Nature | 核小体纤维拓扑结构引导转录因子与增强子结合
转录因子(TF) 在基因顺式调控元件 (如增强子) 上的组合对于细胞类型特异性基因表达至关重要【1】。在细胞重编程过程中,特定的转录因子组合能够将细胞从一种类型转化为另一种类型。例如,OSKM (OCT4、SOX2、KLF4、MYC) 组合能够将体细胞转化为诱
转录因子(TF) 在基因顺式调控元件 (如增强子) 上的组合对于细胞类型特异性基因表达至关重要【1】。在细胞重编程过程中,特定的转录因子组合能够将细胞从一种类型转化为另一种类型。例如,OSKM (OCT4、SOX2、KLF4、MYC) 组合能够将体细胞转化为诱
最新一项发表在Nature的工作提出“指导寻找模型(guided-search model)”,认为转录因子并不是随机“碰到”高亲和的motif,而是以组合的方式识别呈递在核小体串3D结构上的motifs,并在这些核小体串的“指导”下定向移动到附近的增强子[2
SWR1复合物是一种多亚基ATP依赖的染色质重塑复合物,在酵母中具有独特的功能,可以将核小体中的H2A-H2B二聚体替换为变体Htz1-H2B二聚体【1-3】。Htz1-H2B二聚体的插入能改变核小体的结构,提高染色质的动态,有助于特定基因的激活【1-3】。然