摘要：为了强调区域和细胞易感性在阿尔茨海默病中的重要性，转录组学改变可以在亚细胞、细胞和空间水平上得到解决。阿尔茨海默病单细胞和空间RNA测序数据库（ssREAD） 包括来自 144 个人类样本的数据和来自小鼠样本的 133 个数据集。ssREAD 中的数据集来自

为了强调区域和细胞易感性在阿尔茨海默病中的重要性，转录组学改变可以在亚细胞、细胞和空间水平上得到解决。阿尔茨海默病单细胞和空间RNA测序数据库（ssREAD） 包括来自 144 个人类样本的数据和来自小鼠样本的 133 个数据集。ssREAD 中的数据集来自 319 个小鼠数据集，展示了生成人类数据集的难度。从这些数据集中，ssREAD 可用于查询重要问题，包括使用数据集分析疾病组和对照组之间皮质层基因表达的亚群差异。最新研究表明ssREAD 还通过空间和单细胞转录组学的综合分析，揭示了细胞水平上阿尔茨海默病的性别差异。

来自美国俄亥俄州立大学Qin Ma团队认为，ssREAD 数据库满足了阿尔茨海默病领域对数据库的需求，该数据库可以将新兴的转录组数据集整合到一个用户友好的框架中。重要的是，ssREAD 提供的对这些丰富数据的访问可以指导用户进行正在进行或新出现的研究。另一方面，如果没有正确制定假设驱动的查询，对大量数据的访问可能会未得到充分利用或无效。假设驱动的查询（例如重点介绍的案例研究，其中研究了女性阿尔茨海默病与对照组之间特有的差异表达基因）使人们能够正确看待必须指导这一问题的文献驱动决策，包括选择哪个区域、关注哪种细胞类型以及深入研究哪种比较。在上述案例研究中，选择颞中回区域是因为它在早期阿尔茨海默病发病机制中起着重要作用。之所以选择兴奋性神经元、少突胶质细胞、小胶质细胞和星形胶质细胞等细胞类型，是因为人们对阿尔茨海默病领域感兴趣，并且它们与特定疾病功能的相关性，包括兴奋性神经元的细胞类型脆弱性。

文章在《中国神经再生研究（英文版）》杂志2026年 2月 2 期发表。

文章来源：Acosta D, Wang C, Ma Q, Fu H (2026) Utilizing Single-cell and Spatial RNA-seq databasE for Alzheimer’s Disease (ssREAD) in hypothesis-driven queries. Neural Regen Res 21(2):677-678. doi.org/10.4103/NRR.NRR-D-24-01201

来源：中国神经再生研究杂志