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Nat Genet | 任善成/谌科/古迪合作利用空间组学揭示前列腺新的生理功能和癌变机制

前列腺癌是全球男性第二大常见癌症,年新发病例约146.6万例,死亡约39.6万例。在美国,前列腺癌发病率长期居于男性首位,占新发癌症的30%。我国是传统前列腺癌低发病率的国家,但近十年来急剧增长,是增速最快的男性恶性肿瘤,已从2010年前的第13位跃居至202

前列腺 癌变 nat genet 古迪 2025-04-02 08:24  5

Nat Genet | 癌症细胞分裂次数的量化方法与意义

肿瘤是一种复杂的疾病,其发展涉及多个步骤和阶段,包括原发肿瘤的形成、肿瘤细胞的增殖和扩散、以及远处转移的发生。了解这些步骤和阶段的详细过程对于开发更有效的肿瘤治疗策略至关重要。然而,目前对于肿瘤细胞分裂次数的量化仍然是一个挑战。虽然可以通过检测突变来估计肿瘤的

癌症 nat genet 细胞分裂 细胞分裂次数 2025-03-11 08:11  6

Nat Genet | 相向启动子的基因调控

相向转录(Convergent transcription) ,即正义转录与反义转录的碰撞,在哺乳动物基因组中广泛存在,并被认为会降低RNA的表达水平。近年来,研究发现启动子下游的反义转录现象异常普遍,但其对受影响启动子的功能特征仍缺乏深入研究。

基因 nat genet 2025-02-02 01:34  10

Nat Genet | Borzoi:基于深度学习的RNA处理变异精准解读工具

随着高通量基因组学技术的进步,我们对基因表达调控的理解已从传统的DNA序列研究扩展到更加复杂的转录后调控机制。RNA的处理不仅包括转录阶段的基因表达,还涉及剪接、多腺苷酸化等过程,这些步骤在基因功能实现和疾病发生中起着至关重要的作用。尤其是基因变异对RNA处理

rna genet borzoi 2025-01-30 09:51  9

Nat Genet | 精准定位疾病关联基因和细胞类型的新方法——TGFM

复杂疾病,如糖尿病、心脏病和癌症,往往涉及多个组织和细胞类型,其机制复杂且异质【1】。传统的全基因组关联研究(GWAS) 和表达量性状关联研究(eQTL) 方法主要关注单个基因或组织的效应,难以解析这种多组织机制,导致对疾病因果基因和组织的理解有限【2-5】。

nat genet tgfm 2025-01-27 01:40  9

Nat Genet | 罕见变异对基因功能和性状的影响

酶和转运蛋白在维持代谢中间产物平衡方面至关重要,其功能紊乱可能导致代谢性疾病的发生。虽然研究发现罕见的遗传变异与代谢物水平存在关联,但由于纯合个体数量较少,这类研究受到一定限制。同时,大规模人群的全基因组关联研究 (GWAS) 已揭示了许多常见变异的存在【1,

变异 genet 性状 2025-01-21 08:47  9