杀菌剂作用机制研究及新型杀菌剂分子设计方面取得重要进展

摘要:粮食安全是国家安全的重要基础。近年来农作物真菌病害的重发频发对粮食生产构成严重威胁。据估计,全球每年因植物病虫害造成的农作物损失超过2200亿美元。杀菌剂是防控农业病原真菌最经济有效的手段。甲氧基丙烯酸酯类(strobilurin)杀菌剂是继苯并咪唑类、三唑类

粮食安全是国家安全的重要基础。近年来农作物真菌病害的重发频发对粮食生产构成严重威胁。据估计,全球每年因植物病虫害造成的农作物损失超过2200亿美元。杀菌剂是防控农业病原真菌最经济有效的手段。甲氧基丙烯酸酯类(strobilurin)杀菌剂是继苯并咪唑类、三唑类之后第三类具有重要里程碑意义的农用杀菌剂。该类杀菌剂作用于线粒体呼吸链bc1o位点,在细胞色素bL1之间的电子传递,影响三磷酸腺苷(ATP)产生,干扰病原菌体内的能量循环。该类杀菌剂具有广谱、渗透、快速分布等特点和较好的环境相容性,且耐雨水冲刷,持效期长,被广泛应用于真菌和卵菌的防治。吡唑醚菌酯(Pyraclostrobin,PYR)和嘧菌酯(Azoxystrobin,AZO)是该类代表性的杰出代表,其年销售额均超过15亿美元。然而,由于作用位点单一,植物病原菌对strobilurin类杀菌剂的抗药性日益严重,杀菌剂抗性行动委员会将该类杀菌剂归为高抗性风险杀菌剂。Metyltetraprole(MET)是由巴斯夫和住友化学共同开发的四唑啉酮类杀菌剂,被FRAC归为单独的一类新型Qo位点抑制剂。MET可用于防治对甲氧基丙烯酸酯类杀菌剂已产生抗性的病原菌,对多种真菌病害有较好的防效,包括重要的麦类病害(如小麦叶枯病)。然而,MET的作用模式和反抗性机制尚不明确。近日,绿色农药全国重点实验室(华中师范大学)杨光富教授团队在国际著名期刊《Journal of the American Chemical Society》上发表了题为“Cryo-EM Structures Reveal the Unique Binding Modes of Metyltetraprole in Yeast and Porcine Cytochromebc1 Complex Enabling Rational Design of Inhibitor”的研究论文。该研究采用冷冻电镜技术阐明了MET在真菌及哺乳动物复合物III中不同的结合模式。将MET与strobilurin类杀菌剂PYR的结合模式进行比对,首次从原子水平上阐明了MET的反抗性机制,揭示了四唑啉酮类新型药效团的重要性。在此基础上,通过计算化学方法对MET进行了结构优化,设计出了活性和选择性均更高的新型抑制剂YF23694。MET和PYR均属于芳基吡唑类化合物,两者化学结构很相似,最大的不同来自药效团部分。MET和PYR对真菌酵母复合物III均有较好的抑制活性,抑制常数Ki分别为0.92 nM和0.76 nM。进一步通过冷冻电镜解析了分别结合了MET(2.52 Å)和PYR(2.42 Å)的酵母复合物III结构,结果显示两个抑制剂均结合在Qo位点,结合模式相似(图1)。通过分子模拟对G143A突变后MET和PYR的结合模式进行研究,结果显示G143A突变后导致PYR的官能团翻转了180°,失去了与复合物III重要的相互作用,结合能大大降低。而MET由于官能团较小,突变前后结合模式几乎相同。这一结果为MET对G143A突变后的抗性菌株仍具有较好防效提供了合理的解释,也突出了四唑啉酮官能团的重要性。

图1. MET与PYR在酵母复合物III中的结合模式及抗性机制研究

此外,在抑制活性测定和光谱实验中发现MET对酵母和猪心复合物III的影响差异较大,推测MET可能在两个物种中的结合模式不同。为了验证该猜想,该团队进一步解析了MET与猪心复合物III的结构(2.53 Å),并与PYR(2.37 Å)进行了比对(图2)。令人惊奇的是,MET在猪心复合物III中同时结合于Qo和Q位点,在酵母中仅结合于Q位点。而PYR在猪心和酵母中都只结合在Qo位点。这也导致了MET对猪心和酵母的抑制活性差异较大,反映了MET具有更好的种属选择性。最后,团队在这些结构研究的基础上,借助计算化学对MET进行结构拆分和碎片筛选,设计合成了一系列四唑啉酮衍生物。其中YF23694显示出优异的酶抑制活性和种属选择性,并且杀菌活性结果显示在25 mg/L的剂量下,其对黄瓜白粉病的防治效果优于MET。这些研究结果为高活性和高选择性的复合物III杀菌剂的设计提供了新的思路。

图2. MET与PYR的结合模式比对及MET衍生物的设计

该工作得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金和国家博士后创新人才计划的支持。华中师范大学绿色农药国家重点实验室博士后望钰瑕、青年教师叶莺博士,博士研究生李志文和硕士研究生崔光睿为本文的共同第一作者,杨光富教授和朱晓磊教授为通讯作者。

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来源:中国农药工业协会

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