摘要:概述SnapGene 8.1对“酶视图(Enzymes view)”进行了更新,以提供与其他表格视图一致的简化用户界面(UI),在文件导航和数据管理方面有诸多改进,将多文件操作扩展到任何打开的文件以及项目搜索结果,并新增了多种着色选项,以增强数据的可视化效果。
以下文章来源于SnapGene ,作者SnapGene
概述
SnapGene 8.1对“酶视图(Enzymes view)”进行了更新,以提供与其他表格视图一致的简化用户界面(UI),在文件导航和数据管理方面有诸多改进,将多文件操作扩展到任何打开的文件以及项目搜索结果,并新增了多种着色选项,以增强数据的可视化效果。
流线型的界面
在更新后的“酶视图”中,通过简化的可扩展行可轻松识别关键信息,该视图提供了增强的筛选选项和更直观的滚动操作。“二级结构视图(Secondary Structure view)”中的控件现悬浮于内容上方,结构列表和统计信息也更新优化。
改进的搜索结果与操作
增添色彩功能
一系列新的着色选项可让您可视化残基及其相关的化学和跨膜特性,定位侧边工具栏中的按钮,并在亮色和暗色模式间切换。
导航与数据管理
通过精简的文件和文件夹面板,您可以高效地浏览、注释和管理质粒。现在,该面板支持对所有打开的序列文件进行查看、批量注释和文件转换操作。使用“聚焦区域(Focus on Region)”功能可放大查看较长序列。
详细更新内容
• 增强的“酶视图”,采用灵活现代的精简用户界面和可扩展行
• 更新“二级结构”视图中的控件、结构列表和统计信息
• 通过侧边“项目和文件”面板,可轻松浏览和管理所有打开的文件。在支持打印的对话框中,新增对“全选”和“复制”菜单操作的支持
• 文件和文件夹面板选择与当前聚焦的文件标签页同步
• 新增选项,可选择在SnapGene启动时恢复标签页或重新开始
• 可批量注释、模拟、编辑和管理更多质粒及其他文件
• 通过将底部按钮和其他命令移至上下文菜单,精简文件和文件夹面板
• 改进标签页、搜索结果和文件夹面板的操作及上下文菜单选项的一致性
• 新增隐藏文件扩展名的选项
• 顶部栏中“入门(Get Started)”按钮替换为“主页(Home)”按钮
• 将“缩放”控件重命名为“聚焦区域(Focus on Region)”,并在图谱和序列视图中,为长度大于或等于10Kb的序列恢复相应按钮
• 新增“聚焦区域(Focus on Region)”快捷键(Cmd/Ctrl+Alt+Z)
• 在文件和文件夹面板中,添加了一种功能:在点击并拖动项目之前按下Opt/Alt键,可复制被拖动的文件或文件夹
• 改进了文件搜索结果的筛选和排序功能
• 当在打开的项目中添加、重命名、删除或修改文件时,自动刷新搜索结果
• 基于选定的搜索结果,可批量注释、编辑或管理质粒及其他文件
• 改进了搜索结果的选择操作
• 为搜索结果添加了键盘操作支持,包括全选(Command/Ctrl+A)、起始位置、结束位置、向上箭头、向下箭头、向上翻页和向下翻页
• 在侧边工具栏中添加了使用彩色图标的选项
• 增加了按核苷酸以及嘌呤/嘧啶对核苷酸序列进行着色的选项
• 修正了多种作色方法,以正确处理简并残基
• 可通过顶部菜单栏中的偏好设置菜单,轻松在浅色模式和深色模式间切换
• 在标签栏上下文菜单和菜单按钮菜单中,添加了在按下Alt/Opt键时不保存直接关闭标签页的操作
• 现在可以使用“显示”按钮更改所选的酶组
• 增加了在Linux系统上使用电子邮件登录激活SnapGene的支持:
1、向通用特征数据库添加了特征并进行了更新
2、为脊椎动物细胞的基因组工程添加了Tol2系统
3、添加了FLP重组酶识别位点的FRT3变体
4、为诱导蛋白解离的LOVTRAP光遗传系统添加了LOV2和Zdk组件
5、添加了用于蛋白质纯化的Protein C标签
6、为LexA和GAL4特征添加了额外注释
7、修剪了小鼠免疫球蛋白k轻链信号肽的非前导D密码子和切割特征,使其与前导序列完全匹配并在切割点结束
• 添加了以下分子量标记:
1、安捷伦100-3000bp DNA梯
2、凯杰QX DNA大小标记100bp-2.5kb梯
3、西格玛奥德里齐DirectLoadTM Plus 1kb DNA梯
• 对各种消息对话框中的控件进行了现代化改进
• 对信息面板中的下拉菜单和复选框进行了现代化改进
• 改进了顶部工具栏的边距和间距
• 更新了“Blast所选DNA”命令,使其默认使用较新的core_nt数据库
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来源:科学软件网