摘要:古代人类的基因组蕴含着丰富的历史动态变迁信息。但是由于样品数少并且测序质量低,其族群分辨率有限,这限制了它的进一步发挥[1], [2]。
古代人类的基因组蕴含着丰富的历史动态变迁信息。但是由于样品数少并且测序质量低,其族群分辨率有限,这限制了它的进一步发挥[1], [2]。
近日,一项发表在Nature的工作开发新方法-Twigstats,结合单倍型充分利用谱系信息,并集中分析比较临近的谱系融合(降低偏差和背景),大幅提高了对古代人类基因组的族群及其融合(或者说祖先来源比例)的分辨率/统计效力[2]。
Twigstats概览[2]。
Twigstats提高族群及其融合的分辨率/统计效力[2]。
进一步,研究人员利用该方法,结合1,556个古代人类全基因组数据,分析了从铁器时代(Iron Age)到维京时代(Viking Age; 也称北欧海盗时代)的欧洲族群变迁;比较意外地发现Viking Age前斯堪的纳维亚半岛(Scandinavian Peninsula)活跃的族群流入/流出[2]。
欧洲6个区域的族群变迁[2]。
该项工作的通讯作者是Francis Crick Institute的Pontus Skoglund和Leo Speidel等研究人员;2025年1月1日在线发表在Nature[2]。
研究人员表示该框架可分析全球人类变迁[2]。
Comment(s):
“硬核”且“正交”的历史记录;充分“压榨”古代人类基因组信息。
该方法带来的见解与常规历史记载的整合和比对会非常有意思,特别是缺失和有冲突的环节。
不过这种策略估计受地域和丧葬文化影响比较大。
参考文献:
[1] G. Hellenthal et al., “A genetic atlas of human admixture history.,” Science, vol. 343, no. 6172, pp. 747–751, Feb. 2014, doi: 10.1126/science.1243518.
[2] L. Speidel et al., “High-resolution genomic history of early medieval Europe,” Nature, vol. 637, no. 8044, pp. 118–126, 2025, doi: 10.1038/s41586-024-08275-2.
原文链接:
来源:老齐的科学大讲堂