摘要：大家好，欢迎观看《时空日报》第381期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的Genpilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
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1、胃腺癌进展和演变中空间分辨的肿瘤生态系统和细胞状态
Spatially Resolved Tumor Ecosystems and Cell States in Gastric Adenocarcinoma Progression and Evolution
Cancer Discov; IF:29.700; DOI: 10.1158/2159-8290.CD-24-0605
内容概要：
① 胃癌（GC）是全球癌症死亡的主要原因之一，其特点在于高度的异质性。为了深入理解肿瘤生态系统中的地理空间相互作用，研究人员开展了一项综合性研究。他们从121例患者的226个胃癌样本中，整合了2,138个空间转录组感兴趣区域（ROIs）的数据和152,423个单细胞表达谱。这一大数据集为探索胃癌的复杂性提供了坚实的基础。
② 在这项研究中，研究人员观察到基于基因表达的肿瘤内异质性在胃癌中普遍存在。这些异质性通过空间定位和功能有序的亚组来再现肿瘤的进展过程。这些亚组不仅与特定的免疫微环境紧密相关，还显示出独特的检查点特征和遗传驱动因素，如SOX9等。这些发现进一步证实了胃癌的复杂性和多样性。
③ 进一步地，进化系统发育分析揭示了胃癌中存在两种不同的进化轨迹：分支进化和内部离散进化。这些进化轨迹与不同的分子亚型、临床预后以及间质微环境密切相关，尤其是VWF+ ACKR1+内皮细胞的存在。对多个胃癌样本中肿瘤-间质界面的空间分析还揭示了一些新的生态系统状态，这些状态不能简单地归因于肿瘤和间质的混合，而是以GREM1表达增加为显著特征。这些研究结果不仅揭示了胃癌细胞生态系统是如何受到肿瘤内在和外在选择压力的塑造，还为制定针对特定患者的个性化癌症治疗方案提供了重要依据。
疾病研究：胃癌（GC），肿瘤内异质性，空间转录组，单细胞表达谱，免疫微环境，检查点特征，SOX9，进化轨迹，分支进化，内部离散进化，分子亚型，临床预后，间质微环境; Ma H, Srivastava S, Ho S, et al.; Duke NUS Graduate Medical School, Singapore, Singapore.
2、用铈增强的特殊纳米材料来阻止脊髓损伤，并通过单细胞多组学评估其效果
Single-Cell Multi-omics Assessment of Spinal Cord Injury Blocking via Cerium-doped Upconversion Antioxidant Nanoenzymes
Advanced science IF:14.300; DOI: 10.1002/advs.202412526
内容概要：
① 科学家们针对脊髓损伤（SCI）设计了一种创新的策略，即基于铈（Ce）掺杂的上转换抗氧化纳米酶（Ce@UCNP-BCH）的同时紧急治疗与动态发光监测策略（SETLSA）。这种策略的核心优势在于，Ce@UCNP-BCH纳米酶能够高效地清除SCI部位产生的活性氧（ROS），从而减轻ROS对脊髓组织的损害，并防止髓鞘退化。此外，该纳米酶还能通过其独特的比率发光特性，实时监测SCI修复过程中的氧化状态，为医生提供关于患者康复进展的宝贵信息。
② 在实验验证中，科学家们发现Ce@UCNP-BCH纳米酶不仅具有显著的治疗效果，还能有效促进脊髓的再生。通过经典的Basso小鼠评分和免疫荧光分析，他们观察到经过Ce@UCNP-BCH治疗的SCI小鼠，其脊髓组织（特别是髓鞘）的再生情况得到了显著改善，同时小鼠的运动功能也得到了有效恢复。这一发现为SCI的治疗提供了新的思路和希望。
③ 为了更深入地了解Ce@UCNP-BCH纳米酶的作用机制，科学家们还结合了单细胞核ATAC测序（snATAC-seq）和单细胞核RNA测序（snRNA-seq）等高通量测序技术。这些研究揭示了Ce@UCNP-BCH治疗后脊髓组织的异质性变化，以及髓鞘化少突胶质细胞数量的增加和髓鞘化相关基因的高表达。此外，研究还发现，在超氧化物歧化酶（SOD）小干扰RNA（siRNA）处理后，SETLSA策略能够通过激活SOD相关途径，进一步协同增强ROS的清除能力。这一发现不仅丰富了SCI修复的工具箱，也为未来的研究和治疗提供了更多的可能性和方向。
疾病研究：纳米酶，髓鞘形成，氧化应激监测，活性氧(ROS)，脊髓损伤(SCI)， scRNA-seq；Wang K, Zheng J, Li R, et al. ; Department of Orthopedics, The First Affiliated Hospital, Jinan University, Guangzhou, 510632, China.
来源：老妖聊科学
