MolBoolean:新一代原位蛋白互作定量技术

360影视 动漫周边 2025-03-14 12:01 2

摘要:确定蛋白互作水平对于分析细胞内的信号传导、蛋白质功能和激活等至关重要。传统方法(如FRET、PLA)无法区分蛋白的游离态与结合态,存在信号弱、背景噪音高等问题。MolBoolean™技术由 Atlas Antibodies 公司开发,可同时对组织和细胞中两个蛋

转自:优宁维抗体专家

确定蛋白互作水平对于分析细胞内的信号传导、蛋白质功能和激活等至关重要。传统方法(如FRET、PLA)无法区分蛋白的游离态与结合态,存在信号弱、背景噪音高等问题。MolBoolean™ 技术由 Atlas Antibodies 公司开发,可同时对组织和细胞中两个蛋白靶标进行原位邻近分析。与传统方法不同,它能够同时检测游离态和结合态的蛋白(检测范围约40纳米),提供蛋白互作的空间定量分析。

技术特点

全面的空间定量分析:同时检测游离态和结合态的蛋白,提供完整的蛋白互作定量分析。

精准定量:通过将互作数据与总蛋白水平进行归一化处理,确保定量结果的准确性。

无需基因改造:无需对蛋白质进行基因工程改造,直接在天然细胞和组织中检测,数据更贴近真实生物学状态。

超灵敏检测:借助滚环扩增(Rolling Circle Amplification, RCA)技术,荧光信号增强1000倍,能够检测到低丰度蛋白质。

灵活通用:适用于多种研究需求,用户可自行选择一抗与其搭配使用。

细胞和组织均验证有效:适用广泛。

应用举例

01

MCF7细胞E-Cad/ β-Cat的MolBoolean染色

对MCF7细胞中E-cadherin与β-catenin的进行检测,图像显示了游离蛋白与相互作用蛋白的比例相对定量,通过在单个或两个荧光通道中检测滚环扩增产物(RCPs)来实现:32%为游离E-钙粘蛋白(品红色),19%为游离β-连环蛋白(绿色),49%为E-钙粘蛋白/β-连环蛋白复合物(白色)。数据已归一化至总目标蛋白水平(总RCPs)。

02

MCF7细胞的EMD/LMNB1 的MolBoolean染色

使用Atlas Antibodies AB的抗EMD抗体和抗LMNB1抗体,对MCF7细胞中EMD(品红)与LMNB1(绿色)的互作进行检测。图像通过单/双荧光通道检测滚环扩增产物(RCPs),直观显示游离态与互作态蛋白的空间定位。

03

人肾脏ACE2/TMPRSS2的MolBoolean染色

利用MolBoolean™技术分析人肾脏组织中ACE2与TMPRSS2的相互作用。

图像显示了游离蛋白与相互作用蛋白的相对定量,通过在单个或两个荧光通道中检测滚环扩增产物(RCPs)来实现:51%为游离ACE2(品红色),17%为游离TMPRSS2(绿色),32%为ACE2/TMPRSS2复合物(白色)。数据已归一化至总目标蛋白水平(总RCPs)

04

人结肠SATB2/HDAC1 的MolBoolean染色

使用Atlas Antibodies AB的抗SATB2抗体和抗HDAC1抗体,对人结肠中SATB2(品红)与HDAC1(绿色)的互作进行检测。图像通过单/双荧光通道检测滚环扩增产物(RCPs),直观显示游离态与互作态蛋白的空间定位。

检测原理

MolBoolean™小鼠/兔试剂盒使用两种不同的免疫荧光检测报告分子,最大发射波长分别为590纳米(ATTO565,使用TxRed滤光片或类似)和664纳米(ATTO647N,使用Y5滤光片或类似)。用户可自行选择一抗(抗小鼠/兔),利用抗小鼠和兔的二级邻近探针以及滚环扩增(Rolling circle amplification ,RCA)技术来放大信号,无需特殊设备,常规荧光显微镜即可完成成像。配套分析软件自动分割荧光信号,对样本中两种分析蛋白靶标的游离态与结合态的比例进行相对定量。

操作步骤

MolBoolean™ 检测为期2天,包含7个步骤,用以确定目标蛋白是否相互作用(形成AB复合物)或单独存在(A或B)。

第1天(2小时):封闭反应并孵育初级抗体。

第2天(7-8小时):探针结合、标记、扩增和检测。

1.邻近探针与附着在蛋白上的初级抗体结合。

2. 邻近探针与DNA环相连。

3. DNA切割为DNA标记做准备。

4. 添加标记寡核苷酸以标记蛋白。

5. DNA连接将DNA片段连接起来。

6. 滚环扩增(RCA)增强信号,便于检测。

7. 检测揭示相互作用和单独存在的蛋白。

试剂盒组分及规格

MolBoolean™试剂盒包含15个独立的组分:酶(切口酶、连接酶、聚合酶)、缓冲液、用于标记和检测的寡核苷酸、二级抗体探针以及封闭剂和稀释剂等,总体积为4.8毫升,足够进行大约120次细胞实验(每次实验40微升)和60次组织实验(每次实验80微升)。

用户可以自行挑选一抗(小鼠/兔)与MolBoolean试剂盒搭配使用。需要注意的是,一抗特异性可能会影响MolBoolean结果的准确性,因此建议选择特异性更强的一抗,例如Atlas antibodies公司的产品。

发表文献

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1. Rivas-Santisteban R, et al, (2024) GPR88 impairs the signaling of kappa opioid receptors in a heterologous system and in primary striatal neurons. Neuropharmacology. 2024 Nov 27:110242. doi: 10.1016/j.neuropharm.2024.110242. Epub ahead of print. PMID: 39613254.

2. Kotliar IB, et al, (2024) Multiplexed mapping of the interactome of GPCRs with receptor activity-modifying proteins. Sci Adv. 2024 Aug 2;10(31):eado9959. Epub 2024 Jul 31. PMID: 39083597; PMCID: PMC11290489.

3. Malmqvist M, et al, (2024) Quantifying dopamine D2 and adenosine A2A receptor interactions in rat brain using MolBoolean™ technology. #8217 Society for Neuroscience, SfN, (2024).

4. Raykova D, et al, (2023) A method for Boolean analysis of protein interactions at a molecular level. Nat Commun. 2023 Sep 6;14(1):5450. doi: 10.1038/s41467-023-41325-3. Erratum for: Nat Commun. 2022 Aug 13;13(1):4755. doi: 10.1038/s41467-022-32395-w. PMID: 37673885; PMCID: PMC10482831.

5. Rivas-Santisteban R, et al, (2023) Boolean analysis shows a high proportion of dopamine D2 receptors interacting with adenosine A2A receptors in striatal medium spiny neurons of mouse and non-human primate models of Parkinson’s disease. Neurobiol Dis. 2023 Nov;188:106341.doi: 10.1016/j.nbd.2023.106341. Epub 2023 Oct 31. PMID: 37918757.

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来源:新浪财经

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