摘要:VASP 全称为 Vienna Ab initio Simulation Package(The VASP Manual - VASP Wiki)是一个计算机程序,用于从第一性原理进行原子尺度材料建模,例如电子结构计算和量子力学分子动力学。
VASP 全称为 Vienna Ab initio Simulation Package(The VASP Manual - VASP Wiki)是一个计算机程序,用于从第一性原理进行原子尺度材料建模,例如电子结构计算和量子力学分子动力学。
Phonopy(Welcome to phonopy — Phonopy v.2.37.1)是一款用于在简谐和准简谐水平下计算声子能带结构、热学性质、群速度以及其他与声子相关物理量的 python 工具包。
本次教程将使用自动化脚本来使用 Phonopy 进行演示计算流程。通过本教程,您将学会比热容计算的基本流程:
准备微扰差分超胞结构
计算所有结构的总能
计算力常数矩阵
根据力常数矩阵计算硅的比热容
教程链接:https://go.openbayes.com/M2QBG
该教程将在云平台OpenBayes.com 上使用 RTX 4090 进行演示,使用下方邀请链接注册即可获得 4 小时 RTX 4090 免费使用时长:
https://openbayes.com/console/signup?r=Dennis9801_1ohB
POSCAR-unitcell
clean.sh
run.sh
run_vasp.sh
文件夹 pt 中的文件INCAR 标准静态计算
KPOINTS
POTCAR
系统对应元素的赝势组合,这里为 Si 的赝势
登录 OpenBayes.com,在「公共教程」页面,选择「VASP 结合 Phonopy 计算硅的比热容」教程。
页面跳转后,点击右上角「克隆」,将该教程克隆至自己的容器中。
选择「NVIDIA GeForce RTX 4090」以及「vasp」镜像,OpenBayes 平台提供了 4 种计费方式,大家可以按照需求选择「按量付费」或「包日/周/月」,点击「继续执行」。可以使用文章开头的邀请链接,获得 RTX 4090 使用时长!
待系统分配好资源,当状态变为「运行中」后,点击「打开工作空间」。
首先打开「终端」,输入以下命令进入目录。
cd Cv_dft
上传准备好的硅赝势,本教程已将其他文件准备完毕。此处可以使用官网示例里的赝势 POTCAR 文件,将文件放到目录中。
输入以下命令安装 phonopy 环境。
conda install -c conda-forge phonopy
当模型运行到以下阶段,输入「y」同意安装。
输入以下命令运行脚本。
chmod 777 *.sh ./run.sh
查看文件 thermal_properties.pdf
来源:春蕾教育