摘要:5月22日,上海发布《关于进一步深化改革创新加快科技服务业高质量发展的若干意见》(以下简称《若干意见》),聚焦强主体、补链条、改机制,推出了16条举措,共计39项任务的改革组合拳,着力推进科技服务业高质量发展。
5月22日,上海发布《关于进一步深化改革创新加快科技服务业高质量发展的若干意见》(以下简称《若干意见》),聚焦强主体、补链条、改机制,推出了16条举措,共计39项任务的改革组合拳,着力推进科技服务业高质量发展。
其中提到,数据是科研的重要“原材料”,对于如何破解“数据孤岛”问题,《若干意见》提出:探索试点“科学数据银行”模式。
生物芯片上海国家工程研究中心有望成为这种模式的先行者。中心主任郜恒骏说:“我们在设计多种数据驱动的途径和方式,将在建设‘科学数据银行’过程中,把生物样本快速转化为数据产品,应用于临床和生物医药产业。”
上海科创集团始终牢记科创策源先行者和排头兵的使命,致力于成为上海国投系科创策源的主力军!本期上海国投科创故事,将带我们一起走进上海科创集团陪伴了20多年的生物芯片上海国家工程研究中心——存储人体组织、细胞和血液的科学数据银行。
引言
生物医药作为上海三大先导产业之一,是培育新质生产力的重要阵地。2019年至2023年,上海生物医药工业总产值年复合增长率达9%。2024年,上海国产1类创新药获批数量,位居全国第二;第三类医疗器械获批数量位列全国第一,凸显其行业引领地位。
当下,以数据为驱动的人工智能技术加速演进,细胞与基因治疗、精准医疗等生物医药新兴赛道成为竞争焦点,作为可靠数据的来源与成果转化的基石,生物样本的“含金量”日渐提升。
在上海张江李冰路上,就有这样一座“宝库”。《自然》杂志报道其为中国最大的生物样本库,总部总储存能力达1500万份,在全国还设有8个省市级分中心。
在这座“宝库”起步的2001年,上海科创集团扮演了重要角色,直至今天,它仍然是其第一大股东。一路走来,见证它从15平方米的“小屋”发展到占地60亩的“大院”;从毫无章法到发布生物样本国家标准22个;从默默无名到其成果获国际共识的认可与推荐。
“一切以患者为中心”“一切以健康为中心”。这是一群“国芯人”筚路蓝缕打造这座“宝库”的初心,更是其源源不断产出优质科研成果的起点,在面向国家重大需求、面向人民生命健康的主战场上,上海科创集团的前瞻布局更显高瞻性,也愈发凸显其战略价值。
廿载追梦:
从废弃样本到黄金资源
“扔掉样本,就是扔掉黄金。
国家中心的研究方向,
一定是临床所需,能解决患者问题的。”
2001年7月1日下午,刚刚参加完上海第二医科大学博士毕业典礼的郜恒骏来到了张江:一片农田蛙声的科创“热土”。
这一天,他放弃了临床消化科医生、科负责人、学科带头人的正常成长路径,在一间15平米的小屋里开始了“生物芯片上海国家工程研究中心(以下称“国家中心”)”的创业之路,从市内到达张江终点站的地铁也成了他的“专列”。促使他做了这个决定的原因很多:有对陈竺老师那堂“人类基因组计划的机遇与挑战”课的念念不忘;有行医15年仍然想要创新的冲动;也有打造中国生物样本库的豪情壮志。
郜恒骏接触过数不清的样本,目睹术后生物组织被丢弃,他深感惋惜——这些样本蕴含的疾病信息本可以为研究提供关键支撑,但受限于保存条件与临床工作压力,其价值长期未被挖掘。
2003年3月,“国家中心”由国家发展改革委员会批准成立,总投资2.9亿人民币,其中上海科创集团投资累计8900万,致力于打造我国组学、高通量生物芯片与分子医学领域的“国家队”。这些成果可以让诊治从一个病人,到诊治一个群体,从规范治疗走向早筛早诊,而无数病人将因此得益。
“国家中心”的建立也标志着“上海生物样本库”启动建设。从此,人体组织、细胞、血液及肠道微生物菌群不断从上海乃至全国各地送来,一块芯片上集纳了组织细胞形状、结构、大小、来源,乃至患者家族史、生活习惯、临床资料等海量数据。而在“国家中心”也不断有样本被取出,用于基础、临床与转化研究。
截至目前,上海生物样本库已建设成物权明晰、集约化、标准化、专业化、自动化、智能化、数据化、高度安全的第三方生物样本资源平台。
筚路蓝缕:
从行业空白到国际标杆
“制定标准,开头很难,但再难也要做。
因为标准是生物样本在采集、运输、记录、
研究乃至伦理方面的一把‘尺子’,
让高质量数据产生成为可能。”
说到建立上海生物样本库的历程,郜恒骏吐出三个字——酸、苦、辣。生物样本的质量直接关系研究成果的好坏,上海生物样本库建立初期,由于缺乏统一标准,样本质量堪忧,严重阻碍了我国生命科学创新研究与生物医药产业发展。
从2007年组织开始,“国家中心”开启标准化拓荒之路,相继实现行业标准、国家标准与国际认可三大突破。为找到生物样本的“最大公约数”,郜恒骏调研了2000多个生物样本项目,还调研了全国69家医院。他还多次赴京协调,并最终促成中国医药生物技术协会组织生物样本库分会成立,2011年他又牵头发布首个中国医药生物技术肿瘤生物样本库行业标准。
郜恒骏在推动行业标准建设的基础上,进一步向国家级标准迈进。2015年,他推动成立全国生物样本标准化技术委员会,并牵头推进国家CNAS组织制定生物样本认可准则。
2020年生物样本库认可制度提得到APAC高度认可,为全球生物样本库认可贡献中国智慧和中国方案。
过去,我国的生物样本标准在国际上默默无闻,国家中心的做法在国际上打响了知名度。2018年,我国生物样本认可准则,获国际实验室认可合作组织(ILAC)认可;同年,由我国作为共同召集人组织制定的生物样本库首个国际ISO标准发布。
迄今,“国家中心”已主导发布国际标准1项、国家标准22项、行业标准6项,主编专著5部,推动中国生物样本标准跻身国际前列。
这条从无到有、从国内走向国际的开拓之路上,国家中心培养了10000多名专业技术人才,包括上岗资质、内审员、标准工程师等,郜恒骏也获得2025年国际生物及环境样本库协会(ISBER)杰出贡献奖。
转化突围:
从“中国观念”到“全球推荐”
“让海量沉睡的样本‘数’起来,
让‘数’起来的样本‘活’起来,
让‘中国方案’在国际舞台上唱响,
在未来个性化精准医疗中发挥更大的作用。”
从“国家中心”建立之初,就围绕着“一切以患者为中心”的宗旨,打造了一套CBDTM临床转化发展模式,逐步打通了“需求—样本—数据—产品—商品”的转化链。
“研究幽门螺杆菌,远离胃癌”是郜恒骏做得最持久的一件事,连接了他作为消化科医生的近40年时光。在他看来,想要研究幽门螺杆菌与胃癌的关系,就需要获得幽门螺杆菌感染的胃粘膜样本;想要防控胃癌,最有效可控手段就是根除幽门螺杆菌,想要杀死幽门螺杆菌,需避免使用耐药抗生素,就需要耐药菌株库开展研究。2017年,“国家中心”牵头组建中国幽门螺杆菌分子医学中心,打造了近4万例幽门螺杆菌及耐药菌株库的样本库。
在研究中,郜恒骏发现不同地区的患者,幽门螺杆菌的耐药菌株也不一样。由此,“国家中心”提出幽门螺杆菌“地区诊疗个性化”的“中国观念”。2021年,他的这一研究被世界肠胃病学组织(WGO)列入全球指南推荐。基于一线治疗关键抗生素试剂盒,提出幽门螺杆菌根除治疗“首战即决战”的“中国方案”,获得2022马斯特里赫特VI国际共识的认可与推荐。
截至目前,围绕为患者消灭幽门螺杆菌这一初衷,“国家中心”已成立中国幽门螺杆菌分子医学中心全国分中心及协作中心65家特色门诊。2024年,首个幽门螺杆菌-AI垂直大模型发布并应用。
郜恒骏认为,我国人口多、疾病多,遗传资源极其丰富又各具地方特色,在中国建立生物样本库具有得天独厚的优势。随着人工智能技术的迅猛发展,数据变得尤为重要,在各地建立生物样本库也成为必然趋势。
以患者为中心,重在服务,更重在落地与转化。CBDTM与临床转化医学的融合与整合,极大地促进了新型临床医学学科建设的健康与可持续发展。除幽门螺杆菌外,助力肝癌早筛的家庭自测产品“爱福陪”进入国家重大专项成果全国示范区工程。
随着数据驱动的人工智能时代加速到来,“国家中心”正在迎来成果转化的“黄金时代”。郜恒骏表示,“国家中心”未来将更关注“活的样本”和“数据驱动”,带领更多“中国观念”“中国方案”走向全国、影响全球。
来源:金台资讯