摘要：关于日本人的根源，科学家们刚刚有了一个令人着迷的发现。通过分析来自日本各地的3200多人的完整基因组，研究人员发现，日本人口并不是像人们一直认为的那样，只有两个祖先群体，而是三个。

一项大规模的DNA研究刚刚改写了日本的祖先 —— 这可能有助于未来的医学。

关于日本人的根源，科学家们刚刚有了一个令人着迷的发现。通过分析来自日本各地的3200多人的完整基因组，研究人员发现，日本人口并不是像人们一直认为的那样，只有两个祖先群体，而是三个。

日本的遗传多样性

一项开创性的基因研究刚刚改写了我们对日本起源的认识，日本理研综合医学科学中心的科学家们发现了强有力的证据，证明今天的日本人口不是两个，而是三个古代群体的后裔 —— 这一发现在基因学领域引起了轰动。

多年来，人们一直认为日本的祖先主要来自于绳纹时代的狩猎采集者和来自东亚的稻农移民。但这项新研究增加了第三个参与者：Emishi，一个来自东北亚的不太知名的群体。这支持了一种日益流行的理论，即日本的根源比以前认为的更复杂、更多样

日本理化研究所的Chikashi Terao是这项研究的负责人，他说，日本人口的基因并不像大家想象的那样同质。“我们的分析显示，日本的亚人口结构非常精细，根据该国的地理位置进行了非常漂亮的分类。”

寻找线索

为了揭示这些隐藏的祖先线索，研究小组对日本七个地区（从北海道延伸到冲绳）的3200多人的完整DNA进行了测序。这是迄今为止对非欧洲人口进行的最大规模的研究之一，而且由于全基因组测序，它揭示了一个人的DNA的所有30亿个碱基对，它提供了比以前的方法更深入的研究。

它提供的信息大约是DNA微阵列方法的3000倍，到目前为止，DNA微阵列方法的应用更为广泛。Terao说：“全基因组测序让我们有机会看到更多的数据，这有助于我们发现更多有趣的东西。”

探索祖先联系和罕见的基因变异

为了进一步提高数据的有用性，并检查基因与某些疾病之间的潜在联系，他和他的合作者将获得的DNA信息与相关的临床数据结合起来，包括疾病诊断、测试结果以及医疗和家族史信息。他们将所有这些数据整理到一个名为日本全基因组/外显子组测序库百科全书（JEWEL）的数据库中。

Terao特别感兴趣的一个话题是对罕见基因变异的研究。他解释说：“我们推断，罕见的变异有时可以追溯到特定的祖先种群，这可能有助于揭示日本境内的精细迁徙模式。”

他们的预感被证明是正确的，这有助于揭示日本血统的地理分布。例如，绳纹祖先在冲绳南部亚热带海岸最为主要（在28.5%的样本中发现），而在西部最低（仅占13.4%的样本）。相比之下，生活在日本西部的人与汉族人有更大的遗传亲缘关系 —— Terao的团队认为，这可能与250年至794年间东亚移民的涌入有关，也反映在该地区全面采用中国式立法、语言和教育制度的历史中。

另一方面，Emishi族血统在日本东北部最为常见，往西部逐渐减少。

来自古人类DNA的见解

研究人员还检查了JEWEL从尼安德特人和丹尼索瓦人那里遗传的基因，这两个古人类群体与智人杂交。Terao说：“我们感兴趣的是，为什么古代基因组被整合并保存在现代人的DNA序列中。”他解释说，这些基因有时与某些特征或条件有关。

例如，其他研究人员已经证明，西藏人的EPAS1基因中含有丹尼索瓦人的DNA，这被认为有助于他们在高海拔环境中定居最近，科学家们发现，3号染色体上的一组尼安德特人遗传基因 —— 大约一半的南亚人都有这种特征 —— 与呼吸衰竭和新冠肺炎其他严重症状的高风险有关

Terao团队的分析揭示了今天日本人身上存在的44个古代DNA区域，其中大多数是东亚人独有的。其中包括一个丹尼索瓦人衍生的基因，位于NKX6-1基因内，已知与2型糖尿病有关，研究人员说，这可能会影响一个人对西马鲁肽的敏感性，这是一种用于治疗这种疾病的口服药物。他们还确定了11个尼安德特人衍生的与冠状动脉疾病、前列腺癌、类风湿性关节炎和其他四种疾病有关的基因片段。

个性化医疗的未来

日本理化研究所领导的研究人员还利用罕见基因变异的数据来揭示疾病的潜在原因。例如，他们发现一种名为PTPRD的基因变体具有“高度破坏性”的潜力，因为它可能与高血压、肾衰竭和心肌梗死有关，Terao实验室的资深科学家、该研究的第一作者刘晓西（音译）说。

此外，科学家们还注意到GJB2和ABCC2基因变异（也称为功能缺失变异）的显著发生率，这两个基因分别与听力损失和慢性肝病有关。

Terao说，梳理出基因、它们的变异之间的关系，以及这些影响特征（包括疾病易感性）之间的关系，有朝一日可能在帮助科学家开发个性化医疗方面发挥作用。

他说：“我们试图做的是发现和分类日本人特有的功能丧失基因变异，并了解为什么他们更有可能拥有一些特定的特征和疾病。”“我们希望将人口差异与基因差异联系起来。”

在未来，他希望扩展JEWEL，并在数据集中包括更多的DNA样本。长期以来，大规模的基因组研究都集中在分析欧洲人后裔的数据上。但Terao说，“将这项技术推广到亚洲人口非常重要，这样从长远来看，研究结果也会让我们受益。”

来源：知新了了一点号