摘要:在植物的根系周围,隐藏着一个肉眼看不见的“微型战场”。数以亿计的微生物在此争夺资源,而一类名为Bacteroidota的细菌(尤其是黄杆菌属Flavobacterium)却悄然成为“赢家”。近日,国际顶尖期刊《ISME Journal》发表的一项研究[1]揭开
在植物的根系周围,隐藏着一个肉眼看不见的“微型战场”。数以亿计的微生物在此争夺资源,而一类名为Bacteroidota的细菌(尤其是黄杆菌属Flavobacterium)却悄然成为“赢家”。近日,国际顶尖期刊《ISME Journal》发表的一项研究[1]揭开了它们的生存秘诀:高效分解植物分泌的复杂碳源——木葡聚糖(XyG)。这一发现不仅为改良作物微生物组提供了新思路,还可能成为应对气候变化、提升土壤固碳能力的关键!
放弃“快餐”,专攻“硬菜”大多数根际细菌依赖简单的糖类(如葡萄糖)生存,但黄杆菌却“另辟蹊径”。它们缺乏常见的ABC转运蛋白(类似“快递员”运输小分子营养),转而进化出一套TonB依赖性转运系统(TBDTs),专门捕获植物分泌的复杂多糖——木葡聚糖(XyG)。这种多糖如同植物的“根系黏液”,既能保护根部,又能为土壤微生物提供长期碳源。基因武器库:XyGUL基因簇
研究团队通过宏转录组学和基因敲除实验,发现黄杆菌携带一个高度保守的木葡聚糖利用基因簇(XyGUL)。其中的关键“武器”包括:
GH5_4内切酶:精准切割木葡聚糖的主链,将其分解为可吸收的寡糖。
XusCD转运复合体:像“分子传送带”将分解产物摄入细胞。
实验表明,缺失这些基因的黄杆菌无法利用木葡聚糖,而在土壤富集实验中,携带XyGUL的菌株迅速成为优势种群。
Bacteroidota的细菌对木葡聚糖的降解
进化密码:一个氨基酸决定酶活性研究还揭示,GH5_4内切酶中**第252位的色氨酸(Trp)**是高效分解木葡聚糖的关键。一旦突变为丙氨酸(Ala)或甘氨酸(Gly),酶活性大幅下降。这一发现解释了为何某些黄杆菌虽携带类似基因,却无法有效降解XyG。
同源基因在植物和微生物中的分布
“土壤微生物组是地球的‘隐藏器官’,而黄杆菌这类‘碳管家’的角色一直被低估。未来,通过基因编辑或微生物接种,我们有望定向培育‘智能根际菌群’,实现农业与生态的双赢。”
论文信息
期刊:The ISME Journal, 2025
DOI:https://doi.org/10.1093/ismejo/wraf022
结语
这项研究不仅揭开了植物与微生物“对话”的分子密码,更让我们看到:在肉眼难及的土壤世界中,微观生命的每一次代谢,都在悄然影响人类的粮食安全与地球的未来。或许,下一次农业革命的关键,就藏在这些“超级分解者”的基因里。
来源:农科最前线