摘要：实验室将以宏基因组/微生物组方法开发（图1）为立足点，重点关注三代测序和微生物单细胞等新技术，解析人体基因组、菌群与食品营养三者的互作关系（图2），为综合利用功能食品和肠道菌群提升人类健康而努力，并打造中国特色的科学传播体系（图3）。
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刘永鑫组简介
发表文章详见：
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Yong-Xin-Liu-2
WOS: https://webofscience.clarivate.cn/wos/author/record/1891953Google: https://scholar.google.com/citations?user=NoxNy_IAAAAJ
研究方向
实验室将以宏基因组/微生物组方法开发（图1）为立足点，重点关注三代测序和微生物单细胞等新技术，解析人体基因组、菌群与食品营养三者的互作关系（图2），为综合利用功能食品和肠道菌群提升人类健康而努力，并打造中国特色的科学传播体系（图3）。
图1. 宏基因组研究方法开发。
宏基因组领域现有的方法仍然处于初级阶段，需要不断地进行改进和创新。扩增子已经有3套引用过万的成熟流程，目前仍缺少标准化的宏基因组分析和可视化流程，开展相关工作有利于全面推动本领域发展并争存国际制高点。动植物微生物组研究，都会受到大量宿主污染的困扰，解决高宿主含量样本微生物富集去宿主的困难，将极大拓展宏基因组研究的应用边界。之前的研究是单一组学为主，正在向多组学转变，开发和优化多组学整合分析将更好地恢复微生物组的真实面貌，发现生物学规律的真相，更准确地回答科学问题。
图2. 人体基因组、菌群与食品营养的关系。
近些年的研究表明肠道微生物可能通过其代谢分子影响人类健康，解码微生物基因组对揭示其潜在的功能非常重要。过去10年，全球已发表上万个样本肠道菌群宏基因组测序，以及挖掘的20余万个宏基因组组装基因组，为一些功能菌的挖掘、变化规律的验证提供了一定的数据基础。但这些数据目前仍停留在数据阶段，绝大多数的功能未知，需要更系统的数据库组织形式、挖掘和新方法的出现来解析其中的功能微生物和基因，以便更好理解微生物组在人类营养和健康中的作用，从而推动基于肠道菌群与精准食品营养学发展。
图3. 微生物组科学传播体系构建：综述、专著和期刊
A. 综述微生物组数据分析方法 (Protein Cell, 2021高被引，2023)，助力同行快速理解并开展分析。B. 综述植物微生物组功能研究体系(Current Opinion in Microbiology, 2019)。C. 联合同行编写《微生物组实验手册》，打造本领域持续更新的中文方法百科全书。D. 发起微生物组领域高起点新刊iMeta(目标前10%，IF 23.7)，构建全球华人主导的本领域国际话语权体系，解决本领域期刊出版的卡脖子问题。
招聘者期待
招收博士后3名，副研2名
1. 研究背景
分析背景的申请者有生物信息学、宏基因组学、细菌基因组学、三代测序分析、转录组、代谢组或其它组学(DNA, RNA, ChIP sequencing)分析研究的背景之一；
2. 学习并深度掌握新知识新技术的能力，对课题组研究方向感兴趣，有很强的自我驱动能力；
3. 独立性并适应合作环境。
4. 学历和论文要求：近三年内获得博士学位，以第一作者发表中科院二区及以上论文1篇，有较好的英文阅读和写作能力。
5. 发表1-2篇IF>10的高水平论文，有基金撰写经验者优先考虑。
6. 副研究员至少要求第一/通讯作者发表IF>10的论文2篇，且有主持国自然青年基金。
你能得到什么
入职以后，你会有以下独特的提升机会：
1.学习宏基因组学测序和分析技术，并深入学习我们的经验；
2.丰富的基础、农业/食品和临床菌群样本和经验丰富的合作者；
3.在一个开放的有很多新机遇的宏基因组学研究中创新和发现；
4.研发开创性的技术并将其应用到深度发掘各种形式的菌群(人类、动物、植物样本)和它们的宏基因组，研究菌群与宿主和不同食品之间的相互作用；
5.非常具有竞争力的工资待遇，以及位于单位所属公寓的廉租待遇；
6.发表高水平/高影响力论文，过去3年人均以第一/通讯(含共同)发表IF>20的论文3篇。
薪资待遇
普通博后待遇超过全国90%以上副研；优秀博后(Top 50%)优于全国90%以上正研。副研究员待遇远高于北上广教授平均水平。
博士后：基因组所标准博后待遇+深圳市博士后补贴(36万免税)
食堂补贴：每月饭卡补贴600元。
优秀博后：如3篇1区或成功申请基金等可申请大鹏区D类人才补贴，金额36万，分12万x3年发放。
项目绩效：博士后独立主持国自然青年、博后基金等项目，课题组配套一定比例作为绩效工资
农科院优农/优秀博士后：文章基础较好的优秀博后入站当年可申请农科院优农特别资助10万*2，重点资助8万*2，或专门资助6万*2；有较好成果和基金的博后可申请优秀博后5万元个人奖励(组内出站博后己获得)。
海外博后计划：世界排名前200大学的海外博士入站还有广东省额外12万x2年的补贴
具体金额可根据入选者背景、潜力面谈，一事一议
附深圳博后政策：
按照深圳市、大鹏新区相关规定，博士后在站期间享受在站博士后生活补贴，具体金额以政府最新规定为准。
按照研究所的相关规定提供博士后的工资、五险一金和绩效待遇。
符合条件的，可申请"博士后创新人才支持计划"、"博士后国际交流计划派出项目、引进项目"。
博士后人员进站后，可选择落户深圳市，其配偶及未成年子女可办理随迁入户。
符合条件的博士后可申请评定专业技术资格。
提供良好的工作环境和充足的研究经费，配备研究需要的设备和仪器，科研方向给予较高自由度。
申请方式
邮件主题和附件请注明“姓名+现单位/毕业院校+申请职位”。
申请者请将Word版个人简历，包含照片、个人简介、教育经历、研究经历、论文发表(附WOS/Google Scholar/ResearchGate主页链接)、优势及成果自述（
所有应聘材料我们将会严格保密，课题组会在收到申请的3天内与初审合格者微信或E-mail联系，安排面试。
生活日常
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团队合影健步走第二名
户外活动登顶梧桐山
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1月10-12日，单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源
2月21-23日，家系、肿瘤临床基因组/外显子组数据分析
3月21-23日，高级转录组分析和R语言数据可视化
3月28-30日，第二届全国基因组信息学大会
4月11-13日，微生物组-扩增子16S分析
5月11-13日，微生物组-宏基因组分析
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来源：微生物组
