摘要:对实验性学科来说,图像是记录和展示实验结果最重要最直观的方式。但是实验过程中直接获得的原始图像,多数并不符合专业期刊的投稿要求,必须经图像处理软件处理后(如裁剪、调整分辨率等)才能用于论文中。
对实验性学科来说,图像是记录和展示实验结果最重要最直观的方式。但是实验过程中直接获得的原始图像,多数并不符合专业期刊的投稿要求,必须经图像处理软件处理后(如裁剪、调整分辨率等)才能用于论文中。
然而,国内的科研现状是:绝大部分一线科研人员没有受过专业的图像处理的训练,大都凭借自学和自我摸索的技巧来进行图像处理,以至于常常“跟着感觉走”,没有规范、标准的操作流程,这些或规范或不规范的操作在实验室“代代相传”……
不规范的图像处理操作不仅会造成图像质量的降低,无法满足投稿的要求,导致投稿过程中文章被编辑反复要求修改,还可能会导致图像所展示的实验结果被“无意”修改,产生不必要的误会,给研究人员的学术声誉带来很大的负面影响……此外,在信息爆炸的时代,图像的“颜值”“审美”均不在线,难以引起大同行的关注。
一篇学术论文主要由文字、数据表格和插图等组成。随着科研人员对英语写作的重视和英文水平的提高,学术论文的文字表达已经做的越来越好,实验数据表格的整理也相对比较简单。因为论文插图对于学术论文结果的支持至关重要,所以多数杂志对论文插图的要求都比较严格,关于插图制作的要求经常长达几页。很多制作论文插图的科研人员没有专门学习过图像处理相关的知识,不了解论文插图制作的规范,甚至对杂志的要求都无法充分理解。由科研人员自己来制作完成的论文插图,经常无法满足杂志的要求。投稿遇到需要修回的问题,很多都与插图不合格有关,严重影响重要学术论文发表的进度。
平心而论,每篇学术论文阐述的实验结果是否具有重要的科学意义,经常受到很多方面因素的影响。但是我们只要稍微多花点心思,就能把论文的插图做得既规范又漂亮。规范、美观的插图能够增加审稿人和读者对论文质量的信心。
在检索文献时,经常能发现部分论文插图或多或少都存在一些问题,这会让身为读者的我们对作者的工作态度产生质疑。在投稿阶段,有瑕疵的插图同样会让审稿人对我们的工作态度是否认真产生疑虑。在这种情况下,无论我们在论文里介绍实验结果如何如何重要,也很难让人完全信服……这是个“看脸”的社会,如果你的实验结果本来就很好,那更应该把用来展示结果的图片做的很漂亮,这将有利于文章发表在更高影响因子的杂志上。
我们团队成立于2017年,团队成员主要由中科院毕业的硕、博士组成,专注于在科研工作者中普及论文插图制作的技能,并提供高质量的插图制作服务。我们应邀在很多单位开展了主题为“科研图像规范化处理和高水平SCI杂志论文插图制作”的讲座。我们的讲座时长3小时,全程干货,场场爆满,获得大家一致强烈好评。目前我们已经在清华大学、北京大学、北大医学部、中国农业大学、北京中医药大学、天津大学、南开大学、天津中医药大学、中科院生物物理所、中科院遗传发育所、中科院微生物所、中科院动物所、中科院植物所、中科院生态环境研究中心、中科院昆明植物所、中科院昆明动物所、陆军军医大学、北京协和医学院、中国医学科学院基础医学研究所、中国医学科学院生物技术研究所、军事医学科学院、国家蛋白质科学中心、中国疾病预防控制中心、北大医学部及各附属医院、首都医科大学及各附属医院等数十所医院、高校、科研院所开展了近百场讲座。
尽管我们的讲座时间长达近3小时,可是因为软件操作涉及到很多细节,听完讲座的学员大部分仍然无法熟练掌握相关技巧,很多参加过讲座的老师和同学都希望能接受更加全面的培训。为了能够让广大科研人员真正熟练地掌握高水平SCI论文插图制作的技能,规范制作出高质量的可投稿至任何期刊的插图,省去大量自行摸索学习软件的时间,我们开设了两类培训课程:一是针对实验室团体学员的《高水平SCI论文插图制作技能普及》培训,二是针对个体学员的20人小班课程。我们希望通过培训课程“授人以渔”,教会大家自己动手打造“高颜值”的论文。
《高水平SCI论文插图制作技能普及》这门课程主要讲解科研图像规范化处理的理论和软件操作,目标是使实验室每位成员都能做到:熟知科研图像处理的学术伦理,对不规范的图像处理操作能够准确识别以及避免;熟练掌握高水平SCI论文插图的制作流程,能够独立制作出可供投稿至包括CNS在内的任何杂志的论文插图。
《SCI论文插图绘制》这门课程主要讲解如何使用Adobe Illustrator软件进行SCI论文里各种插图的绘制,课程时间持续4天,零基础即可参加,学员自带电脑全程跟随讲解进行操作,学完后足以独立绘制绝大部分论文里的插图,完成日常的工作汇报、组会报告、考核答辩、墙报展板等学术交流更是不在话下。
《SCI论文插图排版与图像处理》这门课程主要讲授如何使用Adobe Illustrator软件和Photoshop软件来进行论文插图的排版和对各种原始实验图片进行规范化处理,以使其满足投稿的要求。课程时间持续2天,零基础即可参加,学员自带电脑全程跟随讲解进行操作,学完后足以独立完成对绝大部分实验图片的规范化处理,所制作的图片可用于日常的工作汇报、组会报告、考核答辩、墙报展板、论文投稿、课题申请等。
《SCI论文统计分析与作图(基础班)》和《SCI论文统计分析与作图(提高班)》这两门课程主要讲授如何使用Graphpad Prism、SPSS这两种最常用的统计软件制作出论文里的各种统计图。每门课程时间持续4天,采用案例式教学,学员自带电脑全程跟随讲解进行操作,学完后能够独立制作出绝大部分论文里的图表。
目前来自中科院微生物所、中科院动物所、中科院遗传发育所、中科院生物物理所、中科院生态环境研究中心,北京生命科学研究所、中国医学科学院药物研究所、国家人口计生委科学技术研究所、国家蛋白质科学中心、中国环境科学研究院、中国农业科学院生物技术研究所、安徽省农业科学院、清华大学、北京大学、中国农业大学、北京中医药大学、北京化工大学、华北电力大学、中国人民解放军62040部队、首都医科大学附属北京妇产医院、北大医学部、北医三院、北大口腔医院、北京大学第一医院、航天医院、北京医院、西苑医院等近百家单位的上千名学员参加了培训,均给出一致强烈好评。
下面是授课内容简介:
课程大纲
《高水平SCI论文插图制作技能普及》
1.科研图像处理的基础知识:位图及常见格式,矢量图及常见格式,DPI 和PPI,RGB/CMYK 等;
2.科研图像规范化处理的基本原则;
3.科研图像不规范处理的常见操作;
4.高水平SCI期刊对插图的要求;
5.高质量论文插图的标准;
6.高质量论文插图的制作流程;
7.Adobe Photoshop软件涉及科研图像处理的常用功能;
8.Adobe Illustrator软件涉及论文插图排版的常用功能;
9.案例讲解:按Nature的投稿标准制作常见类型的论文插图;
10.配色。
《SCI论文插图绘制》
1.学术论文中插图的特点;
2.Adobe Illustrator和Adobe Photoshop绘图的区别;
3.矢量图和位图;
4.RGB颜色模式、CMYK颜色模式、HSB颜色模式;
5.分辨率、DPI、PPI;
6.杂志社对投稿论文插图的要求;
7.学术论文中常见插图的尺寸;
8.如何确定需要绘制的插图的尺寸;
9.如何绘制各种直线和曲线;
10.如何绘制简单的几何图形;
11.如何绘制不规则的形状;
12.如何实现由线到形状的转变;
13.如何实现对形状的分割、组合;
14.如何给形状增加立体效果;
15.如何给形状增加投影;
16.如何调整形状的透明度;
17.如何表现管道、孔洞、裂痕、剖面等效果;
18.如何利用AI制作简单的3D图形;
19.如何绘制复杂的形状;
20.如何利用文献和网络资源帮助绘图;
21.如何进行配色;
22.如何导出符合投稿要求的插图。
《SCI论文插图排版与图像处理》
1.Photoshop软件的主要功能;
2.学术论文中图像的特点;
3.编辑和造假的区分;
4.高质量论文插图的标准;
5.高质量插图制作的步骤;
6.索引颜色模式;
7.色彩深度和颜色配置文件;
8.如何将多张图片裁剪为同样大小;
9.如何调整图片的分辨率和尺寸;
10.如何制作局部放大的图片;
11.如何merge多通道的荧光显微照片;
12.如何将多张图片裁剪同样部位;
13.如何调整图片的对比度;
14.如何校正图片的色彩;
15.如何将多张图片匹配为一致颜色;
16.如何给图片添加标尺;
17.如何给图片添加矢量标尺;
18.如何将电泳、Western类图片的条带快速调整至水平;
19.分辨率不够的统计图的重新绘制;
20.如何计算Western条带的光密度值;
21.如何进行长度、角度的测量;
22.如何进行阳性、阴性结果的计数;
23.如何给电镜照片上色;
24.如何使用画笔工具、污点修复画笔、修补工具、仿制图章等工具进行图像的修补;
25.如何使用蒙版进行图像调色与合成;
26.如何进行各种背景下的抠图;
27.照片类插图的制作与排版;
28.条带类插图的制作与排版;
29.统计图表类插图的制作与排版;
30.流式类插图的制作与排版;
31.综合型插图的制作与排版。
《SCI论文统计分析与作图(基础班)》
1.如何使用Excel进行规范的数据录入;
2.常用的Excel功能;
3.常用的Excel函数(保留小数位数函数、连接函数、时间函数、随机函数、index函数、vlookup函数等);
4.一维表与二维表及格式转换;
5.数据透视表;
6.常见的统计分析方法;
7.使用PASS软件计算常见实验设计所需的样本量;
8.使用GraphPad Prism进行频数分析、离群值分析、统计描述分析;
9.使用GraphPad Prism进行t检验及作图(单样本t检验、两独立样本t检验、配对样本t检验、多重t检验);
10.使用GraphPad Prism进行方差分析及作图(单因素方差分析、单因素重测方差分析、双因素方差分析、双因素重测方差分析、三因素方差分析);
11.使用GraphPad Prism进行卡方检验及作图(四联表资料的卡方检验、行×列联表资料的卡方检验);
12.使用GraphPad Prism进行秩和检验及作图(Mann-Whitney U检验、Kolmogorov-Smirnov test、Wilcoxon符号秩检验、Friedman检验、Kruskal-Wallis H检验);
13.使用GraphPad Prism进行相关性分析及作图;
14.使用GraphPad Prism进行线性拟合及作图;
15.使用GraphPad Prism进行非线性拟合及作图;
16.使用GraphPad Prism进行生存分析及作图(Kaplan-Meier、Log-rank、Breslow法);
17.使用GraphPad Prism进行准确性检验及作图(ROC曲线);
18.使用GraphPad Prism进行一致性检验及作图(Bland-Altman图);
19.使用GraphPad Prism制作直方图、条形图(单式条形图、复式条形图、分段条图、堆积条形图、悬浮条形图等);
20.使用GraphPad Prism制作散点图(象限散点图、分组散点图、XY散点图、带置信条带的散点图等);
21.使用GraphPad Prism制作箱图和分位数图;
22.使用GraphPad Prism制作线图(折线图、时间序列图、半对数图等);
23.使用GraphPad Prism制作饼图、圆环图、水平切片图、垂直切片图;
24.使用GraphPad Prism制作截断柱状图、双Y轴图、金字塔图、森林图、累积发病率走势图、克利夫兰点图、棒棒糖图、瀑布图、面积图、RCT试验统计、热图、火山图、嵌套子列图、小提琴图、概率图、气泡图等特殊类型统计图;
25.使用Adobe Illustrator对统计图进行修改与排版。
《SCI论文统计分析与作图(提高班)》
1.SPSS软件的常见操作介绍;
2.SPSS数据库的构建与管理;
3.SPSS数据的预处理;
4.使用SPSS进行统计描述分析;
5.使用SPSS制作统计表;
6.使用SPSS制作统计图;
7.使用SPSS进行t检验(单样本t检验、两独立样本t检验、配对样本t检验);
8.使用SPSS进行方差分析(单因素方差分析、单因素重测方差分析、双因素方差分析、双因素重测方差分析、协方差分析、交叉设计方差分析、拉丁方设计方差分析、嵌套设计方差分析等);
9.使用SPSS进行卡方检验(四联表卡方、行×列联表卡方、线性趋势卡方、配对卡方、分层卡方等);
10.使用SPSS进行非参数检验(Mann-Whitney U检验、Wilcoxon符号秩检验、Kruskal-Wallis H检验、Friedman检验,Cochran's Q检验);
11.使用SPSS进行区间估计;
12.使用SPSS进行一致性检验(ICC组内相关系数、Kappa一致性系数、Kendall's W协调系数的计算);
13.使用SPSS进行ROC分析;
14.使用SPSS进行相关性分析和偏相关分析(Pearson、Spearman、Kendall's tau-b相关分析);
15.使用SPSS进行简单线性回归模型分析;
16.使用SPSS进行多重线性回归模型分析;
17.使用SPSS进行岭回归模型分析;
18.使用SPSS进行分层回归模型分析;
19.使用SPSS进行二分类Logistic回归模型分析;
20.使用SPSS进行多分类Logistic回归模型分析;
21.使用SPSS进行配对Logistic回归模型分析;
22.使用SPSS进行Probit回归模型分析;
23.使用SPSS进行对数线性模型分析;
24.使用SPSS进行Poisson回归模型分析;
25.使用SPSS进行时间序列模型分析;
26.使用SPSS进行生存分析和Cox回归分析;
27.使用SPSS进行倾向性匹配得分(PSM)分析;
28.使用SPSS进行主成分分析和因子分析;
29.使用SPSS进行聚类分析和判别分析;
30.使用SPSS进行量表分析:区分度分析、信度分析、效度分析。
课程特色
科研一线老师授课
授课老师来自中科院科研一线,具有多年丰富的论文插图制作和统计分析作图经验。精通Photoshop、Adobe Illustrator、Cinema 4d、Origin、Prism、SigmaPlot、SPSS等软件,善于用通俗易懂的语言讲解复杂的知识点,其深入浅出的讲课特点深得学员认可。
精英小班教学
课程采用小班教学,确保每位学员都能得到充分的一对一辅导,最大限度地保证教学质量,真正做到上完课就能独立作图。
“技巧”与“思考”的讲授并重
绘图和统计作图是课程的难点。对于绘图学习而言,我们认为对绘图思路和绘图技巧的掌握同等重要。绘图技巧是有限的,几天时间足以讲授完,但是需要绘制的对象却是“无限”的。只有掌握正确的绘图思考方法,才能运用有限的绘图技巧绘制出“无限”的对象。因此课程除了讲授绘图技巧外,重点讲授绘图的思考方法,充分启发学员的自我思考能力,确保每位学员在掌握绘图技巧的同时,学会正确的绘图思考方法,从而在未来的科研工作中能够随心所欲地绘制出所需的插图。对于统计作图来说,我们认为,统计图只是统计分析结果的最后呈现,统计分析的思路和方法要比最后呈现结果的统计图重要得多。针对不同的实验设计和数据类型,需要使用不同的方法来进行分析。而使用不同方法得到的结果,都有最合适的统计图来呈现。实验设计决定了数据类型,数据类型决定了统计分析的方法,统计分析的方法则决定最后该用哪种统计图来呈现。这其实是一个环环相扣的过程,并不能随意选择。选择的统计分析方法不对,同样的数据可能会得到完全不同的结果。我们希望通过课程帮助学员梳理清楚不同统计分析方法的区别和使用条件,建立统计分析的正确思路和流程,同时掌握相应的软件使用技巧,让所有日夜辛苦得到的数据,都能够“不被辜负”。
课后随时一对一答疑
每次课程结束后建立微信交流群,随时答疑。必要时可通过电脑远程操作提供一对一指导,确保每位学员在实际应用中遇到的问题都能得到充分解答。参加完课程后,学员还可加入往期学员交流大群,这里有来自国内知名学府、顶级研究机构、顶尖医学院的精英学员,大家彼此相识、连接、互助、进步,收获将是无限的。
往期学员评价
学员单位列表
中科院微生物所
中科院动物研究所
中科院遗传发育研究所
中科院生物物理研究所
中科院植物研究所
中科院生态环境研究中心
中科院上海生化与细胞研究所
中科院昆明植物研究所
中科院福建物质结构研究所
中国环境科学研究院
北京生命科学研究所
中国医学科学院基础医学研究所
中国医学科学院医学实验动物研究所
中国医学科学院药物研究所
中国医学科学院生物技术研究所
中国医学科学院药用植物研究所
国家人口计生委科学技术研究所
国家蛋白质科学中心
安徽省农业科学院烟草研究所
中国农业科学院生物技术研究所
中国农业科学院原子能利用研究所
华南植物园
军事医学科学院
中国疾病预防控制中心
清华大学
北京大学
中国农业大学
中央民族大学
西北农林科技大学
华中农业大学
华南农业大学
北京中医药大学
北京化工大学
北京科技大学
华北电力大学
沈阳农业大学
河北农业大学
江苏科技大学
福建农林大学
贵州大学
绍兴文理学院
南京工业大学
沈阳师范大学
广西医科大学
河北大学
成都大学
四川农业大学
北京航空航天大学
首都医科大学
天津中医药大学长治医学院
陆军军医大学
部
队
医
院
中国人民解放军62040部队
中国人民解放军301医院
北大医学部
北大肿瘤医院
北医三院
北京协和医学院
北京大学第一医院
北京大学口腔医院
北京大学人民医院
航天医院
北京医院
西苑医院
首都医科大学附属北京妇产医院
首都医科大学附属北京口腔医院
首都医科大学附属北京朝阳医院
首都医科大学附属北京天坛医院
重庆三峡中心医院
西安交通大学第一附属医院
中国医学科学院阜外医院
辽宁中医药大学附属第二医院
天津市中心妇产科医院
天津医科大学代谢病医院
南京鼓楼医院
往期学员评价
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课程安排
上课时间
1.《高水平SCI论文插图制作技能普及》课程仅针对实验室团体,具体上课时间双方协商而定;
2.小班培训课程在周末轮流开课,具体上课日期PaperArtist公众号,进入课程商城查看;
3.小班培训课程每月均会开课,报名多门课程的学员可以根据自己的时间安排择期上课,不必一次性上完。所有课程均可免费复听。
上课地点
1.《高水平SCI论文插图制作技能普及》课程为上门授课,北京本地和外地均可;
2.小班培训课程上课地点在北京市通州区富力中心B02座2522室(地铁6号线北运河西站A口出,步行300米即到);
3.小班培训课程当团体报名人数超过10人时也可上门授课,北京本地和外地均可。
1.《高水平SCI论文插图制作技能普及》课程仅针对实验室团体,时长为1天,收费为1000元/人,15人及以上即可开课,可几个实验室联合报名。此后每年实验室新增人员仍可以1000元/人的价格参加培训。实验室成员如果希望参加小班培训课程进一步全面学习和掌握论文插图制作、科研图像处理和统计作图的技能,将在课程原价基础上直接减免1000元;
2.《SCI论文插图绘制》课程时长为4天,收费为6400元/人;
3.《SCI论文插图排版与图像处理》课程时长为2天,收费为3600元/人;
4.《SCI论文统计分析与作图(基础班)》课程时长为4天,收费为6400元/人;
5.《SCI论文统计分析与作图(提高班)》课程时长为4天,收费为6400元/人;
6.多门课程连报可享受价格优惠,具体优惠价格详见课程商城;
7.提供发票和加盖公章的邀请函,往期学员均可顺利报销。
2.对公转账:请通过公众号联系客服申请会议通知或发票用于转账,上课前到账即可;
3.现场刷卡:需交纳定金,刷卡后退还。详情请通过公众号联系客服咨询。
每期课程限额20人
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来源:微生物组