摘要：本综述梳理了16S rRNA基因扩增子测序方法的重要发展历程，总结了当前16S rRNA基因扩增子测序技术的特性和应用范围，还展望了这一领域未来技术发展的方向。
iMetaOmics 2024年亮点论文合集
iMetaOmics 2024年亮点论文包括测序技术、分析软件CPStools、肠道菌群和植物基因组学等方向。
iMetaOmics 2024年亮点论文合集链接如下：
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/toc/10.1002/(ISSN)2996-9514.highlights-2024
01 16S rRNA基因扩增子测序技术的“前世今生”
Long journey of 16S rRNA-amplicon sequencing toward cell-based functional bacterial microbiota characterization
本综述梳理了16S rRNA基因扩增子测序方法的重要发展历程，总结了当前16S rRNA基因扩增子测序技术的特性和应用范围，还展望了这一领域未来技术发展的方向。
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02 CPStools：专为叶绿体基因组设计的分析软件
CPStools: a package for analyzing chloroplast genome sequences
本研究开发的CPStools是一款专用于叶绿体基因组分析的用户友好型软件。CPStools集成了10个子命令，通过简化输入要求并自动化处理复杂流程，显著提高了叶绿体基因组分析的效率和准确性。
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03 比较多组学分析揭示品种对猪结肠宿主-微生物相互作用的影响
Comparative multiomics analyses reveal the breed effect on the colonic host–microbe interactions in pig
本研究揭示了嘉兴黑猪（JXB）和杜洛克×长×大（DLY）猪两个猪品种中肠道微生物群对宿主基因的共同调控和特定调控。
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04 微生物组与“同一健康”的联系
When the microbiome meets One Health principle: Leading to the Holy Grail of biology and contributing to overall well-being and social sustainability
本文深入探讨了微生物组与其宿主之间的复杂互动，揭示了它们对健康、营养循环和气候变化的重要影响。
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05 培养和非培养方法揭示特定细菌在人类皮肤老化中的作用
Culture-dependent and -independent approaches reveal the role of specific bacteria in human skin aging
本研究对来自中国人群的 822 份面部微生物样本及其相应部位的 14 种皮肤表型进行了关联分析，鉴定出多种与表型相关的微生物物种。随后从皮肤中分离出三种关键物种并使用其培养滤液与皮肤角质形成细胞、成纤维细胞互作，结果显示奥斯陆莫拉菌能调节胶原代谢、细胞外基质的组装、并参与多个细胞衰老过程。本项研究可为皮肤抗衰老干预提供新思路。
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06 STAGER 清单: 生成式人工智能可靠性的标准化测试和评估推荐
STAGER checklist: Standardized testing and assessment guidelines for evaluating generative artificial intelligence reliability
本研究发表的STAGER 清单是评估生成式人工智能（AI）可靠性的标准化测试和评估指南，有助于生成式人工智能在医学和生命科学领域的发展。如需简明清单请参阅附表或访问 GenAIMed.org。
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07 超级泛基因组图谱为二倍体棉种的进化提供基因组学见解
A super pan-genome map provides genomic insights into evolution of diploid cotton species
本研究针对二倍体棉种的泛基因组构建及综合分析，为理解二倍体棉种扩张过程中的动态基因组变异提供了洞见，并能促进现代棉花育种的有效性。
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08 先进糖蛋白质组学揭示了糖基化修饰在男性生殖的生理和病理过程中的作用
Developing glycoproteomics reveals the role of posttranslational glycosylation in the physiological and pathological processes of male reproduction
本研究总结了人类精液的糖蛋白组，目前对男性生殖系统及相关疾病中糖基化的认识，糖蛋白质组学方法的进展，以及最新糖蛋白质组学技术在男性生殖中的潜在应用。
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09 全球荟萃分析揭示了脊椎动物肠道微生物变异的驱动因素
Global meta-analysis reveals the drivers of gut microbiome variation across vertebrates
本研究收集了全球脊椎动物的16S rRNA和宏基因组测序样本，系统评估了全球脊椎动物的肠道微生物多样性及其影响因素，全面揭示了陆地脊椎动物肠道微生物与其同域土壤生物环境样本之间常见的抗生素抗性基因组及其潜在移动性。研究结果为全面了解外部环境因素如何影响脊椎动物肠道微生物组变异提供了新的证据。
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10 异形根孢囊霉接种剂对玉米内生细菌群落的积极影响
The active effect of Rhizophagus irregularis inoculants on maize endophytic bacteria community
本研究揭示了来源于双重离体培养体系中AMF接种剂的效用，为开发环境友好型接种剂奠定了基础。
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iMeta封面
1卷1期
1卷2期
1卷3期
1卷4期
2卷1期
2卷2期
2卷3期
2卷4期
3卷1期
3卷2期
3卷3期
3卷4期
3卷5期
3卷6期
4卷1期
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期刊简介
“iMeta” 是由威立、宏科学和本领域数千名华人科学家合作出版的开放获取期刊，主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述，重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。期刊特色包括中英双语图文、双语视频、可重复分析、图片打磨、60万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊！相继被Google Scholar、PubMed、SCIE、ESI、DOAJ、Scopus等数据库收录！2024年6月获得首个影响因子23.8，中科院分区生物学1区Top，位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848)，微生物学科2/161，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆11/514！
“iMetaOmics” 是“iMeta” 子刊，主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任，是定位IF>10的高水平综合期刊，欢迎投稿！
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来源：微生物组