摘要:TCGPR(Tree-Classifier for Gaussian Process Regression)是一种基于高斯过程回归的树分类器算法,专为小数据集和高维特征空间设计。它通过“分而治之”的策略,将数据集划分为多个子集,识别异常值并提高模型的预测精度。
TCGPR(Tree-Classifier for Gaussian Process Regression)是一种基于高斯过程回归的树分类器算法,专为小数据集和高维特征空间设计。它通过“分而治之”的策略,将数据集划分为多个子集,识别异常值并提高模型的预测精度。TCGPR在材料科学、生物医学等领域表现出色,尤其适合处理复杂数据模式。(GitHub 主页见原文链接)
二、如何安装TCGPR?确保Python环境已安装
确保您的系统已安装Python(推荐Python 3.6+)。
安装TCGPR库
打开终端或命令行,运行以下命令:
pip install PyTcgpr三、代码教程:如何使用TCGPR?1. 数据筛选与分区fromPyTcgprimportTCGPR
# 设置参数
Dataset = "data.CSV"# 数据集路径
initial_set_cap =3# 初始集容量
sampling_cap =2# 每次迭代添加的数据点数
up_search =500# 暴力搜索的上限
CV = 'LOOCV' # 交叉验证方式
Task = 'Partition' # 任务类型:分区
# 执行算法
TCGPR.fit(
filePath=dataSet,
initial_set_cap=initial_set_cap,
Task=Task,
sampling_cap=sampling_cap,
up_search=up_search,
CV=CV
)
2. 数据筛选与识别fromPyTcgprimportTCGPR
# 设置参数
dataSet = "data.csv"# 数据集路径
sampling_cap =2# 每次迭代添加的数据点数
up_search =500# 暴力搜索的上限
Task = 'Identification'# 任务类型:识别
CV = 'LOOCV' # 交叉验证方式
# 执行算法
TCGPR.fit(
filePath=dataSet,
Task=Task,
sampling_cap=sampling_cap,
up_search=up_search,
CV=CV
)
3. 特征选择模块fromPyTcgprimportTCGPR
# 设置参数
dataSet = "data.csv"# 数据集路径
sampling_cap =2# 每次迭代添加的数据点数
Mission = 'FEATURE' # 任务类型:特征选择
up_search =500# 暴力搜索的上限
CV = 'LOOCV' # 交叉验证方式
# 执行算法
TCGPR.fit(
filePath=dataSet,
Mission=Mission,
sampling_cap=sampling_cap,
up_search=up_search,
CV=CV
)
四、参数说明
Mission: 任务类型,可选值为'DATA'(数据筛选)、'FEATURE'(特征选择)。
filePath: 输入数据集的CSV文件路径。
initial_set_cap: 初始集容量,仅在分区任务中使用。
sampling_cap: 每次迭代添加的数据点数或特征数。
measure: 相关性标准,可选'Pearson'(皮尔逊相关系数)或'Determination'(决定系数)。
ratio: 相关性容忍比率。
target: 回归任务中的目标数。
weight: 计算GGMF分数的权重因子。
up_search: 暴力搜索的上限。
exploit_coef: 在Cal_EI函数中约束方差的系数。
exploit_model: 若为True,则仅使用R值进行搜索,不考虑GGMF。
CV: 交叉验证设置,可以是整数(如5, 10)或'LOOCV'(留一法交叉验证)。
五、输出结果算法执行后,会输出一个CSV文件,包含处理后的数据集,文件名为Dataset_remained_by_TCGPR.csv。持续分割remained data得到系列数据子集。六、注意事项数据格式:确保输入数据集格式正确,且路径无误。
参数设置:根据具体任务和数据特点,合理设置参数,以获得最佳效果。
环境配置:确保Python环境和依赖库安装正确。
问题解决:如果在使用过程中遇到问题,可以参考[TCGPR的GitHub页面]【https://github.com/Bin-Cao/TCGPR】或联系作者Bin Cao获取帮助。
七、结语TCGPR算法为您的数据处理和特征选择提供了强大的工具,无论是材料科学还是生物医学领域,都能显著提升您的研究效率和模型精度。快来尝试吧,让您的数据处理更高效!
本推文由kimi 自动生成,内容并无任何错误,大模型生成技术推送也不在话下!
来源:小丁科技观察