肿瘤抑制基因新发现:KEAP1合性成为肺癌预测的关键生物标志物

摘要:作为预后和预测性生物标志物的基因杂合度总结041. TSG分类:基于双链基因失活的趋势,研究结果将TSG分为4类。1类TSGs在癌症中几乎都发生了双等位基因失活,而2类TSGs(如ATM、ARID1A和FBXW7)在保留野生型(WT)等位基因方面表现出高度的品

原创 转网 转化医学网作为预后和预测性生物标志物的基因杂合度总结041. TSG分类:基于双链基因失活的趋势,研究结果将TSG分为4类。1类TSGs在癌症中几乎都发生了双等位基因失活,而2类TSGs(如ATM、ARID1A和FBXW7)在保留野生型(WT)等位基因方面表现出高度的品系限制和不同的偏好。2. 环境依赖性:某些TSGs可能表现出单倍性或剂量敏感性,但数据表明它们在某些情况下会选择双倍等位基因失活,暗示这些基因在致癌过程中的作用与环境有关。3. 显性阴性致癌突变:第3类和第4类TSGs在常发生突变的每种癌症类型中都显示出缺乏对双拷贝失活的选择,其中一些基因(如PPP2R1A和SPOP)可获得显性阴性致癌突变,持续抑制其WT等位基因。4. 肿瘤抑制的生化模式:失去WT等位基因的倾向,是由肿瘤抑制的生化模式决定的。5. 单倍体缺陷与剂量敏感性:研究对小鼠模型中出现的关键TSGs剂量敏感性证据如何转化为人类癌症提出了挑战,如PTEN在肿瘤发生早期可能具有致癌作用,但随着肿瘤发展,可能依赖于WT的缺失。6. 双倍拷贝失活的选择信号:在意想不到的癌系中,如APC基因的双倍拷贝失活的选择信号,可以揭示这些癌症进展的新情况。7. 功能性等位基因的识别:利用双等位基因失活的选择特征来识别潜在的功能性等位基因,这些等位基因可能被当代临床实用的致癌基因注释框架所忽视。8. KEAP1突变与肺癌预后:研究特别指出,只有KEAP1双等位基因失活的KEAP1突变肿瘤与肺癌患者总生存率低和对标准疗法反应差有关,支持将杂合性缺失作为常规临床报告,以指导解释TSG突变的临床意义。参考资料:1.Vogelstein, B. ∙ Papadopoulos, N. ∙ Velculescu, V.E. ...Cancer genome landscapesScience. 2013; 339:1546-15582.Knudson, A.G.Mutation and cancer: statistical study of retinoblastomaProc. Natl. Acad. Sci. USA. 1971; 68:820-823原标题:《【Cell】肿瘤抑制基因新发现:KEAP1合性成为肺癌预测的关键生物标志物》

来源:科学快车

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