还有其他替代方案，但没有一个能像圣地亚哥的 SEARCH 那样显示冠状病毒亚型摘要：上周末，在接到圣地亚哥县的最后通知后，一支由顶尖科学家组成的团队装载了最后一批污水样本送检，标志着这项监测工作的终止。这项停止的决定是因全国范围内联邦公共卫生资金被收回所致。
上周末，在接到圣地亚哥县的最后通知后，一支由顶尖科学家组成的团队装载了最后一批污水样本送检，标志着这项监测工作的终止。这项停止的决定是因全国范围内联邦公共卫生资金被收回所致。
自 2021 年 2 月以来，名为 SEARCH（San Diego Epidemiology and Research for COVID Health） 的项目一直在运行，由加州大学圣地亚哥分校（UCSD）、斯克里普斯研究所（Scripps Research） 和 Rady 儿童医院的基因组项目合作开展，采用先进的技术分析圣地亚哥县内三个污水处理厂采集的样本，用于估算330万居民排出的病毒类型和数量。
该项目最初是为了检测新冠病毒，后来扩展到了猴痘（MPOX），并正在探索是否可以用相同的基因分析方法检测流感、肝炎、麻疹等病原体。
但就在本周一，由于圣地亚哥县公共卫生部门每年约 40 万美元的资助即将中止，该项目被迫停止。这笔资金的终止是由于联邦政府“政府效率办公室”削减了由美国疾病控制与预防中心（CDC）主导的“流行病学与实验室能力（ELC）”计划。尽管仍会有其他污水监测服务继续存在，但圣地亚哥县的这个项目能提供更详细的病毒种类信息，具有独特价值。
加州大学圣地亚哥分校的围产研究主任 Louise Laurent 博士 与斯克里普斯研究所的传染病基因组学负责人 Kristian Andersen 博士 周一表示，资金中断迫使 SEARCH 项目停止运行。
“我们还会再完成最后一批样本的检测，因为我们已经采购了试剂。”Laurent 表示，并指出实验室的每周样本供应也随之结束。Laurent 还表示，虽然项目成员早已预期资金会用尽，并认为新建的公共卫生实验室（预计 5 月在 Kearny Mesa 开张，耗资 9300 万美元）会将污水监测纳入常规项目，但没想到会突然叫停，没有过渡时间。
原计划是，SEARCH 项目会在 8 月底完成本年度合同，逐步将技术移交给县实验室，并进行对等比对，例如使用相同样本分别在两个实验室测试，确保数据结果一致。
“问题在于这一切太突然了，”Laurent 说。“有一天你突然被通知合同已经在一周前结束了，且没有任何过渡安排，就要求我们停下工作——这显然不是最有效的做法。”圣地亚哥县方面也认同这种说法，并在电邮声明中表示：
“理想情况下，县实验室应在 UCSD 项目仍在运行时启动自营项目，以便将两方数据进行校准。虽然即使没有过渡，我们仍能建设完整功能的实验室项目，但数据对比将更困难。”县卫生部门还表示，正在筹备将 UCSD 所采集的历史样本转交到新实验室保存。
Andersen 博士补充说，这并不意味着科研机构就完全退出支持：
“我们并不怪县政府，因为我们知道他们也不希望项目停掉。即使没有资金，我们仍愿意尽力协助县里完成系统建设。”“但要说清楚——这一切的根源是联邦政府下达的命令，是联邦资金削减造成的，而不是县政府的决定。”
在回应媒体提问时，县政府确认：
“现有的污水检测合同被暂停，原因是联邦削减公共卫生资金。”“我们仍计划将这项检测任务及相关操作程序转移到新实验室。”
此外，加州公共卫生部（CDPH）与 Wastewater SCAN（由斯坦福大学和亚特兰大的埃默里大学联合运行、由慈善基金支持的全国性污水检测项目）也会继续提供本地检测服务。Wastewater SCAN 没有关闭的迹象。
SEARCH 项目的独特之处在于其对病毒亚型的高分辨率检测能力。其他项目只能告诉社区“病毒总量是否上升”，而 SEARCH 能进一步告诉你是哪一种变异毒株在增加。
“这是理解病毒传播的关键，”Andersen 博士说。“因为不是所有变异株行为都一样。我们必须知道当前流行的毒株是哪一种，才能设计未来的疫苗，也才能判断哪些毒株会逃避单克隆抗体疗法，对无法接种疫苗或免疫力低下人群至关重要。”来源：鼠meme