摘要:Science杂志上报道了研究者应用人工智能(AI)实现靶向 G蛋白偶联受体 (GPCR)设计、筛选与优化的最新成果,并首次报道了一系列具有 CXCR7抗体激动 活性的抗体。
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AI缩放术破解GPCR困局:千倍速筛出数万“药”匙
整理:Sonia
2025年5月12日,在
Science杂志上报道了研究者应用人工智能(AI)实现靶向 G蛋白偶联受体 (GPCR)设计、筛选与优化的最新成果,并首次报道了一系列具有 CXCR7抗体激动 活性的抗体。这意味着“未来或许可以人为开闭GPCR,从而控制细胞生物学和疾病状态”。大数据时代,AI用于药物设计的蓝图正缓缓铺开。医学界特整理文章精华内容,提供前沿思路。
图1 成果发表于
Science靶向GPCR抗体的开发困境:
难以击中的高价值靶标
GPCR家族庞大,扮演在细胞内外传递化学信息的重要角色。GPCR药物是临床应用最广泛的药物类别之一,涵盖心血管疾病、神经系统疾病、呼吸系统疾病、代谢疾病等多个领域,常见的β受体阻滞剂、血管紧张素受体拮抗剂(ARBs)、H2受体拮抗剂、GLP-1受体激动剂等,其作用靶点均属于GPCR家族。
尽管如此,由于GCRP家族庞大、构象动态变化,靶向GPCR的抗体开发依然进展相对缓慢。
表1 部分抗GCRP抗体
由此可见,靶向GPCR的抗体开发具有潜在的巨大临床价值和经济价值。
AI算法破局GPCR抗体设计筛选:
千倍速筛出稀有抗体
研究人员近期报道了一个令人兴奋的信息:他们的新AI在几个月内就产生了数十种靶向GPCR的候选抗体。
此次借用了一种称为“测试时间缩放”的想法,这是OpenAI为其大型语言模型ChatGPT开发的推理和迭代过程。通过这种算法,其AI设计了数以万计的GPCR结合抗体。其中数十种药物的“亲和力”可与需要数年时间开发的现有抗体药物媲美。
图2 AI设计的抗体(橙色)与细胞膜蛋白(绿色)的细胞外部分结合
随后的测试研究中,出现了AI设计的抗体的“第一次”:某种抗体可以打开细胞膜信号传导,而不是阻断。
在测试CXCR7抗体时,研究者发现:虽然大多数设计如预期抑制受体活性,但有两个抗体呈现稀有的受体激活能力。这是首个报道的CXCR7抗体激动剂激动剂。
用1个稀有激活剂抗体作为“引导”,研究者应用AI生成了相似的优化设计,无需重新训练模型,该方法成功产生700+个CXCR7结合抗体,其中348个显示激活功能,且激活剂性能甚至比肩CXCR7自然配体(进化耗时4亿年优化的结果)。
这意味一个惊人的含义,即在未来,或许可以通过药物控制GPCR的打开或关闭,实现控制细胞生物学和疾病状态。
AI布局抗体设计与筛选:缓缓铺开的蓝图
抗体在制药行业具有核心竞争力。但设计抗体的工作十分复杂,候选药物通常会经过多轮改进,以确保它们具有成熟药物的所有特性。
AI代表了一种加快发现过程的方法,正在被加速用于抗体药物开发。
今年2月,有研究者报告了AI辅助发现与所有毒株共有的流感蛋白结合的抗体,这一成就可能为通用流感药物开辟道路。该团队还报告了阻断艰难梭菌产生的强效毒素的抗体,这是一种常见且致命的医院获得性感染。
去年,有研究者报告了一种能够与所有HIV毒株上称为“破火山口区域”的蛋白质靶标结合的抗体,这意味着它可能导致一种针对HIV的通用抗体药物。
参考文献:
[1]https://www.science.org/content/article/ai-conjures-potential-new-antibody-drugs-matter-months
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本文来源:医学界肿瘤前沿
责任编辑:Sheep
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来源:科技公式