚抗结肠炎作用
The gut microbiota-aromatic hydrocarbon receptor (AhR) axis mediates the anticolitic effect of polyphenol-rich extracts from Sanghuangporus
本研究证明了桑黄多酚（SH）通过调节肠道菌群有效减轻葡聚糖硫酸钠（DSS）诱导小鼠的结肠炎病理症状，揭示了基于SH和肠道菌群之间的相互作用开发结肠炎治疗策略的潜在途径。
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04 美吉生物云 2024：升级单细胞转录组和多组学云流程
Majorbio Cloud 2024: Update single-cell and multiomics workflows
本研究在已开发的美吉生物云 (https://cloud.majorbio.com/) 在线数据平台上发布了3款单组学云流程，2款多组学流程以及流程拓展工具助力多组学数据的挖掘和意义阐释。
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05 黑米饮食通过调节色氨酸代谢和激活AHR通路缓解结直肠癌发展
Black rice diet alleviates colorectal cancer development through modulating tryptophan metabolism and activating AHR pathway
本研究审查了富含膳食纤维和花青素的黑米饮食（BRD）的潜在抗肿瘤属性，结果表明BRD可能通过促进保护性肠道微生物组和代谢物谱来防止肠道肿瘤的发生；并且全谷物，特别是黑米主食具有巨大的潜在价值。
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06 合成微生物群落（SynComs）在提升土壤健康研究中的应用进展
Synthetic microbial communities: Sandbox and blueprint for soil health enhancement
本文回顾了SynComs 在改善土壤健康各方面的应用，总结了改善土壤健康的SynComs构建原则，讨论了SynComs 应用的下一阶段，包括构建更复杂、更综合的SynComs来解决目前简单合成菌群无法解决的科学和实际问题。
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07 鸭肠道微生物参考基因组及与肠道区域、发育阶段和饲养条件相关的菌群特征
Duck gut metagenome reveals the microbiome signatures linked to intestinal regional, temporal development, and rearing condition
本研究结果拓展了对鸭肠道微生物在肠段特定区域的分类学和功能上的理解，揭示了其在不同生长阶段的发展情况，以及受饲养条件影响的微生物组变化，突显了肠道微生物在家禽健康和生产中的重要作用。
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08 丁酸梭菌和碳水化合物活性酶有助于减少猪的脂肪沉积
Clostridium butyricum and carbohydrate active enzymes contribute to the reduced fat deposition in pigs
本文研究揭示了不同脂肪沉积表型金华猪肠道微生物丁酸梭菌（C. butyricum）和碳水化合物活性酶（CAZymes）功能之间的联系，为深入了解肠道微生物功能与宿主脂肪沉积的关联机制奠定了理论基础。
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iMeta封面
1卷1期
1卷2期
1卷3期
1卷4期
2卷1期
2卷2期
2卷3期
2卷4期
3卷1期
3卷2期
3卷3期
3卷4期
3卷5期
3卷6期
4卷1期
iMetaOmics封面
1卷1期
1卷2期
2卷1期
期刊简介
“iMeta” 是由威立、宏科学和本领域数千名华人科学家合作出版的开放获取期刊，主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述，重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊！相继被Google Scholar、PubMed、SCIE、ESI、DOAJ、Scopus等数据库收录！2024年6月获得首个影响因子23.8，中科院分区生物学1区Top，位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848)，微生物学科2/161，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆11/514！
“iMetaOmics” 是“iMeta” 子刊，主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任，是定位IF>10的高水平综合期刊，欢迎投稿！
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来源：微生物组