本文聚焦组氨酸代谢对肿瘤免疫的抑制作用,结合实验验证

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摘要:研究发现组氨酸代谢在肿瘤生物学中至关重要,与肿瘤进展、免疫调节和代谢重编程相关。在肝细胞癌(HCC)中,其具体机制不明。研究人员通过单细胞 RNA 测序评估 HCC 样本中组氨酸代谢相关基因的表达模式,进行体内外实验验证组氨酸处理对巨噬细胞和 T 细胞功能的影

发表杂志名称:Journal of Translational Medicine

中文标题:组氨酸代谢通过代谢重编程调节免疫微环境驱动肝癌进展

英文标题:Histidine metabolism drives liver cancer progression via immune microenvironment modulation through metabolic reprogramming

影响因子:6.1

发表日期:2025 年 3 月 4 日

研究概述

研究发现组氨酸代谢在肿瘤生物学中至关重要,与肿瘤进展、免疫调节和代谢重编程相关。在肝细胞癌(HCC)中,其具体机制不明。研究人员通过单细胞 RNA 测序评估 HCC 样本中组氨酸代谢相关基因的表达模式,进行体内外实验验证组氨酸处理对巨噬细胞和 T 细胞功能的影响,并利用 TCGA 数据库构建预后模型,鉴定关键基因 BUD23 。结果显示,高组氨酸代谢增加了实质细胞比例,减少了免疫和基质细胞浸润,巨噬细胞和 T 细胞抗肿瘤功能受损,BUD23 在高组氨酸代谢组中上调,与患者生存和免疫细胞浸润显著负相关。该研究表明组氨酸代谢促进肿瘤进展,BUD23有望作为肝癌预后和免疫反应预测的生物标志物,为肝癌治疗提供新靶点和理论支持。

图 1:单细胞测序分析揭示组氨酸代谢对肿瘤免疫微环境的全面调控影响:

作者下载 HCC 单细胞测序数据,经质量控制获得 32,984 个高质量细胞,计算细胞代谢评分并分组,聚类得到 41 个细胞簇,鉴定出六种主要细胞类型。分析发现高组氨酸代谢组中肝细胞更丰富,免疫和基质细胞较少;细胞间相互作用在高组氨酸代谢组中减少,免疫反应和免疫细胞激活相关通路富集减少,氧化磷酸化通路富集增加;对肝细胞重新聚类分析,发现高组氨酸代谢激活了脂质、葡萄糖和氨基酸代谢;通过多种算法评估,高组氨酸代谢组免疫细胞浸润较低。总之,图 1 表明组氨酸代谢调节细胞间相互作用,抑制免疫细胞浸润和免疫反应,重塑肿瘤微环境利于肿瘤生长

图 2:高组氨酸代谢抑制巨噬细胞的抗肿瘤活性:

作者对巨噬细胞重新聚类得到 16 个主要细胞簇,鉴定出多种巨噬细胞亚型。在高组氨酸代谢组中,具有抗肿瘤功能的巨噬细胞数量减少,无抗肿瘤功能或具有免疫抑制特性的巨噬细胞数量增加;富集分析显示组氨酸代谢上调巨噬细胞代谢相关基因表达,抑制其抗肿瘤活性;CellChat 分析表明巨噬细胞与其他细胞间的多条信号轴显著下调;GSVA 分析显示高组氨酸代谢组中巨噬细胞激活、趋化、免疫反应等通路下调;体外共培养实验表明高组氨酸浓度促使巨噬细胞向 M2 表型分化。综上所述,图 2 说明高组氨酸代谢显著削弱巨噬细胞的抗肿瘤功能,促进肿瘤进展

图 3:高组氨酸代谢抑制 T 细胞的抗肿瘤活性:

作者对 NK_T 细胞聚类分析,鉴定出 NK 细胞和 T 细胞,对 T 细胞重新聚类得到 12 个主要细胞簇,识别出多种 T 细胞亚型。高组氨酸代谢组中,T 细胞浸润减少,无抗肿瘤功能或免疫抑制性 T 细胞比例增加,具有抗肿瘤功能的 T 细胞比例下降;CellChat 分析发现高组氨酸代谢组中 T 细胞与其他细胞相互作用的关键信号轴下调;GSEA 和 GO 富集分析表明高组氨酸代谢抑制 T 细胞的激活、趋化、增殖等抗肿瘤功能;体外共培养实验显示高组氨酸浓度抑制 T 细胞分化和激活,促进其耗竭。由此可见,图 3 表明高组氨酸代谢通过调节 T 细胞分化、抑制激活和促进耗竭,改变肿瘤微环境,促进肿瘤进展

图 4:高组氨酸代谢通过调节肿瘤微环境促进小鼠肿瘤生长:

作者建立小鼠皮下肝癌模型和肝原位肿瘤模型,给予额外组氨酸构建高组氨酸代谢模型。在皮下肿瘤模型中,高组氨酸处理组肿瘤增殖更快,体积更大,肿瘤内 CD45 + 免疫细胞浸润减少,CD11b⁺F4/80⁺巨噬细胞和 CD11b⁺F4/80⁻细胞增加,M1 型巨噬细胞增多但 M2 型巨噬细胞减少,巨噬细胞抗原呈递功能受损,T 细胞浸润减少,激活和杀伤活性降低,耗竭增加;在肝原位肿瘤模型中,高组氨酸处理组肿瘤同样增殖更快,体积更大,CD8 + T 细胞浸润减少,T 细胞耗竭增加,巨噬细胞浸润减少且抗肿瘤功能受损。图 4 进一步验证了高组氨酸代谢通过调节肿瘤微环境、抑制免疫细胞浸润和功能来促进肿瘤进展

图 5:基于高组氨酸代谢构建肝细胞癌的预后模型:作者利用 TCGA 数据库分析组氨酸代谢相关基因与 HCC 患者临床生存的关系,构建 lasso 预后模型,确定 AOC1 和 BUD23 两个影响 HCC 预后的基因。BUD23 表达与肿瘤状态、分期和组织学分级相关,且与多种免疫细胞浸润负相关,AOC1 与免疫抑制细胞浸润正相关;干扰 AOC1 和 BUD23 基因后,Seahorse 实验显示 BUD23 干扰显著影响肝癌细胞代谢;体外共培养实验表明 BUD23 沉默增强 T 细胞功能,促进巨噬细胞向 M1 表型极化,AOC1 沉默无明显作用;构建的多变量 Cox 回归预后模型预测能力强,高风险组患者生存时间短、死亡率高。图 5 表明 BUD23 是潜在的免疫治疗疗效预测生物标志物和治疗靶点,与组氨酸代谢相关的基因改变影响患者预后

本研究通过单细胞测序、体内外实验和数据库挖掘,系统探究了组氨酸代谢在肝细胞癌中的作用。 发现高组氨酸代谢不仅重编程肿瘤细胞和基质细胞的代谢途径,还通过影响细胞间通讯抑制免疫细胞浸润和功能,进而促进肿瘤进展。研究还构建了与组氨酸代谢相关的预后模型,确定 BUD23 基因与肝癌临床分期、预后和免疫细胞浸润密切相关,是潜在的预后标志物和治疗靶点。虽然本研究存在样本局限性、对代谢通路交互机制理解不足等问题,但为肝癌治疗,尤其是免疫治疗提供了新的潜在靶点和理论基础,未来需进一步探索组氨酸代谢的更多功能及其在其他癌症中的作用。

来源:写字楼里的健康

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