额外小标记染色体(+mar):DNA中的神秘拼图

360影视 动漫周边 2025-03-12 10:00 2

摘要:你听说过微小染色体标记(mar)吗?你有没有想过,我们的DNA不仅仅是由那些我们熟知的基因组成,其实,它还有一些“隐藏的部分”,就像是基因组中的“拼图碎片”,这些小碎片被称为微小染色体标记(sSMC, small supernumerary marker ch

转自:安必平

你听说过微小染色体标记(mar)吗?你有没有想过,我们的DNA不仅仅是由那些我们熟知的基因组成,其实,它还有一些“隐藏的部分”,就像是基因组中的“拼图碎片”,这些小碎片被称为微小染色体标记(sSMC, small supernumerary marker chromosome)。

微小染色体标记是一种未知来源的染色体结构,可能来自标准染色体的部分复制、倒位或重组,从而在染色体组中新增了一个微小片段。有些人携带sSMC而没有任何健康问题,而在某些情况下,它可能与遗传病、不孕不育或发育障碍相关。可以说这是人类基因组中的一个“隐形拼图”,普通情况下难以察觉。所以今天我们就来找找看,如何发现这块“神秘拼图”?微小染色体是什么?有什么作用?

微小染色体标记在核型分析中被检测到的话,它的形状可以是这样的:

也可以是这样的:

或者这样的:

在真实的临床实践检测的过程中,产前诊断/细胞遗传学医生需要绞尽脑汁去分析可能来源的异常结构,单一核型分析去找到真正的来源是非常困难的,需要进一步使用其他技术才能精准判定。

可能对于普通人来讲,最关注的还是sSMC致病率高吗?携带了sSMC的话一定会致病吗?研究表明,大约1%的人可能携带微小染色体标记,但并非每个人都因此患病。一些人可能终其一生都没有表现出任何相关症状,而另一些人则可能会因sSMC而引起发育迟缓、智力障碍、或其他遗传疾病的影响。而在出生后的人群发生率为0.044%,发生率低于产前诊断的胎儿(1%左右),这也有可能因为有一部分确诊携带sSMC的胎儿会终止妊娠。另外,有生育问题的人群,0.125%是sSMC的携带者,而智力发育迟缓的人群中,检测到sSMC的比例高达0.288%,是一般人群的7倍。

虽然98%以上的遗传性sSMC携带者的临床表型是正常的,而大约70%的新发病例中,sSMC与临床表型无关。具体来讲,我们需要关注的是与微小染色体标记的相关的疾病,有以下几类:

22q11.2缺失综合征(DiGeorge综合征、Velocardiofacial综合征)

Prader-Willi综合征(15q11-q13区的缺失)

Angelman综合征(15q11-q13区的缺失)

Cri-du-chat综合征(5p15.2缺失)

Down综合征(Trisomy 21)相关的微小重复

Emanuel综合征(携带 der(22)t(11;22)(q23.3;q11.2)染色体)

sSMC的检测方法

目前,sSMC主要是通过染色体核型分析发现,同时,sSMC的临床遗传学效应需要结合细胞遗传(核型分析)、分子细胞遗传学(FISH)、分子遗传学(CMA 或 CNV-seq)多技术平台共同确定其来源及临床意义进行综合评估。

sSMC的诊断路径

1.临床样本采集:从孕妇或患者采集临床样本,通常为外周血、羊水或绒毛样本;通过临床指征(如异常胎儿超声、产前筛查异常等)决定是否要进一步进行sSMC的检测。

2.DNA提取:使用标准化的DNA提取方法从样本中提取基因组DNA,确保样本质量适合后续分析。

3.染色体制备:在体外培养细胞并使用标准染色体制备方法(如全血培养或羊水细胞培养),以获得高质量的染色体准备(染色体质量直接会影响后续染色体分析的准确性)。

4.染色体核型分析:对样本进行G-banding染色和显微镜下分析,检测是否存在染色体异常(如染色体数目(多一条少一条)或结构异常(缺失/重复/倒位/易位))

染色体核型分析示意图

5.FISH分析:荧光原位杂交技术来检测微小染色体标记片段(亚端粒片段或微缺失片段),通过特定的荧光标记探针,对sSMC进行定位,确认其位置、大小和组成。

FISH检测sSMC的流程图示意

那对于sSMC的FISH检测,报告中要如何书写相关染色体描述呢?根据2013版ISCN对于染色体的描述,对于sSMC,一般需要用“mar”(marker chromosome)标识。如果染色体被识别为一个微小染色体标记片段,应写作“mar”。如果标记来源于某个特定的染色体(如21号染色体),则应写作“mar(21)”,如果要提及染色体的大小,或者是否由正常染色体的某个部分构成的。书写时可加入相应的“+”符号,表示该染色体为额外的染色体。而结构异常或重排时,则会有更复杂的书写方式,需进行详细标明(如(qter))。

以上提到的(qter)书写方式,即相当于染色体亚端粒异常,亚端粒的FISH检测是一种用于分析染色体端粒附近特定区域(亚端粒区)的遗传异常的方法。是利用荧光标记的DNA探针,与染色体亚端粒区域进行杂交,从而检测染色体数目异常/结构异常。同样,亚端粒FISH检测的临床意义除了遗传病诊断以外,还可以进行智力发育障碍和先天畸形筛查,辅助染色体核型分析以及不明原因流产与不孕不育的遗传学分析。

病例报道

患者,女性,28岁。因反复自然流产2次,于2022年9月到院就诊,并进行遗传咨询。

患者平素月经规律,既往体健,无特殊不适,否认手术史,否认2次妊娠期接触有毒有害物质,否认药物过敏史。

配偶29岁,否认近亲结婚和家族遗传疾病史。

2021年9月第一次妊娠期间血清孕酮水平持续较低,孕8周时发生稽留流产行清宫术,术后1月余转经;第二次妊娠末次月经为2022年3月,于2022年5月孕9周时就诊于我院,超声检查提示胚胎停育。2次妊娠胚胎均未送检,建议夫妻双方行染色体核型分析。

2022年10月我院染色体核型分析显示,妻子染色体核型无明显异常(46,XX)。

丈夫的染色体核型分析结果提示1号染色体短臂和11号染色体长臂可能发生亚端粒重排[46,XY,?t(1;11)(p36.2;q24)]。

为了进一步验证丈夫染色体是否存在疑似亚端粒重排,采用1号染色体短臂末端(pter)和11号染色体长臂末端(qter)的探针进行FISH分析。

FISH结果明确丈夫在1号染色体短臂端与11号染色体长臂端之间存在易位。

最终,丈夫确诊染色体核型为46,XY,t(1;11)(p36.2;q24)。丈夫携带的t(1;11)平衡易位是导致该家庭反复流产的原因。此外,丈夫的父母既往也曾经历2次妊娠早期的自然流产,表明先证者的t(1;11)可能遗传自双亲之一。

所以,这例罕见的1号和11号染色体平衡易位的病例,恰恰说明亚端粒探针存在的必要性,通过核型分析和FISH检测可以明确复发性流产(RSA)家系的遗传病因,亚端粒的FISH检测给可疑的亚端粒结构重排提供了很重要的价值。

生殖遗传领域的诊断对于新生儿来讲,是实现优生优育非常关键的步骤,除了染色体非整倍体的异常以外,亚端粒异常以及微缺失微重复,都可能对新生儿的临床症状产生较长时期的影响。同时,染色体核型分析检测出的异常情况可能会对孕妇造成一定的焦虑,此时FISH进一步验证核型分析的异常,以FISH快速,准确的技术特点,能大大提升诊断效率,消除孕妇的疑虑;进一步恰当的遗传咨询与指导,从而达到优生优育的目的。

安必平凭借在国内独有的产前染色体数目异常检测试剂盒三类证,进一步与国内生殖医学医疗单位携手合作,共同开发亚端粒探针库,从而更有效地辅助医疗单位实现精准诊断。

安必平目前拥有亚端粒探针的明细:

探针代码 产品名称(荧光原位杂交法) F.01564-011pter/1qter探针试剂F.01570-012pter/2qter探针试剂F.01571-013pter/3qter探针试剂F.01567-014pter/4qter探针试剂F.01572-015pter/5qter探针试剂 F.01573-016pter/6qter探针试剂F.01574-017pter/7qter探针试剂F.01575-018pter/8qter探针试剂F.01568-019pter/9qter探针试剂F.01569-0110pter/10qter探针试剂F.01576-0111pter/11qter探针试剂F.01577-0112pter/12qter探针试剂F.01578-0113qter探针试剂F.01579-0114qter探针试剂F.01580-0115qter探针试剂F.01581-0116pter/16qter探针试剂F.01583-0118pter/18qter探针试剂F.01584-0119pter/19qter探针试剂F.01585-0120pter/20qter探针试剂F.01586-0121qter探针试剂F.01587-0122qter探针试剂F.01588-01XYpter/XYqter探针试剂

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参考文献

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来源:新浪财经

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