摘要:与稿件一起提交审阅的图像应经过最少的处理。而针对于某些实验、领域和技术,在不可避免的情况下,一定程度的图像处理是可以接受的,但最终图像必须能够正确反映原始数据。
专家意见:The figure is a bit ambiguous as the green arrow reads like “cell differentiation”.
译文:该图有点模糊,因为绿色箭头所指看起来像 “细胞分化”。
编辑解读:
与稿件一起提交审阅的图像应经过最少的处理。而针对于某些实验、领域和技术,在不可避免的情况下,一定程度的图像处理是可以接受的,但最终图像必须能够正确反映原始数据。
在同行评审过程中,编辑可能会要求提供未经处理的数据文件,以帮助稿件评审;如果这些数据无法按要求提供,编辑可能需要停止同行评审过程,直到问题得到圆满解决。在回应已发表论文可能出现的发表后问题时,编辑也可能要求提供未经处理的数据。如果无法获得未经处理的数据,解决发表后的问题就会很困难。因而建议在论文发表后保留未经处理的数据和元数据文件,最好将数据永久存档。具体如何向国际期刊提交未经裁剪的 Western blot原始图像可参见:https://mp.weixin.qq.com/s/TXNrT5Ai7kEiy435Itm4sw.
以下指导原则旨在帮助准确呈现图像数据。作者还必须注意避免在数据采集过程中出现错误表述。在“方法”中需要列出所用的所有图像采集工具和图像处理软件包,并记录关键的图像采集设置和处理操作。
1. 不同时间或不同地点采集的图像不应合并为一张图像,除非说明所产生的图像是时间平均数据或延时序列的产物。如果必须将图像并列,则应在图中明确划分边界,并在图例中加以说明。
2. 不得使用修饰工具,如 Photoshop中的克隆和修复工具,或任何故意掩盖操作的功能。
3. 适度调整亮度和对比度。对比度的调整不应使数据消失。过度的处理,如牺牲其他区域而强调图像中的某一区域,以及相对于对照组强调实验数据,都是不恰当的。
电泳凝胶和印迹
-强烈不建议对不同凝胶/印迹上的样本进行定量比较;如果不可避免,则必须在图例中说明样本来自同一实验或平行实验,且凝胶/印迹是平行处理的。
-对于凝胶中不相邻的重新排列的泳道,必须以划定泳道之间界限的方式清楚标明。重新排列的泳道应在图例中注明。
上样对照(如 GAPDH、actin)必须在同一印迹上进行。如果样品处理对照在不同的凝胶上进行,则必须在图例中注明。论文中裁剪过的凝胶必须保留所有重要条带。
-不鼓励使用高对比度凝胶和印迹,因为过度曝光可能会掩盖其他条带。
-WB重复的结果应提交以供审查。重复的次数应在图注中清楚地标明。
作者在撰写稿件时应注意以下几点:(1)检查图片是否重复;(2)检查印迹和凝胶是否拼接了泳道;(3)确保提供的未处理扫描图与数字相符。
显微镜
调整应适用于整个图像。应避免阈值处理、扩大或缩小信号范围以及改变高信号。如果使用了“伪着色”和非线性调整(如 “伽马变换”),则必须予以说明。有时需要对“合并”图像的各个颜色通道进行调整,但应在图例中注明。
鼓励在稿件中加入以下内容以供发表:
-在 “方法 ”中说明所用设备的类型(显微镜/物镜、相机、探测器、滤光片型号和批号)以及采集软件。尽管不同仪器之间存在一些差异,但也应列出关键测量的设备设置。
-鼓励提供原始图像文件(包括相关元数据,例如:采集信息,包括时间和空间分辨率数据(xyzt和像素);图像位深度;实验条件,如温度和成像介质;以及荧光色谱(激发和发射波长或范围、滤光片、二色分光器(如有))。
-应提供显示查找表(lookup table,LUT)以及 LUT 与位图之间的定量映射,尤其是在使用彩虹伪彩色时。如果 LUT 是线性的,并且覆盖了整个数据范围,则应说明。
-处理软件应在方法部分注明名称,并在相关图例中注明任何操作(如解卷积类型、三维重建、表面和体积渲染、“伽马变换”、过滤、阈值和投影)。
-作者应说明获取图像时的分辨率,以及提高图像分辨率的任何下游处理或平均值。
来源:中国组织工程研究杂志