Nature Methods | 告别“猜谜”式研究:CellNEST为细胞通讯分析带来前所未有的精准度与深度
在我们的身体内,一座由亿万细胞构成的生命之城正悄然运转。细胞之间通过一套精密的“秘密电报”系统,即细胞间通讯(Cell-Cell Communication, CCC),来协调行动,共同维系着我们的健康。然而,一旦这套通讯系统出现故障,比如信息错乱或出现恶意信
细胞 naturemethods cellnest meth 2025-06-10 02:28 4
在我们的身体内,一座由亿万细胞构成的生命之城正悄然运转。细胞之间通过一套精密的“秘密电报”系统,即细胞间通讯(Cell-Cell Communication, CCC),来协调行动,共同维系着我们的健康。然而,一旦这套通讯系统出现故障,比如信息错乱或出现恶意信
细胞 naturemethods cellnest meth 2025-06-10 02:28 4
DNA是生命的蓝图,承载着所有遗传信息。但真正让生命“活”起来、执行指令的,是DNA转录出来的RNA。然而,这些RNA分子并非一劳永逸,它们从诞生到消亡,会在细胞内上演一场场精密的“分子舞步”:剪接 (splicing) 决定基因的最终面貌,翻译 (trans
rna naturemethods mrna m relic 2025-06-06 18:26 5
我们体内那些微小的细胞、复杂的组织,乃至宏大的器官,究竟是以怎样精妙的结构在运作?现代生物医学研究,正以前所未有的速度迈入三维(3D)成像时代,试图揭开生命更深层次的奥秘。然而,这场探索并非坦途。
naturemethods interpolai 光流魔法 2025-06-03 06:28 6
我们体内数万亿个细胞,它们如何各司其职,从最初的单一受精卵分化出肌肉、神经、免疫等千差万别的细胞类型?又或者,当疾病来袭,细胞内部的“指令”为何会出错?这一切的奥秘,都隐藏在一个极度复杂而精密的“指挥中心”——基因调控网络 (gene regulatory n
范式 单细胞 naturemethods 双剑 atac 2025-05-29 18:27 7
为解决 3D 基因组染色质拓扑结构调控因子研究受限,缺乏高效筛选技术的问题,研究人员开展了名为 Perturb-tracing 的技术研究。他们发现众多新调控因子,研究成果发表在《Nature Methods》上明确其多尺度作用及与已知机制关联,还揭示染色质压
解锁 naturemethods 基因组 tad 染色质 2025-05-25 10:51 6
我们的大脑,这个宇宙中最复杂的结构,其奥秘隐藏在数十亿神经元(neurons)之间,它们以毫秒级的高速电信号(Action Potentials, APs)进行着无休止的“对话”,构建出我们感知、思考和记忆的宏伟图景。长期以来,研究人员梦寐以求的,就是能“看清
千里眼 神经元 naturemethods methods 2025-05-24 18:27 7
你是否曾惊叹于荧光显微镜下那些被点亮的生命图景?通过各种荧光染料或蛋白,我们得以窥见细胞的结构、蛋白的位置,仿佛给生命穿上了五彩的外衣。荧光显微镜无疑是现代生命科学的基石。
指纹 显微镜 解密 naturemethods 振动显微镜 2025-05-21 18:28 5
能否拥有一个微缩版的器官,让细胞在其中像真实组织一样相互交流、构建复杂的三维结构,并让我们随时“深入”其中,以极高的精度观察和量化每一个细胞的形态、位置,甚至它们组成的“社区”结构?这就是类器官(Organoids)的魅力所在——它们是体外培养的3D细胞团,能
解锁 范式 孪生 数字孪生 naturemethods 2025-05-19 18:29 7
每个微小的细胞核里,都精巧地收纳着超过两米长的DNA螺旋。这惊人的“压缩艺术”并非随意的缠绕,而是高度精密的三维(3D)折叠,塑造了染色质(chromatin)的复杂结构。过去十年,借助染色体构象捕获技术(chromosome-conformation-cap
dna naturemethods 侦探 结构域 细胞核 2025-05-18 01:27 5
2025年5月5日,北京大学生命科学学院伊成器教授与中科院遗传与发育生物学研究所王秀杰研究员合作,在《Nature Methods》期刊上发表了题为“Mild and ultrafast GLORI enables absolute quantificatio
北京大学 naturemethods 测序 m6a修饰 痕量 2025-05-12 19:59 7
生命体的正常运转离不开健康的基因组(genome)。基因组就像我们身体的“蓝图”,指导着细胞的生长、发育和功能。然而,随着时间的推移,各种内源性(endogenous)和环境因素(environmental factors)都会对我们的基因组造成威胁,导致DN
dna dna损伤 naturemethods 基因表达 同 2025-03-28 19:29 12
在人类基因组计划完成的二十年后,研究人员发现:我们就像拿着字典却不懂语法的孩童,面对37万亿个细胞组成的"人体宇宙",依然读不懂生命真正的对话方式。单细胞测序技术曾让我们惊喜地发现,一滴血里藏着各种免疫细胞的"职业分工",一片癌组织中潜伏着上各种基因变异的"叛
细胞 社交 基因 naturemethods scnet 2025-03-19 05:27 11
在精准医疗时代,你的基因检测报告真的可靠吗?3月13日发表于《Nature Methods》的突破性研究“A systematic benchmark of Nanopore long-read RNA sequencing for transcript-le
癌症 治疗 靶点 naturemethods 测序 2025-03-17 06:26 12
3月12日《Nature Methods》杂志的报道“Spotiphy enables single-cell spatial whole transcriptomics across an entire section”揭晓了破局者:研究团队研发的Spoti
细胞 显微镜 naturemethods spotiphy 2025-03-13 19:29 13
与DNA不同,RNA不仅是基因表达的中介,还是细胞内多种复杂生物学过程的关键调控因子。近年来,RNA编辑作为RNA分子的一种天然修饰过程,引起了科学界广泛的兴趣。RNA编辑技术不仅能够精确调控基因表达,还为治疗各种遗传性疾病和复杂疾病提供了新的可能性。(2月4
临床 rna naturemethods 2025-02-06 18:27 15
细胞代谢的研究一直是一个重要且富有挑战性的领域。细胞内的代谢活动不仅是维持生命的基本过程,也是疾病发生和发展的关键因素之一。尤其是对于癌症、病毒感染等复杂疾病,细胞内代谢的重编程常常为疾病的治疗提供了新的线索。然而,由于细胞内代谢分子种类繁多且浓度低,传统的成
标记 成像 naturemethods 2025-01-19 17:28 16
随着显微技术的不断进步,生物影像分析(bioimage analysis)已成为揭示生命奥秘的重要工具。特别是超分辨率显微技术(super-resolution microscopy),突破了传统光学显微镜的衍射极限,为研究细胞内动态过程提供了前所未有的分辨率
影像 naturemethods nanopyx 2025-01-05 02:29 14
在探索生命奥秘的过程中,研究人员一直试图通过更高分辨率的显微技术窥探细胞内部的动态结构。然而,传统显微镜因光的衍射限制,无法清晰地分辨200纳米以下的细胞特征,这极大限制了人们对亚细胞结构的理解。近年来,超分辨率显微技术的出现,突破了这一瓶颈,成为细胞生物学研
纳米 naturemethods methods 2024-12-24 19:28 22
得益于独特的基因构成、出色的迷宫导航能力以及对奶酪的喜爱,小鼠长期以来一直是行为学和神经学研究的理想模型。近年来,随着虚拟现实(VR)技术的发展,小鼠进入了新的研究领域——沉浸式虚拟环境。康奈尔大学的研究人员最近开发了一种微型VR头显——MouseGoggle
神经 naturemethods mousegoggles 2024-12-24 18:00 18
得益于独特的基因构成、出色的迷宫导航能力以及对奶酪的喜爱,小鼠长期以来一直是行为学和神经学研究的理想模型。近年来,随着虚拟现实(VR)技术的发展,小鼠进入了新的研究领域——沉浸式虚拟环境。康奈尔大学的研究人员最近开发了一种微型VR头显——MouseGoggle
神经 naturemethods mousegoggles 2024-12-24 19:04 17