Olex2-不填好过瞎填

360影视 日韩动漫 2025-06-28 15:24 3

摘要:最近遇到一些小伙伴委托帮忙处理的数据,有些人在Systematic Name填了“CCD”(charge - coupled device,电荷耦合器件——单晶仪探测器类型),如 图2 所示。

所示,Olex2 中Work选项卡下Report展开栏有一个Crystal,其下有一个Systematic Name。

▲图1 Work>>Report>>Crystal>>Systematic Name

最近遇到一些小伙伴委托帮忙处理的数据,有些人在Systematic Name填了“CCD”(charge - coupled device,电荷耦合器件——单晶仪探测器类型),如 图2 所示。

▲图2 Systematic Name处错误填写的探测器类型缩写

还有些人则填了晶系,如 图3 所示。

▲图3 Systematic Name处错误填写的晶系名称

从上述两个案例能知道,在Olex2中“Work>>Report>>Crystal>>Systematic Name”填写的内容被写入到CIF [2] _chemical_name_systematic ( char ) IUPAC or Chemical Abstracts full name of the compound. 化合物的IUPAC或化学文摘全名。 Example: ‘1 - bromoestra - 1,3,5(10) - triene - 3,17\b - diol’. 示例:‘1 - bromoestra - 1,3,5(10) - triene - 3,17\b - diol’. [chemical] [chemical]

所以说Olex2中“Work>>Report>>Crystal”下的Systematic Name指的是化合物的系统命名,即使用系统命名有机化合物的方法(IUPAC命名法,IUPAC = International Union of Pure and Applied Chemistry = 国际纯粹与应用化学联合会)得到的化合物名称,不是什么探测器的类型或者晶系。

如果不知道Olex2中可填写项目的含义,可以随便填个字符串,然后在CIF中找到对应条目,然后查阅CIF词典,否则的话就空着不填,总比瞎填要好。 ”),否则的话就空着不填,总比瞎填要好。

[3] 主页底部点击“CIF dictionary”超链接进行查看,如 图4 所示。

▲图4 CheckCIF主页底部的“CIF dictionary”超链接

参考文献

[1] Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution, Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009 , 42 , 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.

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来源:颖颖课堂

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