摘要:· 有时认可的基因/蛋白质的名称或符号已经不再有效。这种情况下,第一次提到的基因/蛋白质,需要先列出经批准的名称,然后再添加 括号说明 (以前被称为 XXX)。例如,「我们使用抗 POU5F1 蛋白的抗体 (以前称为 OCT-4)...」。注意使用正确的符号,
1 一般规则
· 在你的文章中使用大家都认可的基因/蛋白质的名称和符号 (见下文)
· 有时认可的基因/蛋白质的名称或符号已经不再有效。这种情况下,第一次提到的基因/蛋白质,需要先列出经批准的名称,然后再添加 括号说明 (以前被称为 XXX)。例如,「我们使用抗 POU5F1 蛋白的抗体 (以前称为 OCT-4)...」。注意使用正确的符号,而不是以往的名称。
2 不同物种有不同的规则
1) 小鼠 / 大鼠 / 鸡
(1) 一般命名规则 (适用于小鼠,大鼠和鸡):
· 基因的全名不用斜体,也不用希腊字母
例如:insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子 1)
· 基因符号不用希腊字母和连字符,使用斜体,第一个字母大写,其余小写
例如:Igf1 (斜体)(胰岛素样生长因子 1)
· 蛋白质的名称和基因符号相同,但不用斜体,并全部大写
例如:IGF1
· mRNA 和 cDNA 的基因符号和规定的格式
例如:"... levels of Igf1 (italicized) mRNA increased when..."
· 首次提到的突变等位基因应该详细列出
例如:Igf1tm1Arge/Igf1tm1Arge (italicized) is one of several knockout alleles of Igf1 (italicized)
· 所有字母和数字用斜体,等位基因的符号 (tm1Arge) 要用上标
· 经前面详细描述之后,敲除的纯合子可表示为 Igf1-/- (所有字母均用斜体,并且- / -用上标);杂合子为 Igf1 + / - 等。
(2) 对于这些命名规定的详细信息,请参阅:
· (小鼠,大鼠,鸡) http://www.informatics.jax.org/
· (专门针对大鼠) http://rgd.mcw.edu/
· MGI 命名:http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/index.shtml
· 基因的 MGI 快速指南:
2) 人类/非人类灵长类动物/家畜/ 除了小鼠、大鼠、鱼、昆虫、苍蝇外默认的其他物种
· 完整的基因名称不用斜体和希腊字母
· 基因符号不使用希腊字母和连字符,基因符号用斜体,所有的字母用大写
例如:IGF1(斜体)
· 蛋白质的名称与基因符号相同,但不用斜体,并全部大写
例如:IGF1
例如:"... levels of IGF1 (italicized) mRNA increased when..."
更多关于此类物种基因 (突变的等位基因) 命名规则和符号的网站:
3) 鱼 (适用于所有的鱼)
· 完整的基因名称用斜体表示,全部用小写字母,不要用希腊字母
例如:cyclops(斜体)
· 基因符号用斜体,全部小写
例如:cyc(斜体)
· 蛋白质命名与基因符号相同,但仅首字母大写,也不用斜体
例如:Cyc
http://zfin.org/cgi-bin/webdriver?MIval = aa-ZDB_home.apg
4) 其他有用的网站:
· ExPASy(特殊蛋白质分析系统):是瑞士生物信息学研究所 (SIB) 提供的蛋白质组学服务系统,可对蛋白质序列和结构以及二维 PAGE 进行分析:(http://au.expasy.org / )
· OMIM -孟德尔人类遗传学数据库:
(www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db = OMIM )
· NCBI - Entrez Gene:提供了一个按序列和/或在 NCBI's Map Viewer 中查询基因的统一环境。您可以查询名称,符号,加入,出版物,GO 条款,染色体数目,EC 号码,和许多其他相关基因及它们的编码产物。(www.ncbi.nlm.nih.gov/gene )
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来源:才联科学圈