Nat. Commun. | 首个作物全基因组多靶向CRISPR文库,破解多基因功能冗余研究难题
遗传变异对育种计划和突变体筛选至关重要,但传统诱变方法受限于基因冗余和靶向特异性不足。CRISPR-Cas9虽能实现精准基因编辑,但在作物改良中的规模化应用仍面临挑战。本研究在番茄中构建了全基因组多靶向CRISPR文库,通过设计15,804个独特单导RNA(s
遗传变异对育种计划和突变体筛选至关重要,但传统诱变方法受限于基因冗余和靶向特异性不足。CRISPR-Cas9虽能实现精准基因编辑,但在作物改良中的规模化应用仍面临挑战。本研究在番茄中构建了全基因组多靶向CRISPR文库,通过设计15,804个独特单导RNA(s
A.全基因组文库覆盖所有基因,适合探索未知领域;目前文库在设计的时候为了保证充分的覆盖,会分布针对基因组的所有基因独立设计两套sgRNA的集成,所以基因组文库有时候会有A库和B库,本质只是设计的sgRNA的序列不同,可以作为相互的参照,也可一起联合使用。
CRISPR文库技术是CRISPR/Cas系统的高通量应用。CRISPR文库技术始于2012年Doudna和Charpentier的Cas9-sgRNA突破(Jinek et al., 2012)。2014年,Shalem等人开发GeCKO文库,覆盖18,08
当下,CRISPR文库作为基于CRISPR/Cas9技术构建的高通量基因筛选利器,助力众多研究获得突破性进展,高分文章更是频出。不少科研er想要应用CRISPR文库在自己的研究中,但是还停留在了解阶段,不知道该如何制定合理的筛选策略?
运用CRISPR/Cas9 高通量筛选技术在肿瘤细胞进行的阳性或阴性筛选,可以对靶向候选基因(编码和非编码基因)导向RNA(GRNA)进行富集,进而寻找感兴趣的目的基因。该技术的完整流程包含以下步骤:慢病毒文库构建,文库病毒感染细胞,细胞实验筛选,基因组DNA
快来试一试CRISPR文库筛选。它能高通量筛选基因,准确性高,操作灵活简便。可以根据不同的研究需求,设计不同的筛选策略,满足各种复杂的科研要求。